結腸直腸癌の4段階に関与する遺伝子の同定:遺伝子発現プロファイリング【JST・京大機械翻訳】

Shi Guiling; Wang Yijia; Zhang Chunze; Zhao Zhenying; Zhao Zhenying; Sun Xiuying; Zhang Shiwu; Fan Jinling; Zhou Cunxia; Zhang Jihong; Zhang Huijuan; Liu Jun

文献

J-GLOBAL ID：201802240988580826 整理番号：18A1299314

結腸直腸癌の4段階に関与する遺伝子の同定:遺伝子発現プロファイリング【JST・京大機械翻訳】

Identification of genes involved in the four stages of colorectal cancer: Gene expression profiling

出版者サイト複写サービスで全文入手 {{ this.onShowCLink("http://jdream3.com/copy/?sid=JGLOBAL&noSystem=1&documentNoArray=18A1299314&COPY=1") }}
高度な検索・分析はJDreamⅢで {{ this.onShowJLink("http://jdream3.com/lp/jglobal/index.html?docNo=18A1299314&from=J-GLOBAL&jstjournalNo=T0429A") }}

著者 (12件)： , , , , , , , , , , ,
資料名：
巻： 37 ページ： 39-47 発行年： 2018年
JST資料番号： T0429A ISSN： 0890-8508 資料種別：逐次刊行物 (A)
記事区分：原著論文発行国：オランダ (NLD) 言語：英語 (EN)

結腸直腸癌(CRC)は,高い罹患率と死亡率を有する一般的癌である。しかしながら,その分子機構は明確ではなく,CRC段階に関連する遺伝子ではない。CRCおよび健康な結腸直腸組織における遺伝子発現データを,遺伝子発現全バスから得た。対照とCRC(ステージI,II,III,IV)の間の差次的に発現した遺伝子(DEG)を同定するために,4つのDEGセットを得るために,ライマパッケージを用いた。VennPlexを用いて,全てのDEGと交差DEGを見出した。交差DEG間のすべてのDEGと蛋白質-蛋白質相互作用(PPIs)の間の機能的相互作用を,それぞれ,ReactomeFIVitzとSTRINGを用いて分析し,ネットワークを可視化した。既知のCRC関連遺伝子は,比較Toxicoゲノミクスデータベースからダウンロードされ,PPIネットワークにマッピングされた。全体として,対照とCRCステージI,II,IIIとIVの間に,それぞれ851,760,729と878のDEGが見つかった。まとめると,1235のDEGが見出され,128の上方制御された交差DEG,365の下方制御された交差DEG,および0の逆制御されたDEGが見られた。すべてのDEGの機能的相互作用ネットワークと交差DEGのPPIネットワークを構築し,その中で,CDC20,PTTG1,およびMAD2L1はBUB1Bと相互作用した。UGT2B17はADH1Bと相互作用した;MCM7はMCM2と相互作用した。BUB1B,ADH1BおよびMCM2は,CRC関連遺伝子であることが知られている。段階I,II,III,およびIV CRCにおけるCDC20,PTTG1,MAD2L1,UGT2B17,およびMCM7の徐々に上方制御された発現を,定量的PCRを用いて確認した。さらに,細胞周期,DNA複製,およびp53シグナル伝達に関する経路に富む上方制御された交差DEGがあった。Cdc20,PTTG1,MAD2L1,UGT2B17,およびMCM7はCRC関連遺伝子である可能性がある。Copyright 2018 Elsevier B.V., Amsterdam. All rights reserved. Translated from English into Japanese by JST.【JST・京大機械翻訳】

, , , , , , , , , ,
, , , 【Automatic Indexing@JST】

著者キーワード (5件)： , , , ,

消化器の腫よう , 分子・遺伝情報処理 , 遺伝子発現 , 腫ようの診断

, , , ,

前のページに戻る