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J-GLOBAL ID：201802244066994291   整理番号：18A1115137

in vitro培養8Clostridium difficile PCRリボタイプから放出されたプロテオームの分析は,PCRリボタイプ027および176における特異的発現を明らかにし,プロテオミクスレベルでのそれらの遺伝的関連性および臨床的重要性を確認する【JST・京大機械翻訳】

Analysis of proteomes released from in vitro cultured eight Clostridium difficile PCR ribotypes revealed specific expression in PCR ribotypes 027 and 176 confirming their genetic relatedness and clinical importance at the proteomic level

著者 (13件)： Dresler Jiri (Military Health Institute, Military Medical Agency, Prague, Czech Republic) ,  Krutova Marcela (Department of Medical Microbiology, 2nd Faculty of Medicine, Charles University in Prague and Motol University Hospital, Prague, Czech Republic) ,  Fucikova Alena (Faculty of Military Health Sciences, UoD, Hradec Kralove, Czech Republic) ,  Klimentova Jana (Faculty of Military Health Sciences, UoD, Hradec Kralove, Czech Republic) ,  Hruzova Veronika (Military Health Institute, Military Medical Agency, Prague, Czech Republic) ,  Duracova Miloslava (Faculty of Military Health Sciences, UoD, Hradec Kralove, Czech Republic) ,  Houdkova Katerina (Military Health Institute, Military Medical Agency, Prague, Czech Republic) ,  Salovska Barbora (Military Health Institute, Military Medical Agency, Prague, Czech Republic) ,  Matejkova Jana (Department of Medical Microbiology, 2nd Faculty of Medicine, Charles University in Prague and Motol University Hospital, Prague, Czech Republic) ,  Hubalek Martin (Institute of Organic Chemistry and Biochemistry, Academy of Science, Prague, Czech Republic) ,  Pajer Petr (Military Health Institute, Military Medical Agency, Prague, Czech Republic) ,  Pisa Libor (Military Health Institute, Military Medical Agency, Prague, Czech Republic) ,  Nyc Otakar (Department of Medical Microbiology, 2nd Faculty of Medicine, Charles University in Prague and Motol University Hospital, Prague, Czech Republic)
資料名： Gut Pathogens (Web)  (Gut Pathogens (Web))
巻： 9  号： 1  ページ： 45  発行年： 2017年 
JST資料番号： U7487A  ISSN： 1757-4749  資料種別： 逐次刊行物 (A)
記事区分： 原著論文  発行国： イギリス (GBR)  言語： 英語 (EN)

抄録/ポイント： 【背景】Clostridium difficileは,下痢,偽膜性大腸炎または生命を脅かす毒性メガコロンによって明らかにされることができたC.difficile感染症(CDI)の原因病原体である。特定の菌株の広がりは,健康管理のための重要な経済的負担を表す。流行成功株はCDIの重篤な臨床的特徴とも関連している。したがって,8つの異なるPCRリボタイプ(RTs)のin vitro培養パネルから放出されたプロテオームを含むプロテオーム研究を行い,ショットガンプロテオミクスと無標識定量化(LFQ)アプローチの組み合わせを用いた。【結果】比較半定量分析は,合計662の蛋白質の調査を可能にした。階層的クラスタリングと主成分分析(PCA)の両方が8つの特有のグループを作った。これらの定量可能な蛋白質から,27は機能的アノテーションにおいて有意に増加した。それらの中で,毒素A,B,二成分毒素,鞭毛蛋白質,およびPro-Proエンドペプチダーゼ(PPEP-1)機能複合体に関連する蛋白質のような,病原性に関連するいくつかの既知因子を同定した。蛋白質発現の比較分析は,RTs027および176における病原性または鉄代謝に関連した蛋白質のより高い発現またはユニークな発現を示し,それらの遺伝的関連性およびプロテオミクスレベルでの臨床的重要性を支持した。さらに,推定ニトロレダクターゼの不在およびABC型Fe3+輸送系蛋白質の存在が,二成分毒素遺伝子(027,176および078)を有するRTsのバイオマーカーとして観察された。選択された鞭毛蛋白質のより高い発現は,明らかにRT027,176,005および012を識別し,CDIにおける集合の病原性役割を確認した。最終的に,蛋白質複合体HisG/HisZを制御するヒスチジン合成経路は,毒素AとBの遺伝子を持つ分離株でのみ観察された。結論:本研究はLFQアプローチの適用性を示し,8つのRTsのin vitro培養パネルから放出されたプロテオームへの最初の半定量的洞察を提供した。観察された差異は,CDIの性質を強調する機構の解明に焦点を当てた研究のための新しい方向を指摘した。Copyright 2018 The Author(s). All rights reserved. Translated from English into Japanese by JST.【JST・京大機械翻訳】

シソーラス用語： 定量分析 ,  感染症 ,  病原性 ,  主成分分析 ,  *プロテオーム ,  タンパク質複合体 ,  毒性 ,  鞭毛 ,  バイオマーカー ,  *Clostridium difficile ,  *in vitro実験 ,  遺伝子 ,  *Clostridium ,  *培養
準シソーラス用語： *リボタイピング , 【Automatic Indexing@JST】

著者キーワード (8件)： Clostridium difficile ,  無標識定量化 ,  プロテオーム ,  PCRリボタイプ027 ,  PCRリボタイプ176 ,  二成分毒素 ,  毒素A/B ,  フラゲリン

分類 (2件)： 感染症・寄生虫症一般  (GD01010H) ,  微生物感染の生理と病原性  (EG03053T)

引用文献 (43件)：

• Lancet Lond Engl.; Toxin production by an emerging strain of Clostridium difficile associated with outbreaks of severe disease in North America and Europe; M Warny, J Pepin, A Fang, G Killgore, A Thompson, J Brazier; 366; 2005; 1079-1084; 10.1016/S0140-6736(05)67420-X; CR1;
• Int J Proteom.; Proteomic analysis and label-free quantification of the large Clostridium difficile toxins; H Moura, RR Terilli, AR Woolfitt, YM Williamson, G Wagner, TA Blake; 2013; 2013; 1-10; 10.1155/2013/293782; CR2;
• Trends Microbiol; The role of flagella in Clostridium difficile pathogenicity; E Stevenson, NP Minton, SA Kuehne; 23; 2015; 275-282; 10.1016/j.tim.2015.01.004; CR3;
• J Med Microbiol; Comparative proteomic analysis of Clostridium difficile isolates of varying virulence; CH Chilton, SE Gharbia, M Fang, R Misra, IR Poxton, SP Borriello; 63; 2014; 489-503; 10.1099/jmm.0.070409-0; CR4;
• Proteomics; Proteomic analysis of cell surface proteins from Clostridium difficile; A Wright, R Wait, S Begum, B Crossett, J Nagy, K Brown; 5; 2005; 2443-2452; 10.1002/pmic.200401179; CR5;

タイトルに関連する用語 (10件)： 培養 ,  PCR ,  リボタイプ ,  放出 ,  プロテオーム ,  分析 ,  発現 ,  遺伝的関連性 ,  臨床 ,  重要性