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J-GLOBAL ID：201802245456978186   整理番号：18A1040548

生物学的高分子の統合/ハイブリッド構造モデルを保管するためのプロトタイプシステムの開発【JST・京大機械翻訳】

Development of a Prototype System for Archiving Integrative/Hybrid Structure Models of Biological Macromolecules

著者 (5件)： Vallat Brinda (Research Collaboratory for Structural Bioinformatics, Institute for Quantitative Biomedicine, Rutgers, The State University of New Jersey, Piscataway, NJ 08854, USA) ,  Webb Benjamin (Department of Bioengineering and Therapeutic Sciences, Department of Pharmaceutical Chemistry and California Institute for Quantitative Biosciences, University of California at San Francisco, San Francisco, CA 94143, USA) ,  Westbrook John D. (Research Collaboratory for Structural Bioinformatics, Institute for Quantitative Biomedicine, Rutgers, The State University of New Jersey, Piscataway, NJ 08854, USA) ,  Sali Andrej (Department of Bioengineering and Therapeutic Sciences, Department of Pharmaceutical Chemistry and California Institute for Quantitative Biosciences, University of California at San Francisco, San Francisco, CA 94143, USA) ,  Berman Helen M. (Research Collaboratory for Structural Bioinformatics, Institute for Quantitative Biomedicine, Rutgers, The State University of New Jersey, Piscataway, NJ 08854, USA)
資料名： Structure  (Structure)
巻： 26  号： 6  ページ： 894-904.e2  発行年： 2018年 
JST資料番号： A1212A  ISSN： 0969-2126  資料種別： 逐次刊行物 (A)
記事区分： 原著論文  発行国： オランダ (NLD)  言語： 英語 (EN)

抄録/ポイント： 生物学における本質的な過程は,大きな高分子集合体によって行われ,その構造は従来の方法によって決定することが困難である。ますます多くの研究者は,高分子とそれらの集合体の「ハイブリッド」または「統合的」構造モデルを得るために,いくつかの補完的方法から測定データと計算情報を結合した。これらの統合/ハイブリッド(I/H)モデルは,標準データ表現と処理機構の欠如のためにPDBでは保存されていない。ここでは,データ標準の開発と,I/Hモデルを保存するためのプロトタイプシステムを示した。データ標準は,異なる実験技術から導出された空間的制約と同様に,複数の時空間スケールと立体配座状態をスパンするI/Hモデルを表現するために必要な定義を提供する。これらのデータ定義に基づいて,著者らは,PDB-Devと呼ばれるプロトタイプシステムを構築し,それは,I/H構造モデルを保存するために必要なインフラストラクチャを提供した。PDB-Devは現在,構造を受け入れており,新しいサブミッションのためにコミュニティに開かれている。Copyright 2018 Elsevier B.V., Amsterdam. All rights reserved. Translated from English into Japanese by JST.【JST・京大機械翻訳】

シソーラス用語： *モデル ,  *高分子 ,  凝集体 ,  インフラストラクチャー ,  コミュニティ ,  *複合構造 ,  立体配座 ,  スパン
準シソーラス用語： *構造モデル ,  高分子集合体 , 【Automatic Indexing@JST】

著者キーワード (10件)： 統合/ハイブリッドモデリング ,  PDBX/MMCIF ,  PDB ,  PDB-DEV ,  データ標準 ,  構造生物学 ,  データアーカイブ ,  IHM辞書 ,  マルチスケールモデル ,  空間拘束

分類 (1件)： 人工知能  (JE08000Z)

タイトルに関連する用語 (7件)： 生物学 ,  高分子 ,  統合 ,  構造モデル ,  保管 ,  プロトタイプ ,  開発