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J-GLOBAL ID：201802245331974415   整理番号：18A0805523

トランスクリプトーム比較はZn/Cd超蓄積者Sedum alfredii Hanceの2つの対照的生態型の適応進化を明らかにする【JST・京大機械翻訳】

Transcriptome Comparison Reveals the Adaptive Evolution of Two Contrasting Ecotypes of Zn/Cd Hyperaccumulator Sedum alfredii Hance

著者 (6件)： Yang Qianying (Ministry of Education Key Laboratory of Environmental Remediation and Ecosystem Health, College of Environmental and Resources Science, Zhejiang University) ,  Shohag M. J. I. (Ministry of Education Key Laboratory of Environmental Remediation and Ecosystem Health, College of Environmental and Resources Science, Zhejiang University) ,  Shohag M. J. I. (Department of Agriculture, Bangabandhu Sheikh Mujibur Rahman Science and Technology University) ,  Feng Ying (Ministry of Education Key Laboratory of Environmental Remediation and Ecosystem Health, College of Environmental and Resources Science, Zhejiang University) ,  He Zhenli (Institute of Food and Agricultural Sciences, Indian River Research and Education Center, University of Florida) ,  Yang Xiaoe (Ministry of Education Key Laboratory of Environmental Remediation and Ecosystem Health, College of Environmental and Resources Science, Zhejiang University)
資料名： Frontiers in Plant Science (Web)  (Frontiers in Plant Science (Web))
巻： 8  ページ： 425  発行年： 2017年 
JST資料番号： U7094A  ISSN： 1664-462X  資料種別： 逐次刊行物 (A)
記事区分： 原著論文  発行国： スイス (CHE)  言語： 英語 (EN)

抄録/ポイント： Sedum alfredii Hanceの過剰蓄積生態型(HE)と非過剰蓄積生態型(NHE)は,同じ種に属するが,カドミウムと亜鉛に対する過剰蓄積と超耐性に関して対照的な特性を示す。この対照的形質の遺伝的進化を研究するために,Illina Hiseq 2500プラットフォームを用いて,HEとNHEを配列した。90以上のクリーンな読み取りが得られ,7つの既存のデータベースに基づいて,HE/NHEの1118,479/228,051の単一遺伝子が注釈された。著者らは,149,668/319,830の一塩基多型(SNP)および12691/14,428の単純配列反復(SSR)を同定した。分枝部位モデルを用いて,S.alfredii Hanceの18の分岐オーソログ遺伝子と57の保存されたオーソログ遺伝子を同定した。分岐オーソログ遺伝子は主に転写および翻訳過程,蛋白質代謝過程,カルシウム(Ca2+)経路,ストレス応答過程およびシグナル伝達過程に関与していた。著者らの知る限りでは,これは同じ種からの過剰蓄積および非過剰蓄積植物の遺伝的進化を比較するためにRNA-seqを用いる最初の研究である。加えて,本研究は,S.alfredii Hanceにおける過剰蓄積と超耐性形質の進化過程と形成を示すために,分子マーカーと分岐オーソログ遺伝子に関するさらなる研究のための唯一の具体的なものを作った。Copyright 2018 The Author(s). All rights reserved. Translated from English into Japanese by JST.【JST・京大機械翻訳】

シソーラス用語： タンパク質代謝 ,  *亜鉛 ,  遺伝 ,  *カドミウム ,  遺伝子 ,  一塩基多型 ,  *トランスクリプトーム ,  データベース
準シソーラス用語： 分子マーカー ,  RNA-seq ,  ストレス応答 ,  オルソログ遺伝子 ,  *適応進化 ,  *生態型 ,  *シナマンネングサ , 【Automatic Indexing@JST】

著者キーワード (8件)： 比較トランスクリプトーム ,  SSR ,  SNPs ,  多様なオーソロガス遺伝子 ,  Sedum alfredii Hance ,  ハイパーアキュムレータ ,  亜鉛 ,  カドミウム

分類 (2件)： 重金属とその化合物一般  (SB05021R) ,  土壌汚染  (FB04100T)

タイトルに関連する用語 (8件)： トランスクリプトーム ,  Zn ,  Cd ,  蓄積 ,  Sedum ,  対照 ,  生態型 ,  適応進化