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J-GLOBAL ID：201802241486335808   整理番号：18A0127905

センシング応用のためのヒトパピローマウイルス16のE6ゲノム領域設計プローブ【Powered by NICT】

Designing probe from E6 genome region of human Papillomavirus 16 for sensing applications

著者 (5件)： Parmin Nor Azizah (Institute of Nano Electronic Engineering, Universiti Malaysia Perlis, 01000 Kangar, Perlis, Malaysia) ,  Hashim Uda (Institute of Nano Electronic Engineering, Universiti Malaysia Perlis, 01000 Kangar, Perlis, Malaysia) ,  Hashim Uda (School of Microelectronic Engineering, Universiti Malaysia Perlis, 01000 Kangar, Perlis, Malaysia) ,  Gopinath Subash C.B. (Institute of Nano Electronic Engineering, Universiti Malaysia Perlis, 01000 Kangar, Perlis, Malaysia) ,  Gopinath Subash C.B. (School of Bioprocess Engineering, Universiti Malaysia Perlis, 02600 Arau, Perlis, Malaysia)
資料名： International Journal of Biological Macromolecules  (International Journal of Biological Macromolecules)
巻： 107  号： PB  ページ： 1738-1746  発行年： 2018年 
JST資料番号： T0898A  ISSN： 0141-8130  CODEN： IJBMDR  資料種別： 逐次刊行物 (A)
記事区分： 原著論文  発行国： オランダ (NLD)  言語： 英語 (EN)

抄録/ポイント： ヒトパピローマウイルス(HPV)は100種類以上の最も一般的に報告されている間の素晴らしいであり,それらの間の遺伝子型16 18 31および45が高リスクH PVである。ここでは,センシング応用のための支配的なHPVタイプ16の検出のためのオリゴヌクレオチドプローブを設計した。HPVゲノムにおけるオープンリーディングフレームのE6領域内の保存されたアミノ酸配列は子宮頚癌を検出するためのオリゴヌクレオチドプローブを設計するための基礎として使用した。高リスクH PV由来のE6アミノ酸配列の分析は,異なる癌の原因となる類似性とコンセンサス領域の割合,子宮頚癌を含むをチェックするために行った。基本的な局所的配列検索ツール(BLAST)は,余分な統計的パラメータ,例えば,要望値(E値)とスコアビットを与えた。プローブ,GGG GTC GGT GGA CCG GTC GAT GTA’66.7%GC含量を設計した。オリゴヌクレオチドプローブは24merの長さで設計し,GC%は40と70の間にあり,融点(Tm)は50°C以上であった。プローブは,22と31mer間の許容可能な長さを必要とした。ここで同定された領域の選択をプローブとして用いることができ,特に子宮頚癌の臨床測定のためのバイオセンサーにおけるHPV検出技術のための意味を持っている。Copyright 2018 Elsevier B.V., Amsterdam. All rights reserved. Translated from English into Japanese by JST.【Powered by NICT】

シソーラス用語： ツリウム ,  アミノ酸配列 ,  子宮頚部腫瘍 ,  *プローブ ,  バイオセンサ ,  融点 ,  遺伝子型 ,  類似性 ,  検出法 ,  *ゲノム
準シソーラス用語： GC含量 ,  BLAST ,  オープンリーディングフレーム ,  オリゴヌクレオチドプローブ ,  *ヒトパピローマウイルス , 【Automatic Indexing@JST】

著者キーワード (6件)： ヒトパピローマウイルス ,  多重配列アラインメント ,  BLAST ,  プローブ ,  ゲノム ,  バイオセンサー

分類 (1件)： 女性生殖器と胎児の腫よう  (GS04000K)

タイトルに関連する用語 (6件)： センシング ,  応用 ,  ヒトパピローマウイルス ,  ゲノム ,  設計 ,  プローブ