文献

J-GLOBAL ID：201802246753371160   整理番号：18A1345929

過剰に短い毒素様蛋白質:薬物設計への近道【JST・京大機械翻訳】

Overlooked Short Toxin-Like Proteins: A Shortcut to Drug Design

著者 (3件)： Linial Michal (Department of Biological Chemistry, Silberman Institute of Life Sciences, The Hebrew University of Jerusalem, Jerusalem 91904, Israel) ,  Rappoport Nadav (Institute for Computational Health Sciences, UCSF, San Francisco, CA 94158, USA) ,  Ofer Dan (Department of Biological Chemistry, Silberman Institute of Life Sciences, The Hebrew University of Jerusalem, Jerusalem 91904, Israel)
資料名： Toxins (Web)  (Toxins (Web))
巻： 9  号： 11  ページ： 350  発行年： 2017年 
JST資料番号： U7286A  ISSN： 2072-6651  資料種別： 逐次刊行物 (A)
記事区分： 原著論文  発行国： スイス (CHE)  言語： 英語 (EN)

抄録/ポイント： 短い安定なペプチドは,新しい治療および生物学的類似体に対し大きな可能性を有する。システインに富む短い蛋白質は,コンパクトな構造で複数のジスルフィド架橋により特徴付けられる。これらの後生動物蛋白質の多くは処理され,折畳まれ,可溶性安定折畳みとして分泌される。これらの特性は海洋および陸上動物毒素の両方によって共有されている。これらの安定した短い蛋白質は,新薬開発のための有望な供給源である。大規模プロテオミクスデータベース上で訓練された機械学習モデルを用いて毒素様蛋白質(TOLIPs)を同定するために,ClanTox(動物毒素の分類装置)を開発した。昆虫プロテオームは,蛋白質革新のための豊富な供給源を提供する。従って,昆虫からの過剰な毒素様蛋白質(coined iTOLIPs)を探索した。4180の短い(<75のアミノ酸)分泌蛋白質のうち,379は高い信頼性を有するiTOLIPsとして予測された。バイオインフォマティクス,構造モデリング,データマイニング法に基づいて,予測iTOLIPsの最も有意なグループが抗菌活性を持つことを見出した。トップ予測配列の中で,抗真菌性を持つシロアリからの120のシロアリ遺伝子があった。昆虫抗微生物ペプチドの構造変化は,抗真菌特異性を有するデフェンシン折畳みの短いバージョンと類似性を示す。また,scorpionとconus毒素からイオンチャンネル阻害剤に強く類似する9つの蛋白質を同定した。さらに,機能的折畳みを多数の非特性化iTOLIPsに割り当てた。iTOLIPsを見出すための系統的アプローチは,薬物設計と革新的治療発見のための豊富なペプチド源を提供すると結論した。Copyright 2018 The Author(s) All rights reserved. Translated from English into Japanese by JST.【JST・京大機械翻訳】

シソーラス用語： 予測 ,  アミノ酸 ,  ペプチド ,  遺伝子 ,  抗細菌作用 ,  *毒素 ,  折畳み ,  真菌類 ,  治療法 ,  可溶性 ,  キャラクタリゼーション ,  プロテオーム ,  脂肪族アミン ,  チオール ,  脂肪族カルボン酸 ,  含硫アミノ酸 ,  第一アミン
準シソーラス用語： バイオインフォマティクス ,  特異性 , 【Automatic Indexing@JST】

著者キーワード (10件)： 神経毒 ,  蛋白質ファミリー ,  ジスルフィド結合 ,  抗菌ペプチド ,  イオンチャネル阻害剤 ,  Clantox ,  完全プロテオーム ,  比較プロテオミクス ,  機械学習 ,  昆虫

分類 (2件)： 遺伝子発現  (EC02040Q) ,  微生物の生化学  (EG03020N)

物質索引 (1件)： システイン

引用文献 (85件)：

• Adermann, K.; John, H.; Standker, L.; Forssmann, W.G. Exploiting natural peptide diversity: Novel research tools and drug leads. Curr. Opin. Biotechnol. 2004, 15, 599-606.
• Alonso, D.; Khalil, Z.; Satkunanthan, N.; Livett, B.G. Drugs from the sea: Conotoxins as drug leads for neuropathic pain and other neurological conditions. Mini Rev. Med. Chem. 2003, 3, 785-787.
• King, G.F. Venoms as a platform for human drugs: Translating toxins into therapeutics. Expert Opin. Biol. Ther. 2011, 11, 1469-1484.
• Proksch, P.; Edrada, R.; Ebel, R. Drugs from the seas-current status and microbiological implications. Appl. Microbiol. Biotechnol. 2002, 59, 125-134.
• Bock, J.E.; Gavenonis, J.; Kritzer, J.A. Getting in shape: Controlling peptide bioactivity and bioavailability using conformational constraints. ACS Chem. Biol. 2013, 8, 488-499.

タイトルに関連する用語 (3件)： 毒素 ,  蛋白質 ,  薬物設計