抄録/ポイント:
抄録/ポイント
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実験室循環水養殖システム養殖金銭魚の1週間と1ケ月後の2組の養殖水サンプル(それぞれA、B)を研究対象とし、濾過膜で水サンプル中の細菌を濃縮し、細菌ゲノムDNAを抽出した。16SrDNAのPCR増幅産物を,MiSeqのハイスループット配列決定により分析し,細菌多様性比較分析,種組成分析,およびクラスター分析を実施した。その結果;2つのサンプルから15259の有効な配列が得られ,そのうちAは9092,Bは6167であった。97%の類似性で,90のOTUs(operationaltaxonomicunits)が生成された。多様性指数分析は,Aサンプル細菌群集の多様性がBサンプルより明らかに高いことを示した。試料中の細菌の種類は8つの門,16の綱,28の目,38の科と48の属を含み,Aはプロテオバクテリア(Thalassospira)とビブリオ属(Vibrio)が優勢であった。相対的豊度は,それぞれ14.51%と13.29%であり,Bacteroidetes(Bacteroidetes)のAureispiraとDyadobacterが優勢で,相対的豊度はそれぞれ44.67%と17.63%であった。時間の経過とともに、魚体の生長による可溶性代謝産物と溶解性有機物は次第に蓄積し、水体のpHの変化により、細菌の生長の微環境を変え、細菌個体群の継承と適応の現象が現れた。Data from Wanfang. Translated by JST.【JST・京大機械翻訳】