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J-GLOBAL ID：201802240096823636   整理番号：18A0965638

バラ科の黒星病病原菌Venturia inaequalisとV.pirinaの予測されたセクレトームの比較分析は,拡大されたエフェクターファミリーと宿主域の推定決定因子を明らかにする【JST・京大機械翻訳】

Comparative analysis of the predicted secretomes of Rosaceae scab pathogens Venturia inaequalis and V. pirina reveals expanded effector families and putative determinants of host range

著者 (20件)： Deng Cecilia H. (The New Zealand Institute for Plant & Food Research Limited (PFR), Auckland, New Zealand) ,  Plummer Kim M. (Animal, Plant & Soil Sciences Department, AgriBio Centre for AgriBioscience, La Trobe University, Melbourne, Australia) ,  Plummer Kim M. (Plant Biosecurity Cooperative Research Centre, Bruce, Australia) ,  Jones Darcy A. B. (Animal, Plant & Soil Sciences Department, AgriBio Centre for AgriBioscience, La Trobe University, Melbourne, Australia) ,  Jones Darcy A. B. (Present Address: The Centre for Crop and Disease Management, Curtin University, Bentley, Australia) ,  Mesarich Carl H. (The New Zealand Institute for Plant & Food Research Limited (PFR), Auckland, New Zealand) ,  Mesarich Carl H. (The School of Biological Sciences, University of Auckland, Auckland, New Zealand) ,  Mesarich Carl H. (Present Address: Institute of Agriculture & Environment, Massey University, Palmerston North, New Zealand) ,  Shiller Jason (Animal, Plant & Soil Sciences Department, AgriBio Centre for AgriBioscience, La Trobe University, Melbourne, Australia) ,  Shiller Jason (Present Address: INRA-Angers, Beaucouze, Cedex, France) ,  Taranto Adam P. (Animal, Plant & Soil Sciences Department, AgriBio Centre for AgriBioscience, La Trobe University, Melbourne, Australia) ,  Taranto Adam P. (Plant Sciences Division, Research School of Biology, The Australian National University, Canberra, Australia) ,  Robinson Andrew J. (Animal, Plant & Soil Sciences Department, AgriBio Centre for AgriBioscience, La Trobe University, Melbourne, Australia) ,  Robinson Andrew J. (Life Sciences Computation Centre, Victorian Life Sciences Computation Initiative (VLSCI), Victoria, Australia) ,  Kastner Patrick (Animal, Plant & Soil Sciences Department, AgriBio Centre for AgriBioscience, La Trobe University, Melbourne, Australia) ,  Hall Nathan E. (Animal, Plant & Soil Sciences Department, AgriBio Centre for AgriBioscience, La Trobe University, Melbourne, Australia) ,  Hall Nathan E. (Life Sciences Computation Centre, Victorian Life Sciences Computation Initiative (VLSCI), Victoria, Australia) ,  Templeton Matthew D. (The New Zealand Institute for Plant & Food Research Limited (PFR), Auckland, New Zealand) ,  Templeton Matthew D. (The School of Biological Sciences, University of Auckland, Auckland, New Zealand) ,  Bowen Joanna K. (The New Zealand Institute for Plant & Food Research Limited (PFR), Auckland, New Zealand)
資料名： BMC Genomics (Web)  (BMC Genomics (Web))
巻： 18  号： 1  ページ： 339  発行年： 2017年 
JST資料番号： U7048A  ISSN： 1471-2164  資料種別： 逐次刊行物 (A)
記事区分： 原著論文  発行国： イギリス (GBR)  言語： 英語 (EN)

