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J-GLOBAL ID：201802244410461203   整理番号：18A0970363

遷移経路アンサンブルにおける等分配項:アラニンジペプチドの分子動力学シミュレーションからの洞察【JST・京大機械翻訳】

Equipartition terms in transition path ensemble: Insights from molecular dynamics simulations of alanine dipeptide

著者 (1件)： Li Wenjin (Institute for Advanced Study, Shenzhen University, Shenzhen, China)
資料名： Journal of Chemical Physics  (Journal of Chemical Physics)
巻： 148  号： 8  ページ： 084105-084105-5  発行年： 2018年 
JST資料番号： C0275A  ISSN： 0021-9606  CODEN： JCPSA6  資料種別： 逐次刊行物 (A)
記事区分： 原著論文  発行国： アメリカ合衆国 (USA)  言語： 英語 (EN)

抄録/ポイント： 遷移経路集合は反応性軌跡から成り,重要な凝縮相過程の機構と動力学の理解に必要なすべての情報を持つ。しかし,遷移経路集合の特性の定量的記述は確立されていない。ここでは,モデル系に関する数値計算により,熱平衡で定義された等分配項を,遷移経路集合で初めて推定した。エネルギーがすべての座標の間に等しく分布していないことを観察することは驚くべきことではなかった。しかし,一対の共役座標上に分布したエネルギーは等しいままであった。より高いエネルギーはいくつかの座標上に分布していることが観察され,それは反応座標に高度に結合していたが,残りはほとんど等しく分布していた。さらに,時間の関数としての各座標上の集合平均エネルギーも定量化した。エネルギー分布に関するこれらの定量的解析は,遷移経路集合への新しい洞察を提供した。(翻訳著者抄録)【JST・京大機械翻訳】

シソーラス用語： *反応座標 ,  反応性 ,  熱平衡 ,  共役 ,  数値計算 ,  軌跡 ,  定量的分析 ,  *計算機シミュレーション ,  エネルギー分布
準シソーラス用語： 凝縮相 ,  *分子動力学シミュレーション , 【Automatic Indexing@JST】

分類 (1件)： 反応速度論・触媒一般  (CB06010G)

タイトルに関連する用語 (6件)： 遷移 ,  経路 ,  アンサンブル ,  アラニンジペプチド ,  分子動力学シミュレーション ,  洞察