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J-GLOBAL ID：201802244583022334   整理番号：18A0805968

野生コムギAegilops tauschiiにおける穀粒構造のゲノムワイド関連研究【JST・京大機械翻訳】

Genome-Wide Association Study of Grain Architecture in Wild Wheat Aegilops tauschii

著者 (9件)： Arora Sanu (School of Agricultural Biotechnology, Punjab Agricultural University) ,  Arora Sanu (Crop Genetics, John Innes Centre) ,  Singh Narinder (Wheat Genetics Resource Center, Department of Plant Pathology, Kansas State University, Manhattan) ,  Kaur Satinder (School of Agricultural Biotechnology, Punjab Agricultural University) ,  Bains Navtej S. (School of Agricultural Biotechnology, Punjab Agricultural University) ,  Bains Navtej S. (Department of Plant Breeding and Genetics, Punjab Agricultural University) ,  Uauy Cristobal (Crop Genetics, John Innes Centre) ,  Poland Jesse (Wheat Genetics Resource Center, Department of Plant Pathology, Kansas State University, Manhattan) ,  Chhuneja Parveen (School of Agricultural Biotechnology, Punjab Agricultural University)
資料名： Frontiers in Plant Science (Web)  (Frontiers in Plant Science (Web))
巻： 8  ページ： 886  発行年： 2017年 
JST資料番号： U7094A  ISSN： 1664-462X  資料種別： 逐次刊行物 (A)
記事区分： 原著論文  発行国： スイス (CHE)  言語： 英語 (EN)

抄録/ポイント： Triticum aestivumのD-ゲノム前駆体,Aegillops tauschiiは,収量,生物的および非生物的ストレス耐性,品質および栄養のような潜在的経済的重要性の様々な形質に対して大きな多様性を含んでいる。本研究において,Ae.tauschii生殖質における穀粒サイズの変化を研究し,その遺伝的基礎をゲノムワイド関連研究(GWAS)を用いて解剖した。3年間にわたる177Ae.tauschii系統において評価された穀粒長,幅,および重量は,それぞれ1.74,1.75,および2.82倍の変動を有するほぼ正規分布を示した。これらの系統は,11,489個の単一ヌクレオチド多形(SNP)マーカーを産生する遺伝子タイピング(GBS)プロトコルを用いて遺伝的に特性化された。遺伝的多様性分析により,Ae.tauschiiにおいて2つの異なるサブグループ(系統1と2)の存在を明らかにした。GBSマーカーに基づいて,遺伝的類似性を系統とGWASの間で計算し,114の非冗長系統と5249のSNPマーカーを用いて行った。すべての7つの染色体上に分布する穀粒サイズ形質に関連する合計17のSNPを,最も有意なマーカー-形質関連を持つ6D,5D,および2Dで明らかにした。6D_66.4-71.1cM,1D_143.5-156.7cM,および2D_89.9-92.5cMのような染色体領域のいくつかは,複数の形質と関連していた。細胞分裂と分化に関連する候補遺伝子を関連SNPマーカーのいくつかについて同定した。これらの遺伝子座を検証するための更なる努力は,現在の生殖質における穀粒サイズと対立遺伝子多様性の決定におけるそれらの役割と,パンコムギ背景への移動に及ぼす穀粒サイズに及ぼすその影響を理解するのに役立つであろう。Copyright 2018 The Author(s). All rights reserved. Translated from English into Japanese by JST.【JST・京大機械翻訳】

シソーラス用語： 対立遺伝子 ,  *Aegilops ,  品質 ,  キャラクタリゼーション ,  一塩基多型 ,  *ゲノム ,  ゲノムワイド関連解析 ,  細胞分裂 ,  *コムギ ,  遺伝
準シソーラス用語： 候補遺伝子 ,  SNPマーカー ,  遺伝子タイピング ,  生殖質 ,  *Aegilops tauschii , 【Automatic Indexing@JST】

著者キーワード (6件)： Aegilops tauschii ,  遺伝的多様性 ,  ゲノムワイド関連マッピング ,  シークエンシングによる遺伝子タイピング ,  粒径 ,  一塩基多型マーカー

分類 (4件)： 遺伝子の構造と化学  (EC02020U) ,  分子遺伝学一般  (EC02010J) ,  遺伝学研究法  (EC01020N) ,  麦  (FC03033M)

タイトルに関連する用語 (5件)： コムギ ,  Aegilops ,  穀粒 ,  ゲノム ,  研究