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J-GLOBAL ID：201802240172554121   整理番号：18A1740031

乾燥処理下の2つのナシ品種のトランスクリプトーム差次的発現遺伝子解析【JST・京大機械翻訳】

Analysis of differentially expressed genes in transcriptomes of two pear genotypes under drought stress

著者 (6件)： Wang Hua (安徽農業大学 果樹学重点実験室,安徽 合肥,230036) ,  Wang Wangwei (安徽農業大学 果樹学重点実験室,安徽 合肥,230036) ,  Liu Chunyi (安徽農業大学 果樹学重点実験室,安徽 合肥,230036) ,  Wang Qiaoqiao (安徽農業大学 果樹学重点実験室,安徽 合肥,230036) ,  Zhu Liwu (安徽農業大学 果樹学重点実験室,安徽 合肥,230036) ,  Xu Xiaoniu (安徽農業大学 林学与園林学院,安徽 合肥,230036)
資料名： Huanan Nongye Daxue Xuebao  (Huanan Nongye Daxue Xuebao)
巻： 39  号： 4  ページ： 61-67  発行年： 2018年 
JST資料番号： C2693A  ISSN： 1001-411X  資料種別： 逐次刊行物 (A)
記事区分： 原著論文  発行国： 中国 (CHN)  言語： 中国語 (ZH)

抄録/ポイント： 【目的】研究は,ナシの耐干性のキー遺伝子の基礎としてのトランスクリプトームデータの基礎を採り,ナシの耐干性品種を育成するための理論的基礎を提供した。【方法】Pyrusbretschneideri’Xuehuali’×P.pyrifolia’Shinsseiki’と黄金梨P.pyrifolia’Niitaka’×P.pyrifolia’Nijisseiki’の葉を,IlluminaHiSeqTM2000の高スループットトランスクリプトーム配列分析のために分析した。遺伝子オントロジー(GO)と京都遺伝子及びゲノム百科全書(KEGG)データベースを用いて、2つのナシ品種の中の差次的発現遺伝子(DEGs)を分析した。[結果]2つのナシ品種間で、正常な灌水と乾燥処理下で、それぞれ4377と3841のDEGsを発見し、そのうち、乾燥処理のみのDEGsは1340個であった。これらのDEGsはGOデータベースの3つの本体の生物過程、分子機能と細胞成分中に豊富に集まる数量はそれぞれ1387、922と1253であり、植物の耐干性に関連する代謝過程、ストレス反応と生物膜などの項目はそれぞれ349、349と349に濃縮した。139と151のDEGs。乾燥処理下の1340個のDEGsは102個のKEGG代謝経路に比較され、そのうち、植物内因性ホルモンと関連する代謝経路は3個ある。1340のDEGsを転写因子の37個に注釈し、17個の転写因子ファミリーに分布し、そのうちエチレン応答転写因子(ERF)ファミリーが持つDEGsが最も多く、11個であった。【結語】本研究は,ナシの耐干性に関連する内因性ホルモン代謝遺伝子および転写因子が,乾燥ストレス下の2つのナシ品種における差次的発現であり,それは,2つの品種の耐干性と密接な関係があり,次のナシの干ばつ耐性の分子機構の研究のための基礎を築いた。Data from Wanfang. Translated by JST.【JST・京大機械翻訳】

シソーラス用語： 耐干性 ,  *品種 ,  *トランスクリプトーム ,  ゲノム ,  *遺伝子 ,  データベース ,  生物膜 ,  転写因子 ,  ホルモン ,  代謝 ,  代謝経路
準シソーラス用語： 分子機構 ,  乾燥ストレス ,  内因性 ,  *差次的遺伝子発現 , 【Automatic Indexing@JST】

著者キーワード (6件)： pear ,  drought ,  transcriptome ,  differentially expressed gene ,  metabolic pathway ,  transcription factor

分類 (3件)： 分子遺伝学一般  (EC02010J) ,  植物の生化学  (EH01050J) ,  果樹  (FC03042G)

タイトルに関連する用語 (6件)： 乾燥処理 ,  ナシ ,  品種 ,  トランスクリプトーム ,  差次的発現 ,  遺伝子解析