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J-GLOBAL ID：201802240569365576   整理番号：18A1805177

サンゴ:ヒトキノームデータの明確でカスタマイズ可能な可視化【JST・京大機械翻訳】

Coral: Clear and Customizable Visualization of Human Kinome Data

著者 (12件)： Metz Kathleen S. (Curriculum in Genetics & Molecular Biology, University of North Carolina, Chapel Hill, NC 27599, USA) ,  Deoudes Erika M. (Thurston Arthritis Research Center, University of North Carolina, Chapel Hill, NC 27599, USA) ,  Berginski Matthew E. (Joint Department of Biomedical Engineering, University of North Carolina at Chapel Hill and North Carolina State University, Chapel Hill, NC 27514, USA) ,  Berginski Matthew E. (Department of Pharmacology, University of North Carolina, Chapel Hill, NC 27599, USA) ,  Jimenez-Ruiz Ivan (Curriculum in Bioinformatics & Computational Biology, University of North Carolina, Chapel Hill, NC 27599, USA) ,  Aksoy Bulent Arman (Department of Microbiology and Immunology, Medical University of South Carolina, Charleston, SC 29425, USA) ,  Hammerbacher Jeff (Department of Microbiology and Immunology, Medical University of South Carolina, Charleston, SC 29425, USA) ,  Gomez Shawn M. (Joint Department of Biomedical Engineering, University of North Carolina at Chapel Hill and North Carolina State University, Chapel Hill, NC 27514, USA) ,  Gomez Shawn M. (Department of Pharmacology, University of North Carolina, Chapel Hill, NC 27599, USA) ,  Phanstiel Douglas H. (Thurston Arthritis Research Center, University of North Carolina, Chapel Hill, NC 27599, USA) ,  Phanstiel Douglas H. (Department of Cell Biology & Physiology, University of North Carolina, Chapel Hill, NC 27599, USA) ,  Phanstiel Douglas H. (Lineberger Comprehensive Cancer Center, University of North Carolina, Chapel Hill, NC 27599, USA)
資料名： Cell Systems  (Cell Systems)
巻： 7  号： 3  ページ： 347-350.e1  発行年： 2018年 
JST資料番号： W3087A  ISSN： 2405-4712  資料種別： 逐次刊行物 (A)
記事区分： 短報  発行国： オランダ (NLD)  言語： 英語 (EN)

抄録/ポイント： 蛋白質キナーゼは真核生物における最大遺伝子ファミリーの1つを代表し,広範囲の細胞情報伝達過程及びヒト疾患において役割を果たす。人間のキノームスーパーファミリーの文脈におけるキナーゼデータを可視化するための現在のツールは,キノームツリーの低解像度画像へのノードの追加を通してデータを符号化することに限られている。著者らは,定量的および定性的データの両方を可視化するためのユーザに優しい対話型Webアプリケーションである口腔を提示する。以前のツールとは異なり,口腔は3つの特徴(ノード色,ノードサイズ,および分岐色)におけるデータを符号化することができ,三つのモードのキノーム可視化(半径方向および動的力ネットワーク)を可能にし,グラフィックス編集ソフトウェアを用いた精密化の必要なしに高分解能スケーラブルベクトルグラフィックスファイルを生成する。そのユーザに優しい,対話的で高度にカスタマイズ可能な設計により,口腔はヒトのキノームのハイスループット研究に広く適用されている。ソースコードとウェブ応用は,それぞれ,github.com/dphansti/CORALとphanstiel-lab.med.un.edu/Coralで利用可能である。Copyright 2018 Elsevier B.V., Amsterdam. All rights reserved. Translated from English into Japanese by JST.【JST・京大機械翻訳】

シソーラス用語： *カスタム化 ,  会話 ,  真核生物 ,  *可視化 ,  細胞情報伝達 ,  編集 ,  ソフトウェア ,  ネットワーク ,  *ヒト ,  精密化 ,  Web【情報システム】 ,  口腔 ,  タンパク質キナーゼ
準シソーラス用語： ハイスループット ,  キナーゼ , 【Automatic Indexing@JST】

著者キーワード (3件)： キナーゼ ,  キノーム ,  データ可視化

分類 (2件)： 分子・遺伝情報処理  (JE15040B) ,  酵素一般  (EB09010D)

タイトルに関連する用語 (3件)： サンゴ ,  カスタマイズ ,  可視化