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J-GLOBAL ID：201802240627410745   整理番号：18A0920995

四重試料採取は,緑色植物樹木における競合支援からのサポートの欠如を識別する【JST・京大機械翻訳】

Quartet Sampling distinguishes lack of support from conflicting support in the green plant tree of life

著者 (5件)： Pease James B. (Department of Biology, Wake Forest University, 455 Vine Street, Winston-Salem, North Carolina, 27101, USA) ,  Brown Joseph W. (Department of Ecology and Evolutionary Biology, University of Michigan, 830 North University, Ann Arbor, Michigan, 48109, USA) ,  Walker Joseph F. (Department of Ecology and Evolutionary Biology, University of Michigan, 830 North University, Ann Arbor, Michigan, 48109, USA) ,  Hinchliff Cody E. (Department of Biological Sciences, University of Idaho, 875 Perimeter Drive, MS 3051, Moscow, Idaho, 83844, USA) ,  Smith Stephen A. (Department of Ecology and Evolutionary Biology, University of Michigan, 830 North University, Ann Arbor, Michigan, 48109, USA)
資料名： American Journal of Botany  (American Journal of Botany)
巻： 105  号： 3  ページ： 385-403  発行年： 2018年 
JST資料番号： C0479A  ISSN： 0002-9122  資料種別： 逐次刊行物 (A)
記事区分： 原著論文  発行国： アメリカ合衆国 (USA)  言語： 英語 (EN)

抄録/ポイント： 【前提】: conflic to ほとんどed bransの間の特異性の欠如により,部分的に生命の緑色植物樹木内で評価することは困難であった。データセットが幅と深さの両方で拡大し続けているので,より効率的で有益な新しい支援策が必要である。【方法】著者らは,いくつかの系統発生学的およびゲノム解析的アプローチを合成する四分ベースの評価システムであるQuartartサンプリング(QS)法を記述する。QSは,大規模なデータセットにおける不一致を特性化し,アラインメントスパース性の問題を克服し,弱いサポートからの強いコンフリクトを区別する。種々のサイズのデータセットから推定したシミュレーションと最近の植物系統発生によりQSを試験した。重要な結果:QSスコアは,複製の増加と共に収束を示し,枝の深さにより強く影響されなかった。異なる系統発生からのQSサポートのパターンは,Ginkgoのサイクリックへの関係,単子葉植物に対するmagnolid,およびeudiに対するコケを含む,重要な不一致を定義する祖先分枝のコヒーレント理解をもたらした。ANA-グレード被子植物(Amborella,Nymphaeales,Austrobaileales),主要な単子葉群,コケ植物およびシダ科の関係は,あまり知られていないよりもむしろ進化史において非常に不一致である可能性がある。QSは,系統ゲノムデータにおける遺伝子移入による不一致も検出できる。結論:四重項サンプリングは,従来の測定よりも分岐サポートに関するより包括的で特異的な情報を提供する系統発生試験の効率的な合成である。QS法は,複雑な進化史を再構成するとき,特にANAグレード,単子葉植物および非維管束植物を取り囲む場合に,不一致試験を組み込んだ系統ゲノム研究が保証されるという証拠を裏付けている。Copyright 2018 Wiley Publishing Japan K.K. All Rights reserved. Translated from English into Japanese by JST.【JST・京大機械翻訳】

シソーラス用語： コヒーレンス ,  キャラクタリゼーション ,  四重項 ,  再構成 ,  被子植物 ,  *系統発生 ,  遺伝子導入 ,  アラインメント ,  単子葉植物
準シソーラス用語： 維管束植物 ,  進化史 ,  スパース性 ,  ゲノミクス ,  系統学 ,  特異性 , 【Automatic Indexing@JST】

著者キーワード (9件)： ブートストラップ ,  分岐支援 ,  不一致 ,  遺伝子移入 ,  尤度 ,  系統ソーティング ,  系統学 ,  系統ゲノミクス ,  粒子状植物

分類 (2件)： 植物分類学  (EH01030N) ,  進化論一般  (EC03010Q)

タイトルに関連する用語 (7件)： 試料採取 ,  緑色植物 ,  樹木 ,  競合 ,  支援 ,  欠如 ,  識別