文献

J-GLOBAL ID：201802241416621353   整理番号：18A0166650

基質配列プロファイルからのプロテアーゼ特異性のブロックベースの特徴付け

Block-based characterization of protease specificity from substrate sequence profile

著者 (5件)： QI Enfeng (Shandong Univ., Jinan, CHN) ,  WANG Dongyu (Shandong Univ., Jinan, CHN) ,  GAO Bo (Shandong Univ., Jinan, CHN) ,  LI Yang (Shandong Univ., Jinan, CHN) ,  LI Guojun (Shandong Univ., Jinan, CHN)
資料名： BMC Bioinformatics (Web)  (BMC Bioinformatics (Web))
巻： 18  号： Oct  ページ： 18:438 (WEB ONLY)  発行年： 2017年10月 
JST資料番号： U7025A  ISSN： 1471-2105  資料種別： 逐次刊行物 (A)
記事区分： 原著論文  発行国： イギリス (GBR)  言語： 英語 (EN)

抄録/ポイント： 背景:プロテアーゼの作用機序は,基質特異性に基づいて広く研究されてきた。以前の研究では,単一アミノ酸部位のアミノ酸に焦点を当ててきたが,切断結合の周りのアミノ酸の組み合わせに関するものは稀であった。結果:本研究では,プロテアーゼの作用を調節し得るアミノ酸の潜在的な組合せを明らかにするための新規なブロックベースのアプローチを提案する。切断結合を中心とする8つのブロックのエントロピーを用いて,それらの特異性を比較するために61種のプロテアーゼに対して距離行列を作成した。定量的解析により,多数の顕著なブロックを発見した。それらのブロックの各々は切断結合に近い連続したアミノ酸からなり,基質配列の部位協調を直感的に特徴付けた。結論:このアプローチは,より多くの基質情報が利用可能になるにつれて,プロテアーゼと切断基質との間で橋渡しすることができる特定の基質配列の発見を助ける。(翻訳著者抄録)

シソーラス用語： *基質 ,  *アミノ酸配列 ,  *ペプチド結合ヒドロラーゼ ,  *基質特異性 ,  *作用機序 ,  性能分析 ,  *エントロピー ,  行列 ,  抽出 ,  *距離 ,  計算機アルゴリズム ,  フィルタリング ,  主成分分析 ,  判別分析 ,  トリプシン ,  メタロプロテイナーゼ ,  カスパーゼ ,  マトリックスメタロプロテイナーゼ ,  サーモリシン ,  キモトリプシン ,  セリンプロテイナーゼ ,  トロンビン ,  プラスミン ,  アミノペプチダーゼ ,  アミノ酸 ,  脂肪族アミン ,  チオール ,  脂肪族カルボン酸 ,  カルボアミド
準シソーラス用語： *酵素基質 ,  *プロテアーゼ ,  *作用機構 ,  特性解析 ,  距離行列 ,  協調性 ,  *情報エントロピー ,  データ抽出 ,  Euclid距離 ,  貪欲法 ,  データフィルタリング ,  主成分解析 ,  フィッシャー判別分析 ,  ニューロリシン ,  MMP ,  アスタシン ,  キモトリプシンA ,  キマーゼ ,  グルタミルペプチダーゼ

分類 (3件)： 分子構造  (EB03020Y) ,  酵素一般  (EB09010D) ,  分子・遺伝情報処理  (JE15040B)

物質索引 (1件)： メプリン

タイトルに関連する用語 (4件)： 基質 ,  プロファイル ,  プロテアーゼ ,  特異性