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J-GLOBAL ID：201802246999704541   整理番号：18A0467143

サポートベクトルマシンを用いたRNAの柔軟性のためのB因子プロフィルの予測【Powered by NICT】

B-factor profile prediction for RNA flexibility using support vector machines

著者 (6件)： Guruge Ivantha (School of Information and Communication Technology and Institue for Glycomics, Griffith University, Parklands Drive, Southport, Queensland, 4215, Australia) ,  Taherzadeh Ghazaleh (School of Information and Communication Technology and Institue for Glycomics, Griffith University, Parklands Drive, Southport, Queensland, 4215, Australia) ,  Zhan Jian (School of Information and Communication Technology and Institue for Glycomics, Griffith University, Parklands Drive, Southport, Queensland, 4215, Australia) ,  Zhou Yaoqi (School of Information and Communication Technology and Institue for Glycomics, Griffith University, Parklands Drive, Southport, Queensland, 4215, Australia) ,  Yang Yuedong (School of Information and Communication Technology and Institue for Glycomics, Griffith University, Parklands Drive, Southport, Queensland, 4215, Australia) ,  Yang Yuedong (School of Data and Computer Science, Sun Yat-sen University, Guangzhou, 510275, China)
資料名： Journal of Computational Chemistry  (Journal of Computational Chemistry)
巻： 39  号： 8  ページ： 407-411  発行年： 2018年 
JST資料番号： C0111B  ISSN： 0192-8651  CODEN： JCCHDD  資料種別： 逐次刊行物 (A)
記事区分： 原著論文  発行国： アメリカ合衆国 (USA)  言語： 英語 (EN)

抄録/ポイント： 構造化生体分子の柔軟性を決定するそれらの生物学的機能を理解するために重要である。柔軟性の定量的測定は原子Debye-Waller因子あるいは温度B因子である。ほとんどの既存の研究は,蛋白質とその予測の温度B因子に限定されている。リボソームRNAの温度B因子を予測することを試みた唯一の方法。ここで著者らは,RNAの温度B因子の予測における機械学習技術を開発し,比較した。サポートベクトルマシンに基づいて最良のモデルは,独立した試験のための5倍交差検証0.50 0.51でPearsonの補正係数を得た。性能の解析モデルは,rRNA,tRNA,および蛋白質結合RNA上の最良の性能を持ち,特に長鎖のことを示している。サーバであるhttp://sparks lab.org/server/RNAflexで利用可能である。Copyright 2018 Wiley Publishing Japan K.K. All Rights reserved. Translated from English into Japanese by JST.【Powered by NICT】

シソーラス用語： tRNA ,  rRNA ,  タンパク質 ,  *柔軟性 ,  タンパク質結合 ,  *RNA【核酸】 ,  解析モデル ,  長鎖 ,  生物活性 ,  構造形成 ,  *サポートベクトルマシン ,  *ベクトル
準シソーラス用語： 機械学習技術 ,  生体分子 ,  *B因子 , 【Automatic Indexing@JST】

著者キーワード (3件)： RNAの柔軟性 ,  温度B因子 ,  支援ベクトル回帰

分類 (2件)： 分子・遺伝情報処理  (JE15040B) ,  分子構造  (EB03020Y)

タイトルに関連する用語 (5件)： サポートベクトルマシン ,  RNA ,  B因子 ,  プロフィル ,  予測