文献

J-GLOBAL ID：201802243313927878   整理番号：18A1129619

SELEXと形状は,カブのCrinkleウイルスサテライトRNA Cの5′部分における配列モチーフと拡張ヘアピンが植物における適応性を媒介することを明らかにする【JST・京大機械翻訳】

SELEX and SHAPE reveal that sequence motifs and an extended hairpin in the 5’ portion of Turnip crinkle virus satellite RNA C mediate fitness in plants

著者 (15件)： Bayne Charlie F. (Department of Biology, Dickinson College, Carlisle, PA 17013, USA) ,  Widawski Max E. (Department of Biology, Dickinson College, Carlisle, PA 17013, USA) ,  Gao Feng (Department of Cell Biology and Molecular Genetics, University of Maryland, College Park, MD 20742, USA) ,  Masab Mohammed H. (Department of Biology, Dickinson College, Carlisle, PA 17013, USA) ,  Chattopadhyay Maitreyi (Department of Cell Biology and Molecular Genetics, University of Maryland, College Park, MD 20742, USA) ,  Murawski Allison M. (Department of Biology, Dickinson College, Carlisle, PA 17013, USA) ,  Sansevere Robert M. (Department of Biology, Dickinson College, Carlisle, PA 17013, USA) ,  Lerner Bryan D. (Department of Biology, Dickinson College, Carlisle, PA 17013, USA) ,  Castillo Rinaldys J. (Department of Biology, Dickinson College, Carlisle, PA 17013, USA) ,  Griesman Trevor (Department of Biology, Dickinson College, Carlisle, PA 17013, USA) ,  Fu Jiantao (Department of Biology, Dickinson College, Carlisle, PA 17013, USA) ,  Hibben Jennifer K. (Department of Biology, Dickinson College, Carlisle, PA 17013, USA) ,  Garcia-Perez Alma D. (Department of Biology, Dickinson College, Carlisle, PA 17013, USA) ,  Simon Anne E. (Department of Cell Biology and Molecular Genetics, University of Maryland, College Park, MD 20742, USA) ,  Kushner David B. (Department of Biology, Dickinson College, Carlisle, PA 17013, USA)
資料名： Virology  (Virology)
巻： 520  ページ： 137-152  発行年： 2018年 
JST資料番号： H0793A  ISSN： 0042-6822  資料種別： 逐次刊行物 (A)
記事区分： 原著論文  発行国： オランダ (NLD)  言語： 英語 (EN)

抄録/ポイント： 非コードRNAは,機能を仲介するためにそれらの配列および/または構造を使用する。Turnip crinkleウイルス(TCV)の356-nt非コード化サテライトRNA C(satC)の5′部分(166nt)は,2つの幹ループ(H6とH7)と大きな結合ヘアピン(H2)を持つ中心領域を含むことが以前にモデル化された。H2,H6及びH7における配列/構造要件を評価するin vivo機能選択(SELEX)実験により,H6ループ配列モチーフが非ランダム速度で回復し,5′中心領域内のアクセス可能な相補配列を持つ塩基対に対していくつかの残基のみが提案されることを示した。SELEX勝者のin vitro SHAPEは,中心領域が,より低い幹とH2領域に沿って,全体の5’領域を構成する,1つの広範なヘアピンが存在するように,非常に塩基対になっていることを示している。これらのSELEX勝者は高度に適合するので,これらの特性は植物におけるTCVと関連したsatRNA増幅を促進する。Copyright 2018 Elsevier B.V., Amsterdam. All rights reserved. Translated from English into Japanese by JST.【JST・京大機械翻訳】

シソーラス用語： モデリング ,  塩基対 ,  H2領域 ,  *サテライトRNA ,  *ウイルス ,  in vitro実験 ,  *RNA【核酸】 ,  適応性 ,  符号化
準シソーラス用語： RNA構造 ,  残基 ,  非翻訳RNA ,  *SELEX法 , 【Automatic Indexing@JST】

著者キーワード (5件)： カブのcrinkleウイルス ,  サテライトRNA ,  RNAの進化 ,  SELEX ,  RNA構造

分類 (1件)： ウイルスの生化学  (EG04030F)

タイトルに関連する用語 (8件)： SELEX ,  カブ ,  ウイルス ,  サテライトRNA ,  モチーフ ,  拡張 ,  植物 ,  適応性