すい島regulomeブラウザ【JST・京大機械翻訳】

Mularoni Loris; Mularoni Loris; Ramos-Rodriguez Mireia; Pasquali Lorenzo; Pasquali Lorenzo; Pasquali Lorenzo

文献

J-GLOBAL ID：201802246139813890 整理番号：18A0790402

すい島regulomeブラウザ【JST・京大機械翻訳】

The Pancreatic Islet Regulome Browser

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資料名：
巻： 8 ページ： 13 発行年： 2017年
JST資料番号： U7071A ISSN： 1664-8021 資料種別：逐次刊行物 (A)
記事区分：原著論文発行国：スイス (CHE) 言語：英語 (EN)

すい島は,原発性機能がグルコースホメオスタシスを制御するものである外分泌膵臓に埋め込まれた高度に特殊化された組織である。したがって,膵島細胞の転写制御を理解することは,グルコース代謝障害の病因を解明するのに役立つ可能性がある。トランスクリプトームおよびエピゲノムデータの統合的計算解析により,ゲノムを横切る推定調節要素のゲノム座標の予測および非コード化ゲノムの組織特異的機能の解読が可能になる。ここでは,世界中で異なる研究室により産生された膵島エピゲノムおよびトランスクリプトームデータの迅速なアクセスおよび探索を可能にするツール,Isletレギュラーブラウザを提示する。現在インターネット上でアクセス可能であるか,あるいは局所的に設置される可能性がある。これにより,膵臓前駆細胞および成体ヒト膵島におけるエンハンサークラスター,伸長エンハンサーおよび転写因子結合部位と共に,遺伝子組換え型(GWAS)変異体,異なるクラスの調節要素を含む豊富な情報に対する相互作用的アクセスを提供することができる。このようなデータの統合と可視化は,組織特異的転写を駆動する調節ネットワークのより深い理解を可能にし,調節変異体の同定を誘導する可能性がある。このようなツールは,糖尿病を含むグルコース代謝関連形質における機能的ゲノミクス研究に対する主要なブーストを提供する膵島公開ゲノムデータセットへのアクセスを促進すると信じる。Copyright 2018 The Author(s). All rights reserved. Translated from English into Japanese by JST.【JST・京大機械翻訳】

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著者キーワード (5件)： , , , ,

分子・遺伝情報処理 , 遺伝子発現

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