抄録/ポイント： 【背景】Venturia属に属するFungal植物病原体は,Rosaceae(バラ科)のメンバーのscab病の損傷を引き起こす。経済的影響に関して,これらの最も重要なものは,ヨーロッパの西洋ナシの病原体であるリンゴとV.pirinaを感染させるV.inaequalisである。Venturia菌類が植物細胞を貫通することなく亜クチクラ空間にコロニーを形成することから,宿主範囲の病原性と決定に寄与するエフェクタがこの植物-病原体界面に分泌されると仮定した。従って,異なる宿主範囲を持つVenturiaの分離株の予測されたセクレトームを,病原性と病原性に関与する推定蛋白質を明らかにするために調べた。【結果】Venturia pirina(1つのヨーロッパナシのscab分離株)とVenturia inaequalis(3つのリンゴscab,および1つのビワのscab,分離株)のゲノムを配列決定し,各分離株の予測セクレトームを同定した。RNA-seqは,セクレトームの病原性と病原性成分を明らかにするために,リンゴ特異的V.inaequalis分離株Vi1(in vitroと感染リンゴ葉)で行われた。600個以上の小分泌蛋白質(候補エフェクタ)をコードする遺伝子を同定し,それらのほとんどはVenturiaに対して新規であり,推定エフェクタファミリーの拡大が属の特徴であることを示した。Leptosphaeria maculans AvrLm6とVerticillium spp. Ave1に類似した多数の遺伝子が同定された。宿主種決定に関与する推定蛋白質として,人種品種特異性に関与する同族耐性遺伝子を持つ病原性エフェクタの候補を同定した。候補エフェクタは,平均して,コア真核生物遺伝子と比較して,比較的低い遺伝子密度の領域にあり,反復(例えば転移可能な要素)に近い領域にあることが見出された。【結論】比較セクレトミクスは,ポーム果実を攻撃するVenturia真菌植物病原体からの候補エフェクタを明らかにした。宿主範囲の推定決定因子であるエフェクタを同定した。両方とも,レース栽培品種と宿主種特異性に関与する可能性がある。多くのエフェクタ候補が反復配列に近接しているので,これは観察されたエフェクタ遺伝子ファミリー拡大の可能な機構と転位と反復誘導点突然変異による多様化への経路を指摘する可能性がある。Copyright 2018 The Author(s). All rights reserved. Translated from English into Japanese by JST.【JST・京大機械翻訳】

シソーラス用語： クチクラ ,  栽培品種 ,  病原体 ,  *宿主域 ,  種差 ,  反復配列 ,  *エフェクタ ,  植物細胞 ,  ゲノム ,  病原性 ,  コロニー ,  *予測 ,  点突然変異 ,  ヨーロッパ ,  感染

著者キーワード (8件)： Venturia inaequalis ,  Venturia Pirina ,  リンゴ ,  Malus X domestica ,  ヨーロッパのナシ ,  Pyrus communis ,  セクレトーム ,  エフェクター

分類 (2件)： 微生物感染の生理と病原性  (EG03053T) ,  菌類による植物病害  (FC04052Y)

引用文献 (187件)：

• Cell; Host-microbe interactions: shaping the evolution of the plant immune response; ST Chisholm, G Coaker, B Day, BJ Staskawicz; 124; 2006; 803-14; 10.1016/j.cell.2006.02.008; CR1;
• Nature; The plant immune system; JD Jones, JL Dangl; 444; 2006; 323-9; 10.1038/nature05286; CR2;
• Trends Plant Sci; A molecular evolutionary concept connecting nonhost resistance, pathogen host range, and pathogen speciation; P Schulze-Lefert, R Panstruga; 16; 2011; 117-25; 10.1016/j.tplants.2011.01.001; CR3;
• Annu Rev Phytopathol; Fungal effector proteins; I Stergiopoulos, P Wit; 47; 2009; 233-63; 10.1146/annurev.phyto.112408.132637; CR4;
• Fungal Divers; A molecular, morphological and ecological re-appraisal of Venturiales - a new order of Dothideomycetes; Y Zhang, PW Crous, CL Schoch, AH Bahkali, LD Guo, KD Hyde; 51; 2011; 249-77; 10.1007/s13225-011-0141-x; CR5;

タイトルに関連する用語 (13件)： バラ科 ,  黒星病 ,  病原菌 ,  Venturia ,  予測 ,  セクレトーム ,  比較分析 ,  拡大 ,  エフェクター ,  ファミリー ,  宿主域 ,  推定 ,  決定因子