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J-GLOBAL ID：201802241015256516   整理番号：18A0806117

転写ネットワーク解析はAP2/ERFトランスジェニックイネの耐乾性機構を明らかにする【JST・京大機械翻訳】

Transcriptional Network Analysis Reveals Drought Resistance Mechanisms of AP2/ERF Transgenic Rice

著者 (11件)： Ahn Hongryul (Department of Computer Science and Engineering, Seoul National University) ,  Jung Inuk (Interdisciplinary Program in Bioinformatics, Seoul National University) ,  Shin Seon-Ju (Department of Biomedical Sciences, Sunmoon University) ,  Park Jinwoo (Department of Computer Science and Engineering, Seoul National University) ,  Rhee Sungmin (Department of Computer Science and Engineering, Seoul National University) ,  Kim Ju-Kon (Graduate School of International Agricultural Technology and Crop Biotechnology Institute/GreenBio Science and Technology, Seoul National University) ,  Jung Woosuk (Department of Applied Bioscience, Konkuk University) ,  Kwon Hawk-Bin (Department of Biomedical Sciences, Sunmoon University) ,  Kim Sun (Department of Computer Science and Engineering, Seoul National University) ,  Kim Sun (Interdisciplinary Program in Bioinformatics, Seoul National University) ,  Kim Sun (Bioinformatics Institute, Seoul National University)
資料名： Frontiers in Plant Science (Web)  (Frontiers in Plant Science (Web))
巻： 8  ページ： 1044  発行年： 2017年 
JST資料番号： U7094A  ISSN： 1664-462X  資料種別： 逐次刊行物 (A)
記事区分： 原著論文  発行国： スイス (CHE)  言語： 英語 (EN)

抄録/ポイント： 本研究は,イネ「Nipponbare」の遺伝子組み換え型が耐干性表現型をどのように得るかを分子レベルで調べるために設計された。多重オミクスシークエンシングデータを用いて,AP2/ERF転写因子(TF)ファミリーのメンバーであるOsERF71を過剰発現することにより耐干性表現型を得た野生型イネ(WT)とトランスジェニックバージョン(erf71)を比較し,TFネットワークとカスケードツリーを含む包括的バイオインフォマティクス解析パイプラインを開発した。解析の結果,ネットワークの供給源におけるOsERF71の存在は,erf71をWTよりも長く生存させる特異的な方法で全体的な遺伝子発現レベルを制御することが示された。時系列トランスクリプトームデータの解析により,erf71は翻訳,酸化応答及びDNA複製に関連する生存限界機構により多くのエネルギーを転換し,一方,光合成のようなエネルギー消費機構をさらに抑制することを示唆した。この仮説をさらに支持するために,著者らは生理学的条件下で正味光合成レベルを測定し,erf71における光合成の更なる抑制を確認した。要約すると,著者らの研究はトランスジェニックイネにおける転写修飾の包括的なスナップショットを提示し,これがどのように植物を誘導して耐干性表現型を獲得するかを示す。Copyright 2018 The Author(s). All rights reserved. Translated from English into Japanese by JST.【JST・京大機械翻訳】

シソーラス用語： 生理学 ,  *ネットワーク ,  表現型 ,  *耐干性 ,  DNA複製 ,  遺伝子発現 ,  光合成 ,  野生型 ,  エネルギー消費 ,  転写因子
準シソーラス用語： バイオインフォマティクス ,  過剰発現 ,  遺伝子組換 ,  *トランスジェニックイネ ,  *AP2因子 , 【Automatic Indexing@JST】

著者キーワード (6件)： イネ ,  干ばつストレス ,  耐乾性 ,  転写因子 ,  ネットワーク解析 ,  NGSデータ解析

分類 (1件)： 遺伝子発現  (EC02040Q)

タイトルに関連する用語 (5件)： 転写ネットワーク ,  解析 ,  AP2 ,  トランスジェニックイネ ,  耐乾性