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J-GLOBAL ID：201802243888475494   整理番号：18A1154600

健康なヒトコホートの腸内微生物相における潜在的および能動的機能【JST・京大機械翻訳】

Potential and active functions in the gut microbiota of a healthy human cohort

著者 (11件)： Tanca Alessandro (Porto Conte Ricerche, Science and Technology Park of Sardinia, Alghero, Italy) ,  Abbondio Marcello (Department of Biomedical Sciences, University of Sassari, Sassari, Italy) ,  Palomba Antonio (Porto Conte Ricerche, Science and Technology Park of Sardinia, Alghero, Italy) ,  Fraumene Cristina (Porto Conte Ricerche, Science and Technology Park of Sardinia, Alghero, Italy) ,  Manghina Valeria (Porto Conte Ricerche, Science and Technology Park of Sardinia, Alghero, Italy) ,  Manghina Valeria (Department of Biomedical Sciences, University of Sassari, Sassari, Italy) ,  Cucca Francesco (Department of Biomedical Sciences, University of Sassari, Sassari, Italy) ,  Cucca Francesco (Istituto di Ricerca Genetica e Biomedica, Consiglio Nazionale delle Ricerche (CNR), Cagliari, Italy) ,  Fiorillo Edoardo (Istituto di Ricerca Genetica e Biomedica, Consiglio Nazionale delle Ricerche (CNR), Cagliari, Italy) ,  Uzzau Sergio (Porto Conte Ricerche, Science and Technology Park of Sardinia, Alghero, Italy) ,  Uzzau Sergio (Department of Biomedical Sciences, University of Sassari, Sassari, Italy)
資料名： Microbiome (Web)  (Microbiome (Web))
巻： 5  号： 1  ページ： 79  発行年： 2017年 
JST資料番号： U7333A  ISSN： 2049-2618  資料種別： 逐次刊行物 (A)
記事区分： 原著論文  発行国： イギリス (GBR)  言語： 英語 (EN)

抄録/ポイント： 【背景】腸内微生物相(GM)の研究は,ショットガン・メタミクスによって,その機能的特性化に向かって急速に動いている。この文脈において,微生物機能が生理学的条件においてヒト腸において一貫して構成的に発現されるコンセンサスはまだ存在しない。ここでは,健康なヒト集団において実際に発現されたGM機能を調べる目的で,天然および高度に監視されたSardinian集団からの15人の健康な被験者のコホートを選択し,ショットガンメタプロテオミクスを用いてそれらのGMを分析した。加えて,ショットガンメタゲノムを用いてGM機能的可能性を明らかにし,組合せ分類学的および機能的様式におけるメタゲノムおよびメタプロテオームプロファイルを比較した。【結果】研究下のGMの分類学的構造に関するメタゲノムおよびメタプロテオミクスのデータは,グローバルに匹敵していた。反対に,ヒトの健康なGMの遺伝的可能性と機能的活性の間のかなりの相違が観察され,メタゲノムプロファイルのより低い個体間変動性と比較して,より高い可塑性を示すメタプロテオームが観察された。機能的活性及び代謝的仕事への分類特異的寄与も調べ,炭水化物代謝におけるいくつかのGMメンバーの特異的役割(多糖類分解,グリカン輸送,解糖及び短鎖脂肪酸産生を含む)への洞察を与えた。注目すべきことに,Firmicutesにより駆動された(主にFaecalibacterium spp.による)の発生は,腸の恒常性に対するこの微生物産物の生合成の以前に報告された重要性と一致して,研究コホートにおいて最も高い発現率と最も低い個体間変動性を有する代謝活性であることが示された。結論:著者らの結果は,健康なGMにおいて積極的に働く機能と経路に関する詳細で分類学的な情報を提供する。表現された機能と機能的可能性の間の報告された相違は,メタゲノムデータから機能的結論を引き出す前に注意が必要であることを示唆し,ヒトGM代謝機能と活性を特徴付けるための基本的アプローチとしてメタプロテオミクスをさらに支持する。Copyright 2018 The Author(s) All rights reserved. Translated from English into Japanese by JST.【JST・京大機械翻訳】

シソーラス用語： 塑性 ,  *ヒト ,  *微生物 ,  生理学 ,  キャラクタリゼーション ,  生合成 ,  代謝経路 ,  *腸内微生物 ,  代謝 ,  *母集団
準シソーラス用語： Firmicutes ,  グリカン ,  メタゲノム ,  散弾銃 ,  *健康 , 【Automatic Indexing@JST】

著者キーワード (6件)： 腸内細菌叢 ,  メタゲノミクス ,  メタプロテオミクス ,  代謝経路 ,  faecal ,  短鎖脂肪酸

分類 (3件)： 微生物の生態  (EG03040J) ,  微生物生理一般  (EG03051L) ,  代謝異常・栄養性疾患一般  (GD05010J)

引用文献 (67件)：

• PLoS Comput Biol; Chapter 12: human microbiome analysis; XC Morgan, C Huttenhower; 8; 2012; 10.1371/journal.pcbi.1002808; CR1;
• Nature; Structure, function and diversity of the healthy human microbiome; 486; 2012; 207-214; 10.1038/nature11234; CR2;
• Front Microbiol; Integrating ecological and engineering concepts of resilience in microbial communities; HS Song, RS Renslow, JK Fredrickson, SR Lindemann; 6; 2015; 1298; CR3;
• PLoS One; Metatranscriptomic approach to analyze the functional human gut microbiota; MJ Gosalbes, A Durban, M Pignatelli, JJ Abellan, N Jimenez-Hernandez, AE Perez-Cobas, A Latorre, A Moya; 6; 2011; 10.1371/journal.pone.0017447; CR4;
• ISME J; Shotgun metaproteomics of the human distal gut microbiota; NC VerBerkmoes, AL Russell, M Shah, A Godzik, M Rosenquist, J Halfvarson, MG Lefsrud, J Apajalahti, C Tysk, RL Hettich, JK Jansson; 3; 2009; 179-189; 10.1038/ismej.2008.108; CR5;

タイトルに関連する用語 (1件)： 腸内微生物