文献

J-GLOBAL ID：201802246768434378   整理番号：18A0965528

低分子RNAプロファイリングと分解酵素分析はナンキンマメ胚形成と初期さや発生におけるマイクロRNAの調節を明らかにする【JST・京大機械翻訳】

Small RNA profiling and degradome analysis reveal regulation of microRNA in peanut embryogenesis and early pod development

著者 (11件)： Gao Chao (Biotechnology Research Center, Shandong Academy of Agricultural Sciences, Shandong Provincial Key Laboratory of Crop Genetic Improvement, Ecology and Physiology, Jinan, People’s Republic of China) ,  Wang Pengfei (Biotechnology Research Center, Shandong Academy of Agricultural Sciences, Shandong Provincial Key Laboratory of Crop Genetic Improvement, Ecology and Physiology, Jinan, People’s Republic of China) ,  Zhao Shuzhen (Biotechnology Research Center, Shandong Academy of Agricultural Sciences, Shandong Provincial Key Laboratory of Crop Genetic Improvement, Ecology and Physiology, Jinan, People’s Republic of China) ,  Zhao Chuanzhi (Biotechnology Research Center, Shandong Academy of Agricultural Sciences, Shandong Provincial Key Laboratory of Crop Genetic Improvement, Ecology and Physiology, Jinan, People’s Republic of China) ,  Xia Han (Biotechnology Research Center, Shandong Academy of Agricultural Sciences, Shandong Provincial Key Laboratory of Crop Genetic Improvement, Ecology and Physiology, Jinan, People’s Republic of China) ,  Hou Lei (Biotechnology Research Center, Shandong Academy of Agricultural Sciences, Shandong Provincial Key Laboratory of Crop Genetic Improvement, Ecology and Physiology, Jinan, People’s Republic of China) ,  Ju Zheng (Department of Food Biotechnology, College of Food Science and Nutritional Engineering, China Agricultural University, Beijing, People’s Republic of China) ,  Zhang Ye (Biotechnology Research Center, Shandong Academy of Agricultural Sciences, Shandong Provincial Key Laboratory of Crop Genetic Improvement, Ecology and Physiology, Jinan, People’s Republic of China) ,  Li Changsheng (Biotechnology Research Center, Shandong Academy of Agricultural Sciences, Shandong Provincial Key Laboratory of Crop Genetic Improvement, Ecology and Physiology, Jinan, People’s Republic of China) ,  Wang Xingjun (Biotechnology Research Center, Shandong Academy of Agricultural Sciences, Shandong Provincial Key Laboratory of Crop Genetic Improvement, Ecology and Physiology, Jinan, People’s Republic of China) ,  Wang Xingjun (College of Life Sciences, Shandong Normal University, Jinan, People’s Republic of China)
資料名： BMC Genomics (Web)  (BMC Genomics (Web))
巻： 18  号： 1  ページ： 220  発行年： 2017年 
JST資料番号： U7048A  ISSN： 1471-2164  資料種別： 逐次刊行物 (A)
記事区分： 原著論文  発行国： イギリス (GBR)  言語： 英語 (EN)

抄録/ポイント： 【背景】典型的な地理的植物として,ナンキンマメ胚発生と莢発生は,多くの遺伝子調節経路を含む複雑な過程であり,適切なホルモンレベルによって制御される。マイクロRNA(miRNA)は転写後遺伝子調節に不可欠な役割を果たす小さい非コードRNAである。最近,ナンキンマメmiRNAの同定と特性化が記述されている。しかしながら,miRNAがナンキンマメ胚発生の調節に関与するかどうかは,まだ調査されていない。【結果】本研究において,異なる発育段階のナンキンマメ初期豆莢からの小RNAおよび分解ドームライブラリーを構築し,配列決定した。全部で70の既知および24の新規miRNAファミリーを発見した。それらの間で,16のmiRNAファミリーはlegume特異的であり,12のファミリーはナンキンマメ特異的であった。30の既知および10の新規miRNAファミリーは,莢発生の間に差別的に発現した。加えて,115の標的遺伝子は,分解ドーム配列決定によって47のmiRNAファミリーのために同定された。ナンキンマメに特異的ないくつかの新しい標的が見出され,5′cDNA末端のRNAリガーゼ仲介迅速増幅(RLM5′-RACE)によりさらに検証された。さらに,いくつかの標的遺伝子の無傷および全転写産物のプロファイリング分析を行い,SPL(miR156/157),NAC(miR164),PPRP(miR167およびmiR1088),AP2(miR172)およびGRF(miR396)が,それぞれ初期さや発生時に活発に調節されることを示した。結論:多数のmiRNAとそれらの関連する標的遺伝子は,深い塩基配列決定を通して同定された。これらの知見はナンキンマメ豆莢におけるmiRNA仲介調節経路に関する新しい情報を提供し,これはナンキンマメ胚と初期莢発生を支配する分子機構の包括的理解に寄与するであろう。Copyright 2018 The Author(s). All rights reserved. Translated from English into Japanese by JST.【JST・京大機械翻訳】

シソーラス用語： *胚発生 ,  成長段階 ,  キャラクタリゼーション ,  *ナンキンマメ ,  ヌクレオチド配列 ,  cDNA ,  遺伝的調節 ,  ホルモン ,  *リアーゼ
準シソーラス用語： 分子機構 ,  転写産物 ,  標的遺伝子 ,  *マイクロRNA ,  *プロファイリング ,  *低分子RNA , 【Automatic Indexing@JST】

著者キーワード (7件)： ハイスループットシークエンシング ,  ナンキンマメ ,  miRNA ,  ホルモン ,  光 ,  胚発生 ,  PODの開発

分類 (4件)： 遺伝子発現  (EC02040Q) ,  遺伝子の構造と化学  (EC02020U) ,  植物生理学一般  (EH02010Y) ,  核酸一般  (EB04010U)

引用文献 (54件)：

• Am J Bot; Arachis hypogaea. aerial flower and subterranean fruit; B Smith; 37; 10; 1950; 802-15; 10.2307/2437758; CR1;
• Peanut Sci; Photoperiodic response of peanut species 1; H Stalker, J Wynne; 10; 2; 1983; 59-62; 10.3146/i0095-3679-10-2-4; CR2;
• Ann Bot; Pod formation and its geotropic orientation in the peanut, Arachis hypogaea L., in relation to light and mechanical stimulus; E Zamski, M Ziv; 40; 1975; 631-6; 10.1093/oxfordjournals.aob.a085173; CR3;
• Ann Bot; Photomorphogenesis of gynophore, pod and embryo in peanut, Arachis hypogaea L; M Ziv; 48; 1981; 353-9; 10.1093/oxfordjournals.aob.a086133; CR4;
• Plant Sci Lett; The influence of light quality on peanut (Arachis hypogaea L.) gynophore pod and embryo development in vitro; M Ziv, J Sager; 34; 1984; 211-8; 10.1016/0304-4211(84)90144-5; CR5;

タイトルに関連する用語 (9件)： 低分子RNA ,  プロファイリング ,  分解 ,  酵素分析 ,  ナンキンマメ ,  胚形成 ,  初期 ,  マイクロRNA ,  調節