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J-GLOBAL ID:201802239464662437   整理番号:18A0395039

アフラトキシン関連肝細胞癌の遺伝的特徴【Powered by NICT】

Genetic Features of Aflatoxin-Associated Hepatocellular Carcinoma
著者 (20件):
資料名:
巻: 153  号:ページ: 249-262.e2  発行年: 2017年 
JST資料番号: H0767A  ISSN: 0016-5085  CODEN: GASTAB  資料種別: 逐次刊行物 (A)
記事区分: 原著論文  発行国: オランダ (NLD)  言語: 英語 (EN)
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アフラトキシンへの食事曝露は肝細胞癌(HCC)の重要な危険因子である。しかし,アフラトキシン暴露と関連しないHCCと比較してアフラトキシン関連H CCのゲノム特性と変異はほとんど知られていない。はこの発癌物質と関連していなかっHCCからそれらを識別するために使用できることをアフラトキシン関連肝細胞癌の遺伝的特徴を検討した。HCC腫瘍組織を得て,アフラトキシン曝露(アフラトキシン汚染のためのテスト陽性食品試料の38.2%)の中国高リスク地域におけるQidong肝癌病院研究所で1990年から2016年にかけて採取した49患者から非腫瘍肝臓組織と一致した。体細胞変異体はGATKベストプラクティスパイプラインを用いて同定した。Sanger配列決定により全ゲノム配列決定と全エキソーム塩基配列決定から変異の一部を検証した。も1072HCCのゲノム,中国,米国,フランス,および日本からの5データセットから得られたを分析した。他の地域からの49種のアフラトキシン関連H CCと1072HCCの変異は非負行列因数分解によるウェルカム・トラストSanger研究所変異シグネチャフレームワークを用いて分析した。一般集団からのアフラトキシン関連肝細胞癌とH CC試料からの変異景観と変異シグネチャを比較した。アフラトキシン関連肝細胞癌の遺伝的特徴を同定し,これらを用いて他の地域からのデータセット中のアフラトキシン関連H CCを同定した。腫瘍試料はCD34とCD274(PD-L1)の微小血管密度とレベルを決定するために免疫組織化学によって分析した。アフラトキシン関連H CCはしばしばC>Aトランスバージョン,配列モチーフGCN,鎖バイアスを含んでいた。TP53で以前に報告された変異に加えて,接着G蛋白質共役受容体B1遺伝子(ADGRB1)における高頻度変異,腫瘍組織の毛細血管密度と関連していたを発見した。アフラトキシン関連HCC組織は高レベルの潜在的変異関連抗原,およびPD-L1を発現する多くの浸潤リンパ球と腫瘍細胞を含み,アフラトキシンに関連しないHCCと比較した。中国からHCCのうち,9.8%はアフラトキシン関連遺伝的特徴を含んでいたが,他の領域からのHCCの0.4%~ 3.5%がこれらの遺伝的特徴を含んでいた。アフラトキシン曝露に関連したHCCの特異的な遺伝的および突然変異の特徴,ADGRB1の変異を含む,一般集団からHCCと比較して同定した。はこれらの突然変異に関連したHCC組織におけるPD-L1の増加した血管新生と発現。これらの知見は,アフラトキシン暴露に起因するHCC患者を同定し,治療法を選択するために使用されるかもしれない。Copyright 2018 Elsevier B.V., Amsterdam. All rights reserved. Translated from English into Japanese by JST.【Powered by NICT】
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分類 (2件):
分類
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消化器の腫よう  ,  発癌機序・因子 
タイトルに関連する用語 (3件):
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