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J-GLOBAL ID：201802242170133444   整理番号：18A0146432

高分子構造のコレクションの対話型比較と改善【Powered by NICT】

Interactive comparison and remediation of collections of macromolecular structures

著者 (9件)： Moriarty Nigel W. (Molecular Biophysics and Integrated Bioimaging, Lawrence Berkeley National Laboratory, Berkeley, CA, 94720, USA) ,  Liebschner Dorothee (Molecular Biophysics and Integrated Bioimaging, Lawrence Berkeley National Laboratory, Berkeley, CA, 94720, USA) ,  Klei Herbert E. (Molecular Biophysics and Integrated Bioimaging, Lawrence Berkeley National Laboratory, Berkeley, CA, 94720, USA) ,  Echols Nathaniel (Molecular Biophysics and Integrated Bioimaging, Lawrence Berkeley National Laboratory, Berkeley, CA, 94720, USA) ,  Afonine Pavel V. (Molecular Biophysics and Integrated Bioimaging, Lawrence Berkeley National Laboratory, Berkeley, CA, 94720, USA) ,  Headd Jeffrey J. (Molecular Biophysics and Integrated Bioimaging, Lawrence Berkeley National Laboratory, Berkeley, CA, 94720, USA) ,  Poon Billy K. (Molecular Biophysics and Integrated Bioimaging, Lawrence Berkeley National Laboratory, Berkeley, CA, 94720, USA) ,  Adams Paul D. (Molecular Biophysics and Integrated Bioimaging, Lawrence Berkeley National Laboratory, Berkeley, CA, 94720, USA) ,  Adams Paul D. (Department of Bioengineering, University of California at Berkeley, Berkeley, CA, 94720, USA)
資料名： Protein Science  (Protein Science)
巻： 27  号： 1  ページ： 182-194  発行年： 2018年 
JST資料番号： W2730A  ISSN： 0961-8368  資料種別： 逐次刊行物 (A)
記事区分： 原著論文  発行国： アメリカ合衆国 (USA)  言語： 英語 (EN)

抄録/ポイント： しばしば類似構造は全モデルを通してまたはモデル内の関連コピー間の局所的な差を明らかにするために,比較する必要がある。Phenix骨格(Adamsら,Acta Cryst2010;D66:213 221)内で記述した多重構造を比較し,密度マップにより支持されない差補正を可能にするプログラム。構造比較と呼ばれるこのプログラムは,非対称単位中に同じ蛋白質鎖の多重コピーをもつ構造物に使用されるということである,非結晶学的対称性(NCS)の結果としてできた。構造比較は多数の関連構造の比較を容易にするためにオオバン(Emsleyら,Acta Cryst2010;D66:486 501)とPyMOL(DeLano, PyMOL 0.99; 2002)と融合させるために設計した。構造の比較は,いくつかの評価基準を用いた蛋白質構造の収集,等価残基の回転異性体立体配座のようなを分析し,表形式で結果を示し,重畳蛋白質鎖と密度マップを可能にする一貫性,完全性と正当性のための迅速検査と編集(オオバンのツールによる)であった。Copyright 2018 Wiley Publishing Japan K.K. All Rights reserved. Translated from English into Japanese by JST.【Powered by NICT】

シソーラス用語： 立体配座 ,  非晶質 ,  評価基準 ,  非対称性 ,  *タンパク質 ,  多重化 ,  対称性 ,  編集 ,  完全性 ,  畳込み
準シソーラス用語： 迅速検査 ,  回転異性体 ,  蛋白質構造 ,  多重構造 ,  *重合体構造 , 【Automatic Indexing@JST】

著者キーワード (4件)： 巨大分子結晶学 ,  グラフィカルユーザインタフェイス ,  検定 ,  配位子

分類 (4件)： 分子構造  (EB03020Y) ,  分子・遺伝情報処理  (JE15040B) ,  データベースシステム  (JD03030U) ,  酵素一般  (EB09010D)

タイトルに関連する用語 (3件)： 高分子構造 ,  コレクション ,  対話型