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J-GLOBAL ID：201802246742715210   整理番号：18A0976403

肺疾患重症度の修飾遺伝子におけるDNAメチル化は嚢胞性線維症で変化する【JST・京大機械翻訳】

DNA methylation at modifier genes of lung disease severity is altered in cystic fibrosis

著者 (23件)： Magalhaes Milena (Laboratoire de Genetique de Maladies Rares, EA7402 Montpellier University, Montpellier, France) ,  Rivals Isabelle (Equipe de Statistique Appliquee-ESPCI ParisTech, PSL Research University-UMRS1158, Paris, France) ,  Claustres Mireille (Laboratoire de Genetique de Maladies Rares, EA7402 Montpellier University, Montpellier, France) ,  Claustres Mireille (Laboratoire de Genetique Moleculaire-CHU Montpellier, Montpellier, France) ,  Varilh Jessica (Laboratoire de Genetique de Maladies Rares, EA7402 Montpellier University, Montpellier, France) ,  Varilh Jessica (Laboratoire de Genetique Moleculaire-CHU Montpellier, Montpellier, France) ,  Thomasset Melodie (Laboratoire de Genetique de Maladies Rares, EA7402 Montpellier University, Montpellier, France) ,  Bergougnoux Anne (Laboratoire de Genetique de Maladies Rares, EA7402 Montpellier University, Montpellier, France) ,  Bergougnoux Anne (Laboratoire de Genetique Moleculaire-CHU Montpellier, Montpellier, France) ,  Mely Laurent (CRCM, Renee Sabran Hospital-CHU Lyon, Hyeres, France) ,  Leroy Sylvie (CRCM, Pasteur Hospital-CHU Nice, Nice, France) ,  Corvol Harriet (Sorbonne Universites, UPMC Univ Paris 06, Paris, France) ,  Corvol Harriet (INSERM U938-CRSA, Paris, France) ,  Corvol Harriet (APHP, Trousseau Hospital, Paris, France) ,  Guillot Loiec (Sorbonne Universites, UPMC Univ Paris 06, Paris, France) ,  Guillot Loiec (INSERM U938-CRSA, Paris, France) ,  Murris Marlene (CRCM, Larrey Hospital-CHU Toulouse, Toulouse, France) ,  Beyne Emmanuelle (Laboratoire de Genetique de Maladies Rares, EA7402 Montpellier University, Montpellier, France) ,  Beyne Emmanuelle (Laboratoire de Genetique Moleculaire-CHU Montpellier, Montpellier, France) ,  Caimmi Davide (CRCM, Arnaud de Villeneuve Hospital-CHU Montpellier, Montpellier, France) ,  Vachier Isabelle (CRCM, Arnaud de Villeneuve Hospital-CHU Montpellier, Montpellier, France) ,  Chiron Raphaeel (CRCM, Arnaud de Villeneuve Hospital-CHU Montpellier, Montpellier, France) ,  Sario Albertina De (Laboratoire de Genetique de Maladies Rares, EA7402 Montpellier University, Montpellier, France)
資料名： Clinical Epigenetics (Web)  (Clinical Epigenetics (Web))
巻： 9  号： 1  ページ： 19  発行年： 2017年 
JST資料番号： U7316A  ISSN： 1868-7083  資料種別： 逐次刊行物 (A)
記事区分： 原著論文  発行国： イギリス (GBR)  言語： 英語 (EN)

