文献

J-GLOBAL ID：201802240530149588   整理番号：18A0786268

水鳥パルボウイルスにおける種跳躍の進化過程の分析【JST・京大機械翻訳】

Analysis of Evolutionary Processes of Species Jump in Waterfowl Parvovirus

著者 (11件)： Fan Wentao (College of Veterinary Medicine, Nanjing Agricultural University) ,  Sun Zhaoyu (College of Veterinary Medicine, Nanjing Agricultural University) ,  Sun Zhaoyu (Jiangsu Engineering Laboratory of Animal Immunology, Institute of Immunology and College of Veterinary Medicine, Nanjing Agricultural University) ,  Shen Tongtong (College of Veterinary Medicine, Nanjing Agricultural University) ,  Xu Danning (Waterfowl Healthy Breeding Engineering Research Center, Guangdong Higher Education Institutes) ,  Huang Kehe (College of Veterinary Medicine, Nanjing Agricultural University) ,  Zhou Jiyong (College of Veterinary Medicine, Nanjing Agricultural University) ,  Zhou Jiyong (Jiangsu Engineering Laboratory of Animal Immunology, Institute of Immunology and College of Veterinary Medicine, Nanjing Agricultural University) ,  Song Suquan (College of Veterinary Medicine, Nanjing Agricultural University) ,  Yan Liping (College of Veterinary Medicine, Nanjing Agricultural University) ,  Yan Liping (Jiangsu Engineering Laboratory of Animal Immunology, Institute of Immunology and College of Veterinary Medicine, Nanjing Agricultural University)
資料名： Frontiers in Microbiology (Web)  (Frontiers in Microbiology (Web))
巻： 8  ページ： 421  発行年： 2017年 
JST資料番号： U7080A  ISSN： 1664-302X  資料種別： 逐次刊行物 (A)
記事区分： 原著論文  発行国： スイス (CHE)  言語： 英語 (EN)

抄録/ポイント： 水鳥パルボウイルスは,それらの抗原特性と宿主嗜好性に従って,ガチョウパルボウイルス(GPV)とMuscovyアヒルパルボウイルス(MDPV)に分類される。GPVの新しい変種として同定された新しいアヒルパルボウイルス(NDPV)は,現在,アヒルに感染しており,従ってかなりの経済的損失を引き起こしている。本研究では,NDPVの宿主シフトに関する進化過程を調べるために,出現パルボウイルスカプシド遺伝子の分子進化と集団動態を解析した。2つの重要なアミノ酸変化(Asn-489とAsn-650)がNDPVで同定され,NDPVの宿主シフトの原因となる可能性がある。系統発生分析は,現在循環しているNDPVがGPV系統に由来することを示した。Bayesマルコフ連鎖モンテカルロツリーは,NDPVが約20年前にGPVから発散したことを示した。進化速度解析は,GPVが7.674×10~4置換/サイト/年で進化し,MDPVのデータは5.237×10~4置換/サイト/年であるが,NDPVブランチの置換率は2.25×10~3置換/サイト/年であることを示した。一方,ウイルス個体群動態解析は,NDPVを含むGPV主要クレードが1.717年-1の速度で指数関数的に成長することを明らかにした。選択圧力分析は,ほとんどのサイトが強い浄化選択を受けていることを示し,NDPVでは積極的に選択されたサイトは見られなかった。水鳥パルボウイルスにおけるユニークな免疫エピトープも推定され,これはアヒルにおけるNDPVに対する抗体結合部位の予測に役立つ可能性がある。Copyright 2018 The Author(s). All rights reserved. Translated from English into Japanese by JST.【JST・京大機械翻訳】

シソーラス用語： 分子進化 ,  遺伝子 ,  嗜好性 ,  ポピュレーションダイナミックス ,  アヒル ,  系統発生 ,  Markov連鎖 ,  *水鳥 ,  疫学 ,  *パルボウイルス ,  *ウイルス
準シソーラス用語： クレード ,  系統解析 ,  *進化過程 , 【Automatic Indexing@JST】

著者キーワード (6件)： 種の跳躍 ,  水鳥パルボウイルス ,  系統発生 ,  疫学 ,  進化 ,  ベイズ推論

分類 (2件)： ウイルスの生化学  (EG04030F) ,  進化論一般  (EC03010Q)

物質索引 (1件)： MDPV

タイトルに関連する用語 (6件)： 水鳥 ,  パルボウイルス ,  種 ,  跳躍 ,  進化過程 ,  分析