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J-GLOBAL ID：201802245577176215   整理番号：18A0392722

FIB-SEMトモグラムからの高圧凍結および凍結置換マウス網膜核の自動セグメンテーション【Powered by NICT】

Automatic segmentation of high pressure frozen and freeze-substituted mouse retina nuclei from FIB-SEM tomograms

著者 (14件)： Hoang Thai V. (IGBMC (Institut de Genetique et de Biologie Moleculaire et Cellulaire), 1, rue Laurent Fries, BP 10142, 67404 Illkirch, France) ,  Hoang Thai V. (Inserm, U964, Illkirch, France) ,  Hoang Thai V. (CNRS, UMR7104, Illkirch, France) ,  Hoang Thai V. (Universite de Strasbourg, Strasbourg, France) ,  Kizilyaprak Caroline (University of Lausanne, Electron Microscopy Facility, 1015 Lausanne, Switzerland) ,  Spehner Daniele (IGBMC (Institut de Genetique et de Biologie Moleculaire et Cellulaire), 1, rue Laurent Fries, BP 10142, 67404 Illkirch, France) ,  Spehner Daniele (Inserm, U964, Illkirch, France) ,  Spehner Daniele (CNRS, UMR7104, Illkirch, France) ,  Spehner Daniele (Universite de Strasbourg, Strasbourg, France) ,  Humbel Bruno M. (University of Lausanne, Electron Microscopy Facility, 1015 Lausanne, Switzerland) ,  Schultz Patrick (IGBMC (Institut de Genetique et de Biologie Moleculaire et Cellulaire), 1, rue Laurent Fries, BP 10142, 67404 Illkirch, France) ,  Schultz Patrick (Inserm, U964, Illkirch, France) ,  Schultz Patrick (CNRS, UMR7104, Illkirch, France) ,  Schultz Patrick (Universite de Strasbourg, Strasbourg, France)
資料名： Journal of Structural Biology  (Journal of Structural Biology)
巻： 197  号： 2  ページ： 123-134  発行年： 2017年 
JST資料番号： W0838A  ISSN： 1047-8477  資料種別： 逐次刊行物 (A)
記事区分： 原著論文  発行国： オランダ (NLD)  言語： 英語 (EN)

抄録/ポイント： 走査電子顕微鏡と組合せた集束イオンビームミリングは3~5nmの等方性分解能で全細胞および組織の三次元組織化を決定するための強力なツールである。これはいくつかの細胞パラメータを定量化し,正常または疾患状態の詳細な表現型情報を提供する可能性を開いた。ここでは,形状と核の体積のようなマウスかん体光受容体核の特徴を自動化された方法で抽出するバイオコンピューティング法を記述する;ヘテロクロマチンの割合数,密度と分布核膜孔複合体(NPC)。五核の得られた値は,NPC(348±8)の数は最も保存された特徴であることを示した。高等真核生物における核の大きさは大きな変動を示し,ロッド核が報告されている最小(32±3μm~3)である。サイズの大きな種と細胞型特異的変動にもかかわらず,NPC(約15/μm~2)の密度は高度に保存されていた。Copyright 2018 Elsevier B.V., Amsterdam. All rights reserved. Translated from English into Japanese by JST.【Powered by NICT】

シソーラス用語： 自動化 ,  分解能 ,  表現型 ,  集束イオンビーム ,  *セグメンテーション ,  走査電子顕微鏡 ,  等方性 ,  桿体 ,  ヘテロクロマチン ,  真核生物 ,  光受容体 ,  形態
準シソーラス用語： *自動セグメンテーション ,  *凍結置換 ,  *高圧凍結 , 【Automatic Indexing@JST】

著者キーワード (4件)： FIB/SEMトモグラフィー ,  セグメンテーション ,  Nucleus ,  ヘテロクロマチン

分類 (2件)： 固体デバイス製造技術一般  (NC03030V) ,  光デバイス一般  (BD06010L)

タイトルに関連する用語 (7件)： FIB-SEM ,  高圧凍結 ,  凍結置換 ,  マウス ,  網膜 ,  核 ,  自動セグメンテーション