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J-GLOBAL ID：201802241389484493   整理番号：18A0788313

ブラジルで分離された系統Cの最初のミミウイルスのゲノム特性化【JST・京大機械翻訳】

Genome Characterization of the First Mimiviruses of Lineage C Isolated in Brazil

著者 (10件)： Assis Felipe L. (Laboratorio de Virus, Departamento de Microbiologia, Instituto de Ciencias Biologicas, Universidade Federal de Minas Gerais) ,  Franco-Luiz Ana P. M. (Laboratorio de Virus, Departamento de Microbiologia, Instituto de Ciencias Biologicas, Universidade Federal de Minas Gerais) ,  Santos Raissa N. dos (Departamento de Microbiologia, Imunologia e Parasitologia, Instituto de Ciencias Basicas da Saude, Universidade Federal do Rio Grande do Sul) ,  Campos Fabricio S. (College of Veterinary Medicine and Agronomy, University of Brasilia) ,  Dornas Fabio P. (Laboratorio de Virus, Departamento de Microbiologia, Instituto de Ciencias Biologicas, Universidade Federal de Minas Gerais) ,  Borato Paulo V. M. (Laboratorio de Virus, Departamento de Microbiologia, Instituto de Ciencias Biologicas, Universidade Federal de Minas Gerais) ,  Franco Ana C. (Departamento de Microbiologia, Imunologia e Parasitologia, Instituto de Ciencias Basicas da Saude, Universidade Federal do Rio Grande do Sul) ,  Abrahao Jonatas S. (Laboratorio de Virus, Departamento de Microbiologia, Instituto de Ciencias Biologicas, Universidade Federal de Minas Gerais) ,  Colson Philippe (CNRS 7278, IRD 198, INSERM 1095, UM63, IHU - Mediterranee Infection, AP-HM, Unite de Recherche sur les Maladies Infectieuses et Tropicales Emergentes, Aix-Marseille Universite) ,  Scola Bernard La (CNRS 7278, IRD 198, INSERM 1095, UM63, IHU - Mediterranee Infection, AP-HM, Unite de Recherche sur les Maladies Infectieuses et Tropicales Emergentes, Aix-Marseille Universite)
資料名： Frontiers in Microbiology (Web)  (Frontiers in Microbiology (Web))
巻： 8  ページ： 2562  発行年： 2017年 
JST資料番号： U7080A  ISSN： 1664-302X  資料種別： 逐次刊行物 (A)
記事区分： 原著論文  発行国： スイス (CHE)  言語： 英語 (EN)

抄録/ポイント： 巨大DNAウイルスにより構成されるファミリーMimiviridaeは,2003年にAcanthamoeba polyphaga mimivirus(APMV)の分離以来ますます研究されている。本研究では,異なるブラジルの環境から分離された2つの新しい模倣ウイルスのゲノム解析について述べる。さらに,グループAからの模倣ウイルスの優位性が以前に報告されているブラジル(Br-mimiC)におけるグループCの模倣ウイルスのゲノム特性化について初めて報告する。Br-mimiC分離株,Mimivirus Gilmour(MVGM)およびMimivirus gold(MVGD)のゲノムは,約1.2Mbの二本鎖DNA分子から成り,各々は1,100個以上のオープンリーディングフレームをコードしている。ゲノム機能アノテーションは,7つのアミノアシルtRNAシンテターゼのセットのような,模倣ウイルス群Cの特徴遺伝子の存在を強調した。しかしながら,Br-mimiCによりコード化されたtRNAのセットは,他のグループC模倣ウイルスのそれらとは異なっていた。また,ゲノムsynニー分析においても差異が観察され,これはBr-mimiCゲノムの両四肢における逆位と遺伝子座転座の存在を示した。系統発生学的および系統的分析の両方が,以前の結果を裏付けて,新しいブラジルの分離株を模倣ウイルス群に分類することができない。最後に,現在のモーメントまで利用可能なすべての新しいゲノムを含む,属Mimivirusの更新汎ゲノム解析を行った。この最後の分析は,グループAの模倣ウイルスの間の蛋白質のオーソロググループのクラスタ数のわずかな増加を示し,グループBとCのミニウイルスからの配列の追加後に増加し,Br-mimiC分離株を含むグループCの最後の4つの模倣ウイルスの包含後にプラトー傾向を示した。将来の前向き研究は,模倣ウイルス間の遺伝的多様性を理解するのに役立つであろう。Copyright 2018 The Author(s). All rights reserved. Translated from English into Japanese by JST.【JST・京大機械翻訳】

シソーラス用語： DNAウイルス ,  *ゲノム ,  tRNA ,  アミノアシルtRNAシンテターゼ ,  符号化 ,  転座 ,  *ウイルス ,  *ブラジル連邦共和国 ,  クラスタ ,  アノテーション ,  タンパク質 ,  *キャラクタリゼーション
準シソーラス用語： オープンリーディングフレーム ,  *ウイルスゲノム ,  ゲノミクス , 【Automatic Indexing@JST】

著者キーワード (5件)： Mimiviridae ,  汎ゲノム ,  ゲノミクス ,  巨大ウイルス ,  ミミウイルス

分類 (1件)： 酵素一般  (EB09010D)

タイトルに関連する用語 (5件)： ブラジル ,  系統 ,  ミミウイルス ,  ゲノム ,  特性化