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J-GLOBAL ID：201802245707425663   整理番号：18A1261369

本質的に無秩序な蛋白質と領域の立体配座アンサンブルを評価するための粗視化モデリングとモンテカルロシミュレーションの利用【JST・京大機械翻訳】

Utilizing Coarse-Grained Modeling and Monte Carlo Simulations to Evaluate the Conformational Ensemble of Intrinsically Disordered Proteins and Regions

著者 (3件)： Cragnell Carolina (Division of Theoretical Chemistry, Department of Chemistry, Lund University, P.O. Box 124, SE-221 00 Lund, Sweden) ,  Rieloff Ellen (Division of Theoretical Chemistry, Department of Chemistry, Lund University, P.O. Box 124, SE-221 00 Lund, Sweden) ,  Skepo Marie (Division of Theoretical Chemistry, Department of Chemistry, Lund University, P.O. Box 124, SE-221 00 Lund, Sweden)
資料名： Journal of Molecular Biology  (Journal of Molecular Biology)
巻： 430  号： 16  ページ： 2478-2492  発行年： 2018年 
JST資料番号： D0124B  ISSN： 0022-2836  資料種別： 逐次刊行物 (A)
記事区分： 原著論文  発行国： オランダ (NLD)  言語： 英語 (EN)

抄録/ポイント： 本研究では,本質的に不規則な唾液蛋白質(IDP)ヒスタチン5に対して開発した粗粒モデルを用いて,単量体IDPの実験的選択を行い,静電相互作用が分子内相互作用を支配する場合にモデルが一般的に適用できることを示した。実験的および理論的に計算した小角X線散乱データをKratkyプロットの形で示し,重合体理論と自己回避歩行モデルに関して議論を行った。さらに,静電相互作用の影響を示し,計算機シミュレーションと「Flexible-meccano」から得られた立体配座集合の推定に関連させ,構造因子を得るために生理的条件下で得られた形状因子を用いる近似と同様に塩濃度により影響を受ける。Copyright 2018 Elsevier B.V., Amsterdam. All rights reserved. Translated from English into Japanese by JST.【JST・京大機械翻訳】

シソーラス用語： *タンパク質 ,  重合体 ,  形状因子 ,  モデル ,  計算機シミュレーション ,  単量体 ,  自己回避歩行 ,  *モデリング ,  静電相互作用 ,  構造因子 ,  *立体配座
準シソーラス用語： 粗粒子 ,  粗粒モデル ,  *モンテカルロシミュレーション ,  *粗視化 , 【Automatic Indexing@JST】

著者キーワード (5件)： 内在性無秩序蛋白質 ,  粗粒モデリング ,  モンテカルロシミュレーション ,  静電相互作用 ,  小角X線散乱

分類 (2件)： 蛋白質・ペプチド一般  (EB03010N) ,  分子構造  (EB03020Y)

タイトルに関連する用語 (7件)： 蛋白質 ,  立体配座 ,  アンサンブル ,  評価 ,  粗視化 ,  モデリング ,  モンテカルロシミュレーション