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J-GLOBAL ID：201802241685408513   整理番号：18A0324264

NMRbox:生体分子NMR計算のための資源【Powered by NICT】

NMRbox: A Resource for Biomolecular NMR Computation

著者 (10件)： Maciejewski Mark W. (Department of Molecular Biology and Biophysics, UConn Health, Farmington, Connecticut) ,  Schuyler Adam D. (Department of Molecular Biology and Biophysics, UConn Health, Farmington, Connecticut) ,  Gryk Michael R. (Department of Molecular Biology and Biophysics, UConn Health, Farmington, Connecticut) ,  Moraru Ion I. (Department of Cell Biology, UConn Health, Farmington, Connecticut) ,  Romero Pedro R. (Department of Biochemistry, University of Wisconsin-Madison, Madison, Wisconsin) ,  Ulrich Eldon L. (Department of Biochemistry, University of Wisconsin-Madison, Madison, Wisconsin) ,  Eghbalnia Hamid R. (Department of Biochemistry, University of Wisconsin-Madison, Madison, Wisconsin) ,  Livny Miron (Computer Sciences Department, University of Wisconsin-Madison, Madison, Wisconsin) ,  Delaglio Frank (Institute for Bioscience and Biotechnology Research, National Institute of Standards and Technology and the University of Maryland, Rockville, Maryland) ,  Hoch Jeffrey C. (Department of Molecular Biology and Biophysics, UConn Health, Farmington, Connecticut)
資料名： Biophysical Journal  (Biophysical Journal)
巻： 112  号： 8  ページ： 1529-1534  発行年： 2017年 
JST資料番号： B0298A  ISSN： 0006-3495  CODEN： BIOJAU  資料種別： 逐次刊行物 (A)
記事区分： 原著論文  発行国： オランダ (NLD)  言語： 英語 (EN)

抄録/ポイント： 計算の進歩はNMRの生体分子応用における多くの最近の進歩を可能にした。NMRの応用の広い多様性のために,NMRデータの処理および解析のためのソフトウェアパッケージの数と多様性は非常に大きく,数十,ない場合百のソフトウェアパッケージのに依存する研究室であった。全てこれらのパッケージの発見,獲得,設置と維持は,厄介な仕事である。ソフトウェアパッケージの大部分は学術研究室を起源とするため,開発者大学院,資金停止,または研究者は他のプロジェクトになる場合に,本ソフトウェアの持続性は損なわれた。へのアクセスと生体分子NMRソフトウェアの使用を簡素化し,持続性を促進する,計算ワークフローの再現性を高めるために,著者らはNMRbox,NMRソフトウェアと計算のための共有資源を開発した。NMRboxは百のソフトウェアパッケージのpreconfigured包括的ソフトウェア環境を提供する仮想化採用し,ダウンロード可能な仮想マシンとしてまたは専用計算雲によって支持され,サービスとしてのプラットフォームとして利用可能であった。進行中の開発は正則化対照,注釈,ワークフローを保存し,BioMagResBankデータ析出を促進し強化するメタデータ収穫機,および計算解析のロバスト性と拡張性を強化するためのBayes推論のためのツールを含んでいる。生体分子NMRのための豊富で動的ソフトウェア環境の利用と保存を促進することに加えて,NMRboxは新しいクラスmetasoftwareパッケージの開発と展開を促進する。NMRboxである非営利利用者に自由に利用できる。Copyright 2018 Elsevier B.V., Amsterdam. All rights reserved. Translated from English into Japanese by JST.【Powered by NICT】

シソーラス用語： ロバスト性 ,  Bayes推定 ,  プログラムパッケージ ,  仮想機械システム ,  *計算 ,  ワークフロー ,  簡素化 ,  ソフトウェア ,  再現性 ,  メタデータ ,  *NMR【磁気共鳴】 ,  ダウンロード
準シソーラス用語： 仮想化 ,  *生体分子 ,  *生体分子NMR , 【Automatic Indexing@JST】

分類 (1件)： 分子・遺伝情報処理  (JE15040B)

タイトルに関連する用語 (3件)： 生体分子NMR ,  計算 ,  資源