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J-GLOBAL ID：201802243771528522   整理番号：18A0966101

単一細胞RNA-seqデータ解析からのヒト脳細胞における対立遺伝子発現の特性【JST・京大機械翻訳】

Characteristics of allelic gene expression in human brain cells from single-cell RNA-seq data analysis

著者 (12件)： Zhao Dejian (Department of Neurology, Albert Einstein College of Medicine, Bronx, USA) ,  Zhao Dejian (Department of Genetics, Albert Einstein College of Medicine, Bronx, USA) ,  Lin Mingyan (Department of Genetics, Albert Einstein College of Medicine, Bronx, USA) ,  Lin Mingyan (Present address: Department of Neuroscience, School of Basic Medical Science, Nanjing Medical University, Nanjing, China) ,  Pedrosa Erika (Department of Psychiatry and Behavioral Sciences, Albert Einstein College of Medicine, Bronx, USA) ,  Lachman Herbert M. (Department of Genetics, Albert Einstein College of Medicine, Bronx, USA) ,  Lachman Herbert M. (Department of Psychiatry and Behavioral Sciences, Albert Einstein College of Medicine, Bronx, USA) ,  Lachman Herbert M. (Department of Neuroscience, Albert Einstein College of Medicine, Bronx, USA) ,  Lachman Herbert M. (Department of Medicine, Albert Einstein College of Medicine, Bronx, USA) ,  Zheng Deyou (Department of Neurology, Albert Einstein College of Medicine, Bronx, USA) ,  Zheng Deyou (Department of Genetics, Albert Einstein College of Medicine, Bronx, USA) ,  Zheng Deyou (Department of Neuroscience, Albert Einstein College of Medicine, Bronx, USA)
資料名： BMC Genomics (Web)  (BMC Genomics (Web))
巻： 18  号： 1  ページ： 860  発行年： 2017年 
JST資料番号： U7048A  ISSN： 1471-2164  資料種別： 逐次刊行物 (A)
記事区分： 原著論文  発行国： イギリス (GBR)  言語： 英語 (EN)

抄録/ポイント： 常染色体遺伝子の単一対立遺伝子発現は,ヒトの精神疾患に関係している。しかしながら,単一細胞とゲノムワイドレベルでヒト脳細胞における対立遺伝子発現研究の不足がある。本報告において,著者らはいくつかの死後ヒト脳から以前に発表された単一細胞RNA-seqデータセットを再解析し,個々の細胞における広範な単一対立遺伝子発現をランダムに観察した。予測された機能的破壊を有する単一ヌクレオチド変異体を調べ,「損傷」対立遺伝子はそれらの対応物より少ない脳細胞で全体的に発現し,それらの発現が検出された細胞でより低いレベルで発現することを見出した。また,多くの脳細胞型特異的単一対立遺伝子発現遺伝子を同定し,興味深いことに,これらの細胞型特異的単一対立遺伝子発現遺伝子の多くは,それらの脳細胞型に重要な機能を豊富にしていた。加えて,機能分析は,異なる個々の脳からのニューロン細胞を横切る単一対立遺伝子発現と相関した発現を示す遺伝子がシナプス機能の調節に関わることを示した。著者らの知見は,単一対立遺伝子発現がヒト脳細胞において一般的であることを示唆する。それは,細胞の同一性とニューロンの多様性を発生させ,脳細胞機能の複雑性と多様性を増加させる役割を果たす可能性がある。Copyright 2018 The Author(s). All rights reserved. Translated from English into Japanese by JST.【JST・京大機械翻訳】

シソーラス用語： シナプス ,  機能分析 ,  *遺伝子発現 ,  常染色体 ,  *対立遺伝子 ,  *遺伝子 ,  *ヒト ,  *RNA【核酸】 ,  ニューロン ,  *データ解析 ,  精神病
準シソーラス用語： 細胞機能 ,  細胞型 ,  *単一細胞 ,  *RNA-seq , 【Automatic Indexing@JST】

著者キーワード (3件)： 対立遺伝子発現 ,  単一細胞RNA-seq ,  ヒト脳

分類 (1件)： 遺伝子発現  (EC02040Q)

引用文献 (79件)：

• Annu Rev Genet; Monoallelic gene expression in mammals; A Chess; 50; 1; 2016; 317-327; 10.1146/annurev-genet-120215-035120; citation_id=CR1
• Tian X-J, Zhang H, Sannerud J, Xing J. Achieving diverse and monoallelic olfactory receptor selection through dual-objective optimization design. Proc Natl Acad Sci. 2016;
• Cell; Allelic inactivation regulates olfactory receptor gene expression; A Chess, I Simon, H Cedar, R Axel; 78; 5; 1994; 823-834; 10.1016/S0092-8674(94)90562-2; citation_id=CR3
• Nat Genet; Monoallelic yet combinatorial expression of variable exons of the protocadherin-alpha gene cluster in single neurons; S Esumi, N Kakazu, Y Taguchi, T Hirayama, A Sasaki, T Hirabayashi, T Koide, T Kitsukawa, S Hamada, T Yagi; 37; 2; 2005; 171-176; 10.1038/ng1500; citation_id=CR4
• Nat Genet; Monoallelic expression of protocadherin genes; A Chess; 37; 2; 2005; 120-121; 10.1038/ng0205-120; citation_id=CR5

タイトルに関連する用語 (7件)： 単一細胞 ,  RNA-seq ,  データ解析 ,  ヒト ,  脳 ,  細胞 ,  遺伝子発現