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J-GLOBAL ID：201802248081790602   整理番号：18A0340079

5テトラペプチドの立体配座の系統的探索と分割ペプチド構造の予測のための戦略を克服する【Powered by NICT】

Systematic search of conformations of five tetrapeptides and a divide and conquer strategy for the predictions of peptide structures

著者 (2件)： Yang Bing (Hefei National Laboratory for Physical Sciences at Microscale & CAS Key Laboratory of Strongly-Coupled Quantum Matter Physics, Department of Physics, University of Science and Technology of China, Hefei 230026, China) ,  Lin Zijing (Hefei National Laboratory for Physical Sciences at Microscale & CAS Key Laboratory of Strongly-Coupled Quantum Matter Physics, Department of Physics, University of Science and Technology of China, Hefei 230026, China)
資料名： Computational & Theoretical Chemistry  (Computational & Theoretical Chemistry)
巻： 1108  ページ： 40-49  発行年： 2017年 
JST資料番号： W2300A  ISSN： 2210-271X  資料種別： 逐次刊行物 (A)
記事区分： 原著論文  発行国： オランダ (NLD)  言語： 英語 (EN)

抄録/ポイント： 生体分子の立体配座は,それらの特性研究のための基礎であるとペプチド構造の予測は,生命科学における高い関心が持たれているが,実際には非常に困難である。GGGG,GVGG,GTGG,GGYGとGSDG,五テトラペプチドのポテンシャルエネルギー面を,内部単結合回転異性体のすべての組合せを考慮してここで完全に探索した。全ての重要なテトラペプチド配座異性体の構造的特徴を詳細に解析し,五個の水素結合配置を特性化した。テトラペプチドとその構成ジペプチドの立体配座の間の密接な結合を見出した。親ジペプチド立体配座を融着することにより,全ての重要なテトラペプチド配座異性体を発見するための方法を推論した。スプライシング法は効率的で,試験した全てのテトラペプチドの信頼できることを検証した。ペンタグリシンへのスプライシング法の適用は文献よりもはるかに良好な結果を提供した。も蛋白質に高度に占有されている鎖,螺旋,および回転のような特徴的な二次構造を有する立体配座を得た。スプライシング法のさらなる開発は,信頼性があり効率的なアミノ酸配列に基づく蛋白質構造予測方法を見出すために有望な方法である。Copyright 2018 Elsevier B.V., Amsterdam. All rights reserved. Translated from English into Japanese by JST.【Powered by NICT】

シソーラス用語： タンパク質 ,  構造特性 ,  ジペプチド ,  *立体配座 ,  アミノ酸配列 ,  キャラクタリゼーション ,  水素結合 ,  ポテンシャルエネルギー面 ,  二次構造
準シソーラス用語： 蛋白質構造予測 ,  配座異性体 ,  回転異性体 ,  生体分子 ,  *ペプチド構造 ,  *テトラペプチド , 【Automatic Indexing@JST】

著者キーワード (5件)： 構造予測 ,  ポテンシャルエネルギー面 ,  水素結合 ,  二次構造 ,  計算効率

分類 (1件)： 分子構造  (EB03020Y)

タイトルに関連する用語 (7件)： テトラペプチド ,  立体配座 ,  系統 ,  探索 ,  ペプチド構造 ,  予測 ,  戦略