アカカエデ(Acer rubrum)におけるニッケル誘発の包括的遺伝子発現:ニッケル濃度の影響【JST・京大機械翻訳】

Nkongolo Kabwe; Nkongolo Kabwe; Theriault Gabriel; Michael Paul

文献

J-GLOBAL ID：201802244478687067 整理番号：18A1074903

アカカエデ(Acer rubrum)におけるニッケル誘発の包括的遺伝子発現:ニッケル濃度の影響【JST・京大機械翻訳】

Nickel-induced global gene expressions in red maple (Acer rubrum): Effect of nickel concentrations

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資料名：
巻： 14 ページ： 29-36 発行年： 2018年
JST資料番号： W3471A ISSN： 2352-4073 資料種別：逐次刊行物 (A)
記事区分：原著論文発行国：オランダ (NLD) 言語：英語 (EN)

赤m(Acer rubrum)はその組織中にニッケルを蓄積せず,Niavoダーとして分類されている。この金属回避戦略に含まれる遺伝的機構はまだ定義されていない。さらに,植物における金属毒性に関する研究の大部分は,毒性金属の生物学的利用可能量が小さい分野で行われている。ニッケルのような毒性金属により特異的に修飾される遺伝子の同定は有用であり,それらの作用機序のより良い理解を提供するはずである。本研究の目的は,赤m(Acer rubrum)における全体的遺伝子発現に及ぼす異なるニッケル用量の影響を評価することであった。ニッケル(Ni)毒性を評価するために,A.rubrum遺伝子型を対照(0mg/kg)および1kgの土壌当たり150mgのNi,800mg/kgおよび1600mg/kgの3用量で処理した。遺伝子発現を決定するために,RNA-seqライブラリーを開発し,De Novoトランスクリプトームを組み立てた。比較分析は,最も高い用量(1600mg/kg)がNi(0mg/kgと150mg/kg)の最低用量と比較されたときのみ,有意差次的遺伝子発現を明らかにした。実際に,1600mgのNi/kgで処理した植物が150mg/kg処理の植物と比較されたとき,5753の遺伝子が上方制御され,2382が下方制御された。これらの値は,この最も高いNi用量が水対照と比較されたとき,それぞれ6263と3142であった。遺伝子応答の誘導のための閾値は,800mg/kgと1600mg/kgの土壌ニッケルの間にあることがわかった。著者らは,低用量および水対照と比較して,高Ni用量に曝露された植物における輸送および翻訳に関連する蛋白質をコードするダウンレギュレーションされた遺伝子よりも上方制御されていることを観察した。本研究は,カナダにおける最も高度に汚染された採鉱サイトにおける生物学的に利用可能なNiの量が,A.rubrumにおける遺伝子発現の変化を引き起こすことができないことを示唆する。Copyright 2018 Elsevier B.V., Amsterdam. All rights reserved. Translated from English into Japanese by JST.【JST・京大機械翻訳】

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動物に対する影響 , 有機化合物の毒性

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