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J-GLOBAL ID：201802243147472424   整理番号：18A0719962

好酸球性食道炎におけるmRNAパターンの分類のためのアルゴリズム:機械学習の統合【JST・京大機械翻訳】

An algorithm for the classification of mRNA patterns in eosinophilic esophagitis: Integration of machine learning

著者 (30件)： Sallis Benjamin F. (Department of Pediatrics, Division of Gastroenterology, Hepatology and Nutrition, Boston Children’s Hospital, Boston, Mass) ,  Sallis Benjamin F. (Department of Medicine, Harvard Medical School, Boston, Mass) ,  Erkert Lena (Department of Pediatrics, Division of Gastroenterology, Hepatology and Nutrition, Boston Children’s Hospital, Boston, Mass) ,  Monino-Romero Sherezade (Department of Pediatrics, Division of Gastroenterology, Hepatology and Nutrition, Boston Children’s Hospital, Boston, Mass) ,  Monino-Romero Sherezade (Department of Pediatrics and Adolescent Medicine, Medical University of Vienna, Vienna, Austria) ,  Acar Utkucan (Department of Pediatrics, Division of Gastroenterology, Hepatology and Nutrition, Boston Children’s Hospital, Boston, Mass) ,  Acar Utkucan (Department of Medicine, Harvard Medical School, Boston, Mass) ,  Wu Rina (Department of Pediatrics, Division of Gastroenterology, Hepatology and Nutrition, Boston Children’s Hospital, Boston, Mass) ,  Konnikova Liza (Department of Pediatrics, Division of Gastroenterology, Hepatology and Nutrition, Boston Children’s Hospital, Boston, Mass) ,  Konnikova Liza (Department of Medicine, Harvard Medical School, Boston, Mass) ,  Lexmond Willem S. (Department of Pediatrics, Division of Gastroenterology, Hepatology and Nutrition, Boston Children’s Hospital, Boston, Mass) ,  Lexmond Willem S. (Department of Medicine, Harvard Medical School, Boston, Mass) ,  Hamilton Matthew J. (Department of Medicine, Harvard Medical School, Boston, Mass) ,  Hamilton Matthew J. (Department of Pathology, Brigham and Women’s Hospital, Boston, Mass) ,  Hamilton Matthew J. (Division of Gastroenterology, Hepatology, and Endoscopy, Brigham and Women’s Hospital, Boston, Mass) ,  Dunn W. Augustine (Department of Pediatrics, Division of Gastroenterology, Hepatology and Nutrition, Boston Children’s Hospital, Boston, Mass) ,  Dunn W. Augustine (Department of Medicine, Harvard Medical School, Boston, Mass) ,  Szepfalusi Zsolt (Department of Pediatrics and Adolescent Medicine, Medical University of Vienna, Vienna, Austria) ,  Vanderhoof Jon A. (Department of Pediatrics, Division of Gastroenterology, Hepatology and Nutrition, Boston Children’s Hospital, Boston, Mass) ,  Snapper Scott B. (Department of Pediatrics, Division of Gastroenterology, Hepatology and Nutrition, Boston Children’s Hospital, Boston, Mass) ,  Snapper Scott B. (Department of Medicine, Harvard Medical School, Boston, Mass) ,  Turner Jerrold R. (Department of Pathology, Brigham and Women’s Hospital, Boston, Mass) ,  Turner Jerrold R. (Division of Gastroenterology, Hepatology, and Endoscopy, Brigham and Women’s Hospital, Boston, Mass) ,  Goldsmith Jeffrey D. (Department of Pathology, Boston Children’s Hospital, Boston, Mass) ,  Spencer Lisa A. (Department of Medicine, Harvard Medical School, Boston, Mass) ,  Spencer Lisa A. (Department of Medicine, Division of Allergy and Inflammation, Beth Israel Deaconess Medical Center, Boston, Mass) ,  Nurko Samuel (Department of Pediatrics, Division of Gastroenterology, Hepatology and Nutrition, Boston Children’s Hospital, Boston, Mass) ,  Nurko Samuel (Department of Medicine, Harvard Medical School, Boston, Mass) ,  Fiebiger Edda (Department of Pediatrics, Division of Gastroenterology, Hepatology and Nutrition, Boston Children’s Hospital, Boston, Mass) ,  Fiebiger Edda (Department of Medicine, Harvard Medical School, Boston, Mass)
資料名： Journal of Allergy and Clinical Immunology  (Journal of Allergy and Clinical Immunology)
巻： 141  号： 4  ページ： 1354-1364.e9  発行年： 2018年 
JST資料番号： A0182B  ISSN： 0091-6749  資料種別： 逐次刊行物 (A)
記事区分： 原著論文  発行国： オランダ (NLD)  言語： 英語 (EN)

抄録/ポイント： 好酸球性食道炎(EoE)の診断評価は,特に患者のアレルギー状態の評価に困難なままである。本研究では,EoEの評価を支援するための自動化医療アルゴリズムを確立することを試みた。機械学習技術を用いて,EoE,胃食道逆流症および対照の患者の生検からの食道mRNA転写パターンに基づいて,EoE,p(EoE)の診断確率スコアを確立した。訓練セットにおける次元縮小は,免疫組織化学によって確認された加重因子を確立した。加重因子分析に従って,p(EoE)をランダム森林分類によって決定した。精度を外部試験セットで試験し,予測力を明確な患者で評価した。食道IgE産生を,エプシロン生殖細胞(IGHE)転写物で定量し,組織アレルギーのためのIGHEスコアを確立するために,血清IgEとT_h2型mRNAプロファイルと相関させた。一次解析において,3クラス統計モデルは,炎症性EoEプロファイルの共通特性に基づいてp(EoE)スコアを生成した。p(EoE)≧25はEoEを高い精度(感度:90.9%,特異性:93.2%,曲線下面積:0.985)で同定し,明確な症例の診断を84.6%改善した。p(EoE)は治療に応じて変化した。EoE患者における二次分析ループは,食道アレルギー性炎症の増加を伴う患者副集団に対して≧37.5のIGHEスコアを定義した。機械学習展望からの知的データ解析の開発は,EoEにおける診断精度を改善し,患者ケアを改善するための刺激的機会を提供する。p(EoE)とIGHEスコアは,EoEサブポピュレーションを定義するための決定木の開発に向けてのステップであり,その結果,個別化された治療を容易にするであろう。Copyright 2018 Elsevier B.V., Amsterdam. All rights reserved. Translated from English into Japanese by JST.【JST・京大機械翻訳】

シソーラス用語： 免疫グロブリンE ,  ディシジョンツリー ,  *食道 ,  免疫組織化学 ,  データ解析 ,  予測 ,  患者 ,  生検 ,  炎症 ,  *機械学習 ,  アレルギー反応 ,  *アルゴリズム ,  *mRNA
準シソーラス用語： スコア ,  *好酸球性食道炎 , 【Automatic Indexing@JST】

著者キーワード (7件)： アレルギー診断 ,  好酸球 ,  好酸球性食道炎 ,  慢性アレルギー性炎症 ,  IgE ,  機械学習 ,  医用アルゴリズム

分類 (1件)： 消化器の疾患  (GH03000W)

タイトルに関連する用語 (6件)： 好酸球性食道炎 ,  mRNA ,  分類 ,  アルゴリズム ,  機械学習 ,  統合