アシドバクテリアにおけるホパノイド生産の生物学的および遺伝子型決定【JST・京大機械翻訳】

Damste Jaap S. Sinninghe; Damste Jaap S. Sinninghe; Rijpstra W. Irene C.; Dedysh Svetlana N.; Foesel Baerbel U.; Villanueva Laura

文献

J-GLOBAL ID：201802248349341492 整理番号：18A0786787

アシドバクテリアにおけるホパノイド生産の生物学的および遺伝子型決定【JST・京大機械翻訳】

Pheno- and Genotyping of Hopanoid Production in Acidobacteria

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資料名：
巻： 8 ページ： 968 発行年： 2017年
JST資料番号： U7080A ISSN： 1664-302X 資料種別：逐次刊行物 (A)
記事区分：原著論文発行国：スイス (CHE) 言語：英語 (EN)

ホパノイドは異なる細菌グループにより合成された五環トリテルペノイド脂質である。C-2及びC-3位(HPNP及びhpnR)におけるメチル化をコードする遺伝子が細菌ドメインに広く存在し,特異的バイオマーカーとしての利用を無効にするまで,メチル化ホパノイドは藍藻類及び好気性メタン資化菌により排他的に合成されると信じられた。これらの遺伝子は,Acidobacterium Caのゲノムで検出されている。Korori versatiisは「ホパノイドの合成に関する知識」と「Acobacteriaの他のメンバーにおけるそれらの生合成経路の遺伝子の存在」については限られている。Rohmer反応を用いて,C_30ホペンおよびC_30+バクテリオホパンポリオール(BHP)の存在に対して,7つのAcidobacteria亜分画(SD1,3,4,6,8,10および23)の38の異なる株を分析し,SD1およびSD3の全ての株においてBHPおよび/またはC_30ホペンが検出されたが,SD4では検出されなかった(Chloracidobacterium therthermoum,6,8,10および23)。これは,培養されたAcidobacteriaの31の利用可能な全ゲノムにおけるホパノイド生合成に必要な遺伝子の存在と良く一致し,全ゲノムは,最終的にファルネシル二リン酸経路に関与する酵素をコードしているが,ほとんど全ての株において,四環化BHPのみが検出された。3株は,5官能化BHPの可変相対存在量(45%まで)を含んだ。低い(<10%)量ではあるが,「Ca.K.versatiis」のみがメチル化されたホパノイド(すなわち,2,3-ジメチルビスホモホパノール)を含んでいた。これらの遺伝子は他のAcidobacteriumに存在せず,他の試験株においてメチル化BHPの不在と一致した。これらのデータは,Alpha-,Beta-,およびGammaproteobacteriaおよび藍藻類のような他の細菌門におけるメチル化BHPの散乱発生と一致しており,それらのバイオマーカーの可能性を制限している。ホパノイド生合成に必要な遺伝子の存在について,Acidobacteriaのメタゲノムも調べた。BHP生合成の完全な経路は,SD2 AcidobacteriaとSD1とSD3に系統発生的に関連するグループにおいて明らかであり,酸性細菌培養におけるBHPの限られた発生と一致した。Copyright 2018 The Author(s). All rights reserved. Translated from English into Japanese by JST.【JST・京大機械翻訳】

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微生物の生化学 , 代謝と栄養

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