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J-GLOBAL ID：201802242302272221   整理番号：18A0974759

流行性Burkittリンパ腫における統合マイクロRNAおよびmRNAディープシークエンシング発現プロファイリング【JST・京大機械翻訳】

Integrative microRNA and mRNA deep-sequencing expression profiling in endemic Burkitt lymphoma

著者 (9件)： Oduor Cliff I. (Center for Global Health Research, Kenya Medical Research Institute, Kisumu, Kenya) ,  Oduor Cliff I. (Department of Biomedical Sciences and Technology, Maseno University, Maseno, Kenya) ,  Kaymaz Yasin (Department of Bioinformatics & Integrative Biology, University of Massachusetts Medical School, Worcester, USA) ,  Chelimo Kiprotich (Department of Biomedical Sciences and Technology, Maseno University, Maseno, Kenya) ,  Otieno Juliana A. (Jaramogi Oginga Odinga Teaching and Referral Hospital, Ministry of Health, Kisumu, Kenya) ,  Ong’echa John Michael (Center for Global Health Research, Kenya Medical Research Institute, Kisumu, Kenya) ,  Moormann Ann M. (Department of Molecular Medicine, University of Massachusetts Medical School, Worcester, USA) ,  Bailey Jeffrey A. (Department of Bioinformatics & Integrative Biology, University of Massachusetts Medical School, Worcester, USA) ,  Bailey Jeffrey A. (Division of Transfusion Medicine, Department of Medicine, University of Massachusetts Medical School, Worcester, USA)
資料名： BMC Cancer (Web)  (BMC Cancer (Web))
巻： 17  号： 1  ページ： 761  発行年： 2017年 
JST資料番号： U7305A  ISSN： 1471-2407  資料種別： 逐次刊行物 (A)
記事区分： 原著論文  発行国： イギリス (GBR)  言語： 英語 (EN)

抄録/ポイント： Burkittリンパ腫(BL)はc-myc癌遺伝子の過剰発現により特徴付けられ,多くの症例はIGH/MYC転座の結果である。mycは精液イベントであるが,BLは遺伝的および後成的変化の複雑なアマルガムであり,コード化および非コード化転写物の両方の調節不全を引き起こす。新たな証拠は,miRNAを介したmRNA転写の異常な調節がリンパ腫形成における有意な因子である可能性を示唆する。しかしながら,これらのmiRNAの変化とそれらの推定mRNA標的との相関は,正常な胚中心(GC)B細胞と比較して広く研究されていない。より敏感で特異的なトランスクリプトームの深い配列決定を用いて,著者らは以前に公表された小さなmiRNAと一連のGC B細胞およびeBL腫瘍の長いmRNAを比較した。MiRWalk2.0を用いて,eBL発生に関連する調節ネットワークを理解するために重要であると思われる脱調節miRNAに対する検証された標的遺伝子を同定した。211の差次的に発現した(DE)遺伝子(79のアップレギュレーションと132のダウンレギュレーション)と49のDE miRNA(22のアップレギュレーションと27のダウンレギュレーション)を見出した。遺伝子セット濃縮分析は,MYC調節遺伝子のセットの濃縮を同定した。ネットワーク伝播に基づく方法と相関miRNA-mRNA発現分析は,miR-1795クラスタメンバーとそれらの標的遺伝子を含む調節異常miRNAを同定し,それはeBLリンパ腫形成に重要である多様な発癌性を有する。これらのすべての知見に対して,著者らは,eBL腫瘍細胞におけるDNA損傷に対する応答における重要な調節因子を表すATMおよびNLK遺伝子のダウンレギュレーションを観察した。これらの腫瘍サプレッサーは,eBLにおけるそれらの異常な発現を説明することができる複数の上方制御miRNA(miR-19b-3p,miR-26a-5p,miR-30b-5p,miR-92a-5pおよびmiR-27b-3p)によって標的化された。ATMとNLKのmiRNA仲介調節によるp53誘導と機能の複合喪失は,TFAP4のアップレギュレーションと共に,eBL発癌におけるヒトmiRNAの中心的役割である可能性がある。これは,IGH/MYC染色体転座を伴うeBL腫瘍細胞の生存を促進し,MYC誘導細胞周期進行を促進し,eBLリンパ腫形成を開始する。GC B細胞に対するeBLにおけるmiRNA-mRNA相互作用のこの特性化は,eBLにおけるmiRNA仲介転写調節に関する新しい洞察を提供し,それは新しい改善された治療戦略に対して潜在的に有用である。Copyright 2018 The Author(s). All rights reserved. Translated from English into Japanese by JST.【JST・京大機械翻訳】

シソーラス用語： ヒト ,  ダウンレギュレーション ,  転座 ,  癌遺伝子 ,  遺伝 ,  ネットワーク ,  トランスクリプトーム ,  *mRNA ,  p53タンパク質 ,  アップレギュレーション ,  DNA損傷 ,  相互作用 ,  発癌 ,  腫瘍細胞
準シソーラス用語： *マイクロRNA , 【Automatic Indexing@JST】

著者キーワード (5件)： 流行性Burkittリンパ腫 ,  miRNA ,  mRNA ,  RNAシークエンシング ,  リンパ腫形成

分類 (1件)： 遺伝子発現  (EC02040Q)

引用文献 (87件)：

• I A clinical syndrome Cancer; Malignant lymphoma in African children; D Burkitt, GT O’Conor; 14; 1961; 258-269; citation_id=CR1
• Br J Surg; A sarcoma involving the jaws in African children; D Burkitt; 46; 1958; 218-223; 10.1002/bjs.18004619704; citation_id=CR2
• J Clin Pathol; Epstein-Barr virus and Burkitt lymphoma; G Brady, GJ MacArthur, PJ Farrell; 60; 2007; 1397-1402; citation_id=CR3
• Epstein MA. Historical background; Burkitt’s lymphoma and Epstein-Barr virus. IARC Sci Publ. 1985:17-27.
• Moormann A, Skiles J, Otieno J, Buckle G, Vik T. Optimal management of endemic Burkitt lymphoma: a holistic approach mindful of limited resources. BLCTT. 2014;91

タイトルに関連する用語 (8件)： 流行 ,  Burkittリンパ腫 ,  統合 ,  マイクロRNA ,  mRNA ,  ディープシークエンシング ,  発現 ,  プロファイリング