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J-GLOBAL ID：201802247096960740   整理番号：18A1955444

バイオインフォマティクスに基づくアサリのmicroRNAsとその標的予測【JST・京大機械翻訳】

Prediction of microRNAs and Their Targets Using Bioinformatics in Porphyra yezoensis

著者 (7件)： Yin Xugang (山西大学生命科学学院,山西太原,030006) ,  Feng Jia (山西大学生命科学学院,山西太原,030006) ,  Lv Junping (山西大学生命科学学院,山西太原,030006) ,  Liu Qi (山西大学生命科学学院,山西太原,030006) ,  Nan Fangru (山西大学生命科学学院,山西太原,030006) ,  Xie Shulian (山西大学生命科学学院,山西太原,030006) ,  Gao Fan (山西大学生命科学学院,山西太原,030006)
資料名： Shanxi Nongye Kexue  (Shanxi Nongye Kexue)
巻： 46  号： 8  ページ： 1239-1243,1257  発行年： 2018年 
JST資料番号： C3364A  ISSN： 1002-2481  資料種別： 逐次刊行物 (A)
記事区分： 原著論文  発行国： 中国 (CHN)  言語： 中国語 (ZH)

抄録/ポイント： 現在、モデル紅藻としてのフジノリは日増しに厳しい生存危機に直面している。非コードRNAが媒介する遺伝子後転写レベルの調節は、ハクサイの資源の保護と開発にとって非常に重要である。BLASTnとMireapソフトウェアを利用して、合計5本の新しい斑紫菜miRNAsを予測し、TargetFinderツールを用いて、5本のノリの生長と発育及び代謝に関連するターゲット遺伝子を予測し、また59本の未知機能の標的部位を予測した。ClustalWとWebLoGOの分析は,植物間保存性を示した。ClustalW結合MEGAのmiR164ファミリーの進化結果により、pre-miR164sと種の進化が非同期であり、進化のランダム性と配列の多様性を有することが明らかになった。研究結果により、ハクサイのmiRNAs及びそのターゲット情報を豊富に豊かにし、ハクサイの後転写レベルの分子選別及び機能の開発と利用に基礎を築いた。Data from Wanfang. Translated by JST.【JST・京大機械翻訳】

シソーラス用語： *アサリ ,  遺伝子 ,  ソフトウェア ,  紅藻類 ,  ハクサイ
準シソーラス用語： ランダム性 ,  非翻訳RNA ,  標的予測 ,  *バイオインフォマティクス , 【Automatic Indexing@JST】

分類 (2件)： 分子遺伝学一般  (EC02010J) ,  遺伝子発現  (EC02040Q)

タイトルに関連する用語 (3件)： バイオインフォマティクス ,  アサリ ,  標的予測