抄録/ポイント：
抄録/ポイント
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トウガラシの生殖質資源の分析における分子マーカーの応用を拡大し,トウガラシのEST-SSRの機能性分子マーカーを開発し,DNAフィンガープリントを分析した。大紅花トウガラシの茎頂ノードのcDNAデータベースの45057の長さが200bp以上の非冗長Unigene配列を用い、MIcroSAtellite(MISA)ソフトを用いてSSR遺伝子座を検索した。SSR遺伝子座の頻度と密度,SSR反復モチーフの種類,比率,SSR反復回数,および数の分布を分析した。SSRプライマーをPrimer3.0ソフトウェアによりオンラインで設計し,PCR増幅により多型プライマーをスクリーニングした。多型バンドと分子量は,QuantityOneソフトウェアで算出した。NTsys2.0ソフトウェアは,12のコショウ生殖質の遺伝距離,樹状クラスタリング図,およびDNAフィンガープリントライブラリーを構築するのに用いられた。その結果、45057本の配列中に3315本のUnigene配列がSSR遺伝子座を含み、合計3814個、3315本の配列中のSSR遺伝子座の出現頻度は7.07%であり、検索したSSR遺伝子座のうち、ジヌクレオチドとトリヌクレオチドは、それぞれ29.42%と58.58%を占め、トリヌクレオチド反復中のGAA/CTT、AGA/TCTの出現頻度が最も高く、二、三、四、五、六ヌクレオチド反復モチーフの総数は反復回数の増加につれ、明らかな低下傾向を呈したことが分かった。・・・...............:SSR遺伝子座の中のGAA/CTTとAGA/TCTの出現頻度は最高である。Primer3.0によって設計した64対のEST-SSRプライマーのうち、55対のプライマーは予期した断片サイズのPCR産物を産生でき、そのうち18対のプライマーは、12のプライマー対のPCR増幅を行い、合計81の増幅バンドがあり、その内、8対のプライマー対は、それぞれ、2種類のプライマー対の遺伝類似係数は0.55260.8947であり、その内、8対のプライマーは、それぞれ、2種類のプライマー対のペアで、2種類のプライマー対が、それぞれ、12種類のプライマー対を増幅でき、その中、12種類のプライマー対は、それぞれ、12種類のプライマー対を増幅でき、そのうちの8対のプライマーを用いて、12種類のプライマー対を増幅でき、その中、12種類のプライマー対は、それぞれ、12種類のプライマー対を増幅でき、その中、12種類のプライマー対は2種類で、その中、2種類のプライマー対は、それぞれ、12種類のプライマー対を増幅でき、その中、2種類のプライマー対は、それぞれ、12種類のプライマー対を増幅でき、その中、12種類のプライマー対は、それぞれ、12種類のプライマー対を増幅でき、その内、12種類のプライマー対は、それぞれ、12種類のプライマー対を増幅でき、その内、12種類のプライマー対は、それぞれ、12種類のプライマー対を増幅でき、その内、12種類のプライマー対は、それぞれ、12種類のプライマー対を増幅でき、その内、12種類のプライマー対は、それぞれ、12種類のプライマー対を増幅でき、その内、12種類のプライマー対は、それぞれ、12種類のプライマー対を増幅でき、その内、12種類のプライマー対は、それぞれ、12種類のプライマー対を増幅でき、その内、12種類のプライマー対は、それぞれ、12種類のプライマー対を増幅でき、その内、12種類のプライマー対は、それぞれ、12種類のプライマー対を増幅でき、その内、12種類のプライマー対は、それぞれ、12種類のプライマー対を増幅できた。8対のプライマーを,Fujian郡の大紅花トウガラシの茎頂ノードのcDNA配列に成功裏に開発し,8対のプライマーを設計,スクリーニングし,3対のプライマーの組合せにより,12のコショウ種を区別した。これは,遺伝的多様性解析および遺伝子地図構築の新しいプライマー配列を提供するための基礎を築いた。Data from Wanfang. Translated by JST【JST・京大機械翻訳】
