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J-GLOBAL ID：201802247910433580   整理番号：18A1104075

Geobacter sulfurreducensトリヘムチトクローム間の分子相互作用と腐植物質に対する酸化還元活性類似体【JST・京大機械翻訳】

Molecular interactions between Geobacter sulfurreducens triheme cytochromes and the redox active analogue for humic substances

著者 (7件)： Dantas Joana M. (UCIBIO-Requimte, Departamento de Quimica, Faculdade de Ciencias e Tecnologia, Universidade NOVA de Lisboa, Campus Caparica, 2829-516 Caparica, Portugal) ,  Ferreira Marisa R. (UCIBIO-Requimte, Departamento de Quimica, Faculdade de Ciencias e Tecnologia, Universidade NOVA de Lisboa, Campus Caparica, 2829-516 Caparica, Portugal) ,  Catarino Teresa (Instituto de Tecnologia Quimica e Biologica - Antonio Xavier, Universidade Nova de Lisboa, Av. da Republica EAN, 2780-157 Oeiras, Portugal) ,  Catarino Teresa (Departamento de Quimica, Faculdade de Ciencias e Tecnologia, FCT, Universidade Nova de Lisboa, 2829-516 Caparica, Portugal) ,  Kokhan Oleksandr (Department of Chemistry and Biochemistry, James Madison University, Harrisonburg, VA 22807, USA) ,  Pokkuluri P. Raj (Biosciences Division, Argonne National Laboratory, Lemont, IL 60439, USA) ,  Salgueiro Carlos A. (UCIBIO-Requimte, Departamento de Quimica, Faculdade de Ciencias e Tecnologia, Universidade NOVA de Lisboa, Campus Caparica, 2829-516 Caparica, Portugal)
資料名： Biochimica et Biophysica Acta  (Biochimica et Biophysica Acta)
巻： 1859  号： 8  ページ： 619-630  発行年： 2018年 
JST資料番号： B0207A  ISSN： 0005-2728  CODEN： BBBMBS  資料種別： 逐次刊行物 (A)
記事区分： 原著論文  発行国： オランダ (NLD)  言語： 英語 (EN)

抄録/ポイント： 細菌Geobacter sulfurreducensは,フミン酸に対するモデルであるフミン物質またはアントラキノン-2,6-ジスルホナート(AQDS)のキノン部分に電子を移動させることができる。AQDS(AH_2QDS)の還元型は,G.sulfurreducensによるエネルギー源としても使用できる。フミン物質のこのような双方向利用は,Fe(III)富化環境におけるこれらの細菌に対する競争優位性を与える。以前の研究により,G.sulfurreducens由来のトリヘムチトクロームPpcAはフミン物質類似体に対して二機能性挙動を有することを示した。それはAQDSを減少させることができるが,蛋白質もAH_2QDSによって減少することができる。ストップトフロー速度論測定を用いて,G.sulfurreducens(PpcB,PpcD及びPpcE)におけるPpcAファミリーの他のペリプラズムメンバーも同じ挙動を示すことを実証した。電子移動の程度は熱力学的に制御され,チトクロームの還元に有利に働く。AQDS量の増加による13C,15N濃縮試料のNMRスペクトルは,チトクロームの化学シフトシグナルの摂動を示した。チトクローム骨格NHと1Hヘムメチル信号における化学シフト摂動を用いて,AQDSとの相互作用領域をマッピングし,各蛋白質がヘムIVの近傍(PpcB,PpcD及びPpcE)及びI(PpcE)の明確な正表面領域を通して低親和性結合複合体を形成することを示した。NMR化学シフト摂動を用いて行ったドッキング計算は,AQDSと各チトクローム間の相互作用を分子レベルでモデル化することを可能にした。全体として,得られた結果はG.sulfurreducensにおけるフミン物質の微生物呼吸を合理化するための重要な構造-機能的関係を提供した。Copyright 2018 Elsevier B.V., Amsterdam. All rights reserved. Translated from English into Japanese by JST.【JST・京大機械翻訳】

シソーラス用語： 摂動 ,  キノン ,  細菌 ,  化学シフト ,  *酸化還元反応 ,  NMR【磁気共鳴】 ,  ドッキング ,  速度論 ,  *分子間相互作用 ,  *チトクローム ,  モデリング ,  電子移動 ,  複合体
準シソーラス用語： *Geobacter ,  *Geobacter sulfurreducens , 【Automatic Indexing@JST】

著者キーワード (6件)： Geobacter ,  腐植物質 ,  AQP ,  マルチヘムチトクローム ,  NMR ,  電子移動

分類 (2件)： 生体エネルギー論一般  (EB10010X) ,  酵素一般  (EB09010D)

タイトルに関連する用語 (5件)： Geobacter ,  分子相互作用 ,  腐植物質 ,  酸化還元活性 ,  類似体