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J-GLOBAL ID：201802247273051351   整理番号：18A1035559

細菌細胞壁収集の主座標解析支援クロマトグラフィー分析:ロバストな分類アプローチ【JST・京大機械翻訳】

Principal coordinate analysis assisted chromatographic analysis of bacterial cell wall collection: A robust classification approach

著者 (2件)： Kumar Keshav (Laboratory for Molecular Infection Medicine Sweden, Department of Molecular Biology, Umea Centre for Microbial Research, Umea University, 90187 Umea, Sweden) ,  Cava Felipe (Laboratory for Molecular Infection Medicine Sweden, Department of Molecular Biology, Umea Centre for Microbial Research, Umea University, 90187 Umea, Sweden)
資料名： Analytical Biochemistry  (Analytical Biochemistry)
巻： 550  ページ： 8-14  発行年： 2018年 
JST資料番号： H0177B  ISSN： 0003-2697  資料種別： 逐次刊行物 (A)
記事区分： 原著論文  発行国： オランダ (NLD)  言語： 英語 (EN)

抄録/ポイント： 本研究では,ペプチドグリカン試料のクロマトグラフィーデータセットを分類するためのロバストモデルを開発するために,主座標分析(PCoA)を導入した。PCoAは,入力として非類似性行列を用いることにより,データ集合に存在する不均一性を捉える。したがって,原理的には,細菌のペプチドグリカン組成の微妙な違いを捉えることさえでき,細菌収集を分類し,さらに生物学的および臨床的研究のための新規細胞壁標的を同定するためのよりロバストで迅速なアプローチを提供することができる。提案したアプローチの有用性を,2種類の細菌収集物を分析することにより成功裏に実証した。最初のセットは,Alphaproteobacteriaの異なるサブクラスに属するペプチドグリカン試料から成っていた。一方,ケモメトリックス分析のために比較的複雑な第二のセットは,異なる野生型Vibrio Choleraeとそのペプチドグリカン組成の微妙な違いを持つその変異体から成る。本研究は,微妙な差異を有するクロマトグラフペプチドグリカン試料のクロマトグラフデータセットを分類できる有用なアプローチを明確に提案する。さらに,本研究は,PCoAが任意のデータ解析ワークフローにおける選択の方法であることを明確に示唆した。Copyright 2018 Elsevier B.V., Amsterdam. All rights reserved. Translated from English into Japanese by JST.【JST・京大機械翻訳】

シソーラス用語： データ解析 ,  野生型 ,  ペプチドグリカン ,  *細胞壁 ,  *ロバスト性 ,  Vibrio ,  不均一性 ,  *細菌 ,  主成分分析 ,  ワークフロー ,  *クロマトグラフィー ,  ケモメトリックス
準シソーラス用語： αプロテオバクテリア綱 ,  非類似性 ,  主座標分析 , 【Automatic Indexing@JST】

著者キーワード (6件)： 主座標解析 ,  分類 ,  ペプチドグリカン ,  クロマトグラフィー ,  主成分分析 ,  データ不均一性

分類 (2件)： 微生物の生化学  (EG03020N) ,  生物科学研究法一般  (EA03010K)

タイトルに関連する用語 (9件)： 細菌 ,  細胞壁 ,  収集 ,  座標解析 ,  支援 ,  クロマトグラフィー ,  分析 ,  ロバスト ,  分類