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J-GLOBAL ID：201802247285531739   整理番号：18A0788333

あなたの敵を知る:ウイルスRNAにおける機能的RNA構造を予測するための生物情報学的アプローチの成功【JST・京大機械翻訳】

Know Your Enemy: Successful Bioinformatic Approaches to Predict Functional RNA Structures in Viral RNAs

著者 (2件)： Lim Chun Shen (Department of Biochemistry, School of Biomedical Sciences, University of Otago) ,  Brown Chris M. (Department of Biochemistry, School of Biomedical Sciences, University of Otago)
資料名： Frontiers in Microbiology (Web)  (Frontiers in Microbiology (Web))
巻： 8  ページ： 2582  発行年： 2017年 
JST資料番号： U7080A  ISSN： 1664-302X  資料種別： 逐次刊行物 (A)
記事区分： 原著論文  発行国： スイス (CHE)  言語： 英語 (EN)

抄録/ポイント： 構造化RNA要素はウイルス複製,転写及び翻訳を制御する可能性があり,それらの異なる特徴は新しい抗ウイルス戦略により利用されている。ウイルスRNAエレメントは実験的及び計算的解析の組合せを用いて発見され続けている。しかしながら,特に深いウイルスRNA配列決定,ウイルスおよびメタゲノムからの配列データの豊富さは,重要な発見ツールとして使用される計算アプローチを必要とする。本レビューにおいて,ウイルスゲノムにおける機能的RNA要素を発見するために使用される実用的アプローチについて述べた。新しいおよび新興のウイルスにおける成功ストーリーに加えて,これらのアプローチは,ヒト免疫不全ウイルス,C型肝炎ウイルス,インフルエンザおよびデングウイルスのような良く研究されたウイルスのいくつかの驚くべき新しい特徴を明らかにした。いくつかの顕著な発見は,多様なウイルスゲノム配列の新しい比較分析により促進された。重要なことに,符号化および非符号化領域に埋め込まれたRNA要素を見出すための比較アプローチは異なる。計算機パワーの指数関数的成長により,単一シーケンス上でのステムループ予測から切れ刃3D予測,およびコマンドラインからユーザフレンドリーウェブインタフェイスへと進展した。これらの進歩にもかかわらず,多くの強力で,ユーザに優しい予測ツールと資源は,ウイルス学コミュニティによって活用されている。Copyright 2018 The Author(s). All rights reserved. Translated from English into Japanese by JST.【JST・京大機械翻訳】

シソーラス用語： *RNA【核酸】 ,  *予測 ,  ウイルス複製 ,  符号化 ,  インフルエンザ ,  *ウイルス ,  三次元 ,  C型肝炎ウイルス ,  コミュニティ ,  HIV【ウイルス】
準シソーラス用語： ゲノム配列 ,  デングウイルス ,  ウイルスゲノム ,  *バイオインフォマティクス ,  *ウイルスRNA , 【Automatic Indexing@JST】

著者キーワード (8件)： バイオインフォマティクス ,  シス調節要素 ,  比較ゲノミクス ,  非コードRNA ,  擬ノット ,  RNA構造予測 ,  RNAウイルス ,  構造モチーフ

分類 (1件)： ウイルスの生化学  (EG04030F)

タイトルに関連する用語 (5件)： ウイルスRNA ,  RNA構造 ,  予測 ,  生物情報学 ,  成功