抄録/ポイント： 【背景】肺疾患進行は,嚢胞性線維症(CF)患者の間で可変であり,CFTR遺伝子におけるDNA突然変異,疾患調整遺伝子における多形性変異,および環境曝露に依存する。遺伝的因子の寄与は広く研究されているが,環境因子が肺疾患を調節する機構は不明である。このプロジェクトにおいて,(i)再反復ストレスはCF影響組織におけるエピゲノムを変化させ,(ii)疾患修飾遺伝子におけるDNAメチル化変異はCF患者における肺機能を調節すると仮定した。【結果】CFTRにおけるDNAメチル化,疾患原因遺伝子,および鼻上皮細胞における13の肺修飾遺伝子および48人のCF患者および24人の健常対照者からの全血液サンプルをプロファイリングした。肺疾患重症度により,p.Phe508del変異と≧18歳のCF患者ホモ接合を層別化した。DNAメチル化を亜硫酸水素塩と次世代配列決定によって測定した。DNAメチル化プロファイルは,75%の被験者を正しく分類することを可能にし,したがってCF特異的分子シグネチャを提供した。さらに,CF患者において,特異的遺伝子におけるDNAメチル化は同じ組織試料において高度に相関していた。CF細胞における遺伝子メチル化は疾患特異的トランス因子により共調節されることを示唆した。3つの遺伝子は,対照および/または肺重症度の群(鼻上皮サンプルにおけるHMOX1およびGSTM3)と比較して,CF患者において差別的にメチル化された。血液試料中のHMOX1とEDNRA。EDNRAにおける肺重症度とDNAメチル化の間の関連は,CF患者の独立したセットから血液サンプルで確認された。また,GSTM3におけるより低いDNAメチル化レベルは,嚢胞性線維症において保護効果を有する多形3-bp欠失であるGSTM3*B対立遺伝子と関連していた。結論:DNAメチル化レベルは,CF患者から鼻上皮と血液細胞サンプルで変化する。CFTRと13の肺疾患修飾遺伝子の分析は,DNAメチル化の変化が小さいことを示している:それらのいくつかは疾患の結果である;他の変化は,肺疾患重症度を全体的に調節する小さな発現変化をもたらす可能性がある。Copyright 2018 The Author(s). All rights reserved. Translated from English into Japanese by JST.【JST・京大機械翻訳】

シソーラス用語： 対立遺伝子 ,  患者 ,  *DNA【核酸】 ,  *メチル化 ,  上皮 ,  *遺伝子 ,  *遺伝 ,  *嚢胞性線維症 ,  上皮細胞 ,  突然変異 ,  *肺疾患 ,  保護作用
準シソーラス用語： 環境曝露 ,  *DNAメチル化 ,  *重症度 , 【Automatic Indexing@JST】

著者キーワード (9件)： DNAメチル化 ,  共メチル化 ,  鼻上皮細胞 ,  嚢胞性線維症 ,  修飾遺伝子 ,  肺機能 ,  多形 ,  次世代シークエンシング ,  ピロシークエンシング

分類 (3件)： 呼吸器の基礎医学  (GI01020H) ,  呼吸器の疾患  (GI03000Z) ,  分子遺伝学一般  (EC02010J)

引用文献 (41件)：

• Nat Rev Genet; Environmental epigenomics and disease susceptibility; RL Jirtle, MK Skinner; 8; 4; 2007; 253-62; 10.1038/nrg2045; CR1;
• Trends Genet; An integrated epigenetic and genetic approach to common human disease; HT Bjornsson, MD Fallin, AP Feinberg; 20; 8; 2004; 350-8; 10.1016/j.tig.2004.06.009; CR2;
• Ann N Y Acad Sci; Modifier genes in Mendelian disorders: the example of cystic fibrosis; GR Cutting; 1214; 2010; 57-69; 10.1111/j.1749-6632.2010.05879.x; CR3;
• Eur J Hum Genet; Best practice guidelines for molecular genetic diagnosis of cystic fibrosis and CFTR-related disorders-updated European recommendations; E Dequeker, M Stuhrmann, MA Morris, T Casals, C Castellani, M Claustres, H Cuppens, M des Georges, C Ferec, M Macek, PF Pignatti, H Scheffer, M Schwartz, M Witt, M Schwarz, E Girodon; 17; 1; 2009; 51-65; 10.1038/ejhg.2008.136; CR4;
• Am J Respir Cell Mol Biol; Respiratory epithelial gene expression in patients with mild and severe cystic fibrosis lung disease; JM Wright, CA Merlo, JB Reynolds, PL Zeitlin, JG Garcia, WB Guggino, MP Boyle; 35; 3; 2006; 327-36; 10.1165/rcmb.2005-0359OC; CR5;

タイトルに関連する用語 (5件)： 肺疾患 ,  重症度 ,  修飾遺伝子 ,  DNAメチル化 ,  嚢胞性線維症