ニンジン(Daucus carota L.)におけるイントロン長多型マーカーの起源を提供するミニチュア逆転反復転位要素挿入【JST・京大機械翻訳】

Stelmach Katarzyna; Macko-Podgorni Alicja; Machaj Gabriela; Grzebelus Dariusz

文献

J-GLOBAL ID：201802244064302111 整理番号：18A0805813

ニンジン(Daucus carota L.)におけるイントロン長多型マーカーの起源を提供するミニチュア逆転反復転位要素挿入【JST・京大機械翻訳】

Miniature Inverted Repeat Transposable Element Insertions Provide a Source of Intron Length Polymorphism Markers in the Carrot (Daucus carota L.)

出版者サイト複写サービスで全文入手 {{ this.onShowCLink("http://jdream3.com/copy/?sid=JGLOBAL&noSystem=1&documentNoArray=18A0805813&COPY=1") }}
高度な検索・分析はJDreamⅢで {{ this.onShowJLink("http://jdream3.com/lp/jglobal/index.html?docNo=18A0805813&from=J-GLOBAL&jstjournalNo=U7094A") }}

著者 (4件)： , , ,
資料名：
巻： 8 ページ： 725 発行年： 2017年
JST資料番号： U7094A ISSN： 1664-462X 資料種別：逐次刊行物 (A)
記事区分：原著論文発行国：スイス (CHE) 言語：英語 (EN)

植物ゲノムにおける非自律クラスII転移性要素(TE)の罹患率は,遺伝子関連分子マーカーの比較的迅速で低コストな開発のためのツールとして役立つ可能性がある。イントロン内に挿入されたミニチュア反転反復転移因子(MITE)コピーは,潜在的イントロン長多型(ILP)マーカーとして利用できる。ILPSは標的イントロンに隣接するエキソン配列に固定されたプライマーによりPCRにより検出される。ここでは,ニンジンゲノムに沿ったイントロン内の209DcSto(Daucus carota Stowaway様)MITE挿入部位のプライマーを設計し,ニンジンを遺伝子タイピングするためのマーカーセットを開発するためにILPマーカー候補としてそれらを検証した。証明概念として,90の二対立遺伝子DcS-ILPマーカーを選択し,野生Daucus carotaと異なる根形状の栽培ニンジンからなる27系統の遺伝的多様性を評価するために用いた。有効対立遺伝子の数は1.56で,平均多型情報量は0.27であったが,平均観察および期待ヘテロ接合性はそれぞれ0.24および0.34であった。67の遺伝子座は,Wrightの固定指数の陽性値を示した。Bayes法を用いて,それぞれ4つの野生および23の栽培系統から成る2つのクラスタを識別した。栽培ニンジン遺伝子プール内で,Chantenay,Danvers,Imperator,Paris Market型からの系統を代表する4つのサブクラスタを明らかにした。それは,西部栽培ニンジンにおける根型関連多様性構造の最初の分子的証拠である。DcS-ILPは,研究した系統の間でかなりの遺伝的多様性を検出し,かなりの識別力を示すことは,遺伝資源の特性化とゲノム関係の分析のためのツールとして利用できる可能性がある。DcS-ILPマーカーの開発されたセットは,TE挿入多型に基づく容易にアクセス可能な分子マーカー遺伝子タイピングシステムである。Copyright 2018 The Author(s). All rights reserved. Translated from English into Japanese by JST.【JST・京大機械翻訳】

, , , , , , , , ,
, , , , , 【Automatic Indexing@JST】

著者キーワード (5件)： , , , ,

遺伝子の構造と化学 , 生化学的分析法 , 遺伝子操作 , 分子遺伝学一般

, , , , , , , , ,

前のページに戻る