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J-GLOBAL ID：201802247625612515   整理番号：18A1611794

倍数体とその祖先の集団遺伝学と進化への洞察【JST・京大機械翻訳】

Insights into population genetics and evolution of polyploids and their ancestors

著者 (11件)： Jighly Abdulqader (Agriculture Victoria, AgriBio, Centre for AgriBiosciences, Bundoora, Vic., Australia) ,  Jighly Abdulqader (School of Applied Systems Biology, La Trobe University, Bundoora, Vic., Australia) ,  Lin Zibei (Agriculture Victoria, AgriBio, Centre for AgriBiosciences, Bundoora, Vic., Australia) ,  Forster John W. (Agriculture Victoria, AgriBio, Centre for AgriBiosciences, Bundoora, Vic., Australia) ,  Forster John W. (School of Applied Systems Biology, La Trobe University, Bundoora, Vic., Australia) ,  Spangenberg German C. (Agriculture Victoria, AgriBio, Centre for AgriBiosciences, Bundoora, Vic., Australia) ,  Spangenberg German C. (School of Applied Systems Biology, La Trobe University, Bundoora, Vic., Australia) ,  Hayes Ben J. (Agriculture Victoria, AgriBio, Centre for AgriBiosciences, Bundoora, Vic., Australia) ,  Hayes Ben J. (Queensland Alliance for Agriculture and Food Innovation, Centre for Animal Science, University of Queensland, St Lucia, Qld, Australia) ,  Daetwyler Hans D. (Agriculture Victoria, AgriBio, Centre for AgriBiosciences, Bundoora, Vic., Australia) ,  Daetwyler Hans D. (School of Applied Systems Biology, La Trobe University, Bundoora, Vic., Australia)
資料名： Molecular Ecology Resources  (Molecular Ecology Resources)
巻： 18  号： 5  ページ： 1157-1172  発行年： 2018年 
JST資料番号： W2685A  ISSN： 1755-098X  資料種別： 逐次刊行物 (A)
記事区分： 原著論文  発行国： アメリカ合衆国 (USA)  言語： 英語 (EN)

抄録/ポイント： 倍数体ゲノム(POLYSIM)のための最初の包括的シミュレータを開発し,大規模シミュレーションを行うことによりその価値を実証し,倍数体の進化に及ぼす異なる個体群パラメータの影響を調べた。POLYSIMは,倍数性,個体群サイズまたはシミュレートされた遺伝子座の数に関して制限されていない。著者らの過程は,倍数体祖先からの倍数体の進化,多染色体遺伝,近交系,倍数体における組換え率変化,および低から高倍数体への遺伝子流動を考慮した。異なる模擬シナリオ間の分離単一ヌクレオチド多型,マイナー対立遺伝子頻度,ヘテロ接合性,R2及び平均キンシップ関連性の数を比較し,倍数体種からの実際のデータと比較した。予想されたように,異質四倍体集団は,個体群サイズが一定に保たれたとき,それらの祖先の二倍体と差異を示さず,サブゲノム間に遺伝子流動または多価(MV)対合がなかった。同質四倍体個体群は,ほとんどのパラメータに対する祖先からの有意差を示し,異質四倍体より速い祖先個体群から分岐した。同質四倍体は,異質四倍体と比較して,有意に高いヘテロ接合性,関連性および拡張連鎖不均衡を持つことができる。興味あることに,自己四倍体は自己化率の増加と個体群サイズの減少により敏感であった。mV形成は異質四倍体サブゲノムを均一化できるが,この均質化は以前に提案されたよりも高いMV速度を必要とする。著者らの結果は,倍数体個体群進化動力学を理解するための最初の構築ブロックと考えることができる。POLYSIMは,定量的遺伝学的ツールと組み合わせて,これらの種におけるゲノム選択または育種計画設計の力を調べるために用いることができる,経験的個体群を模倣する多様な倍数体をシミュレートするために用いることができる。Copyright 2018 Wiley Publishing Japan K.K. All rights reserved. Translated from English into Japanese by JST.【JST・京大機械翻訳】

シソーラス用語： 二倍体 ,  一塩基多型 ,  シミュレータ ,  ゲノム ,  個体群 ,  *遺伝 ,  遺伝子頻度 ,  シミュレーション ,  *倍数体 ,  四倍体
準シソーラス用語： 連鎖不平衡 ,  ヘテロ接合性 ,  遺伝子流動 ,  近交系 ,  多倍数性 , 【Automatic Indexing@JST】

著者キーワード (4件)： 進化 ,  倍数性 ,  集団遺伝学 ,  シミュレーション

分類 (1件)： 遺伝子の構造と化学  (EC02020U)

タイトルに関連する用語 (4件)： 倍数体 ,  集団遺伝学 ,  進化 ,  洞察