文献

J-GLOBAL ID：201802242836846495   整理番号：18A0787239

ゲノム分解メタゲノムからの超乾燥アタカマ砂漠の塩クラストにおける微生物群集構造とシアノバクテリア個体群の持続性【JST・京大機械翻訳】

Microbial Community Structure and the Persistence of Cyanobacterial Populations in Salt Crusts of the Hyperarid Atacama Desert from Genome-Resolved Metagenomics

著者 (10件)： Finstad Kari M. (Department of Environmental Science, Policy, and Management, University of California, Berkeley, Berkeley) ,  Probst Alexander J. (Department of Earth and Planetary Sciences, University of California, Berkeley, Berkeley) ,  Thomas Brian C. (Department of Earth and Planetary Sciences, University of California, Berkeley, Berkeley) ,  Andersen Gary L. (Department of Environmental Science, Policy, and Management, University of California, Berkeley, Berkeley) ,  Andersen Gary L. (Ecology Department, Earth Sciences Division, Lawrence Berkeley National Laboratory, Berkeley) ,  Demergasso Cecilia (Centro de Biotecnologia, Universidad Catolica del Norte) ,  Echeverria Alex (Centro de Biotecnologia, Universidad Catolica del Norte) ,  Amundson Ronald G. (Department of Environmental Science, Policy, and Management, University of California, Berkeley, Berkeley) ,  Banfield Jillian F. (Department of Environmental Science, Policy, and Management, University of California, Berkeley, Berkeley) ,  Banfield Jillian F. (Department of Earth and Planetary Sciences, University of California, Berkeley, Berkeley)
資料名： Frontiers in Microbiology (Web)  (Frontiers in Microbiology (Web))
巻： 8  ページ： 1435  発行年： 2017年 
JST資料番号： U7080A  ISSN： 1664-302X  資料種別： 逐次刊行物 (A)
記事区分： 原著論文  発行国： スイス (CHE)  言語： 英語 (EN)

抄録/ポイント： 生物学を欠いていると考えられているが,最近の研究は,超乾燥Atacama砂漠における生命のためのオアシスとして塩堆積物を同定している。微生物種と重要な栄養源の空間パターンを調べるために,霧勾配に沿った3つのサイトから26の塩クラストをゲノム的に特性化した。コミュニティは,多数のHalobacteralesとBacteroidetesによって支配されており,いくつかの藻類と藍藻類の種によって支配されている。CRISPR遺伝子座分析は,すべてのサイトの間で単一の藍藻類集団の分布を示唆する。これは,多くの他のコミュニティメンバーの極端に高い試料特異性とは対照的である。最も高い水分サイトにのみ存在するのは,ゲノム的に特性化されたThermoplasmatales古細菌(MarineグループII)と6つのNanohalar古細菌であり,そのうちの1つは完全なゲノムによって代表される。高塩分環境から以前に報告されていないParcubacterium(OD1)およびSacariobacteria(TM7)は,低い豊度で見出された。コミュニティにおけるN_2固定経路の兆候は見られず,大気由来硝酸塩からの生物利用可能窒素の獲得を示唆した。細菌と古細菌の豊度パターンと光合成能力に基づくサイトによるサンプルクラスタは,海洋からの距離の増加とともに減少する。著者らは,沿岸霧強度によって制御された水分レベルが,コミュニティ・メンバシップの最も強いドライバーであると結論する。Copyright 2018 The Author(s). All rights reserved. Translated from English into Japanese by JST.【JST・京大機械翻訳】

シソーラス用語： 細菌 ,  堆積物 ,  古細菌 ,  *藍藻類 ,  塩分 ,  *個体群 ,  水分 ,  キャラクタリゼーション ,  硝酸塩 ,  *ゲノム ,  海洋 ,  窒素 ,  コミュニティ ,  *クラスト
準シソーラス用語： *微生物群集構造 , 【Automatic Indexing@JST】

著者キーワード (7件)： メタゲノム ,  アタカマ砂漠 ,  岩塩クラスト ,  超乾燥 ,  高塩分 ,  環境ゲノミクス ,  salar

分類 (5件)： 遺伝学研究法  (EC01020N) ,  遺伝子の構造と化学  (EC02020U) ,  プランクトン  (FH02050R) ,  生体防御と免疫系一般  (ED01010F) ,  微生物の生化学  (EG03020N)

タイトルに関連する用語 (10件)： ゲノム ,  分解 ,  メタゲノム ,  アタカマ砂漠 ,  塩 ,  クラスト ,  微生物群集構造 ,  シアノバクテリア ,  個体群 ,  持続性