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J-GLOBAL ID：201802249261106554   整理番号：18A0718222

1H NMR代謝ミクスデータ前処理のためのPEPSNMR【JST・京大機械翻訳】

PepsNMR for ¹H NMR metabolomic data pre-processing

著者 (9件)： Martin Manon (Institute of Statistics, Biostatistics and Actuarial Sciences (ISBA/IMMAQ), Universite catholique de Louvain (UCL), Louvain-la-Neuve, Belgium) ,  Legat Benoit (Ecole Polytechnique de Louvain (EPL), Universite catholique de Louvain (UCL), Louvain-la-Neuve, Belgium) ,  Leenders Justine (Laboratoire de Chimie Pharmaceutique, Universite de Liege (ULg), Liege 1, Belgium) ,  Vanwinsberghe Julien (Universite Louis Pasteur, Strasbourg I, France) ,  Rousseau Rejane (Institute of Statistics, Biostatistics and Actuarial Sciences (ISBA/IMMAQ), Universite catholique de Louvain (UCL), Louvain-la-Neuve, Belgium) ,  Boulanger Bruno (Eli Lilly & Company, Statistical Department, Mont-St-Guibert, Belgium) ,  Eilers Paul H.C. (Department of Biostatistics, Erasmus University Medical Centre, Rotterdam, The Netherlands) ,  De Tullio Pascal (Laboratoire de Chimie Pharmaceutique, Universite de Liege (ULg), Liege 1, Belgium) ,  Govaerts Bernadette (Institute of Statistics, Biostatistics and Actuarial Sciences (ISBA/IMMAQ), Universite catholique de Louvain (UCL), Louvain-la-Neuve, Belgium)
資料名： Analytica Chimica Acta  (Analytica Chimica Acta)
巻： 1019  ページ： 1-13  発行年： 2018年 
JST資料番号： A0394A  ISSN： 0003-2670  資料種別： 逐次刊行物 (A)
記事区分： 原著論文  発行国： オランダ (NLD)  言語： 英語 (EN)

抄録/ポイント： 生物学的試料の分析において,実験計画とデータ収集手順のみの制御は,データ解析のための最大情報回収を伴う良く調整された1H NMRスペクトルを保証することができない。第3の主要要素は,結果の精度とロバスト性に影響を及ぼす。すなわち,特に代謝研究において,十分な注意を払わないデータ前処理/前処理が一般的に行われている。通常のアプローチは,全体の前処理戦略を実施するために,分析機器メーカーによって提供される固有のソフトウェアを使用することである。この広範な実践は,グラフィカルな施設を持つユーザに優しいインタフェイスのような多くの利点を持つが,非無視できる欠点を含む:方法論的情報と自動化の欠如,主観的な人間の選択の依存性,標準的な処理可能性と前処理品質を評価する客観的品質基準の欠如。本論文では,これらのニーズを満たすためにPepsNMRを導入し,他のツール,溶媒信号抑制,内部キャリブレーション,位相,ベースラインおよびミスアラインメント補正,バケット化および正規化のような,多変量データ解析に先立つ全処理チェーンに専用のRパッケージを紹介した。方法論的側面を議論し,パッケージを2つのメタボロミクス事例研究による金標準手順と比較した。これらのデータに関するPepsNMRの使用は,目的と定量的品質基準に基づくより良い情報回収と予測力を示した。パッケージの他のキー資産は,ワークフロー処理速度,再現性,報告と柔軟性,グラフィック出力と文書化ルーチンである。Copyright 2018 Elsevier B.V., Amsterdam. All rights reserved. Translated from English into Japanese by JST.【JST・京大機械翻訳】

シソーラス用語： ソフトウェア ,  ロバスト性 ,  品質基準 ,  分析機器 ,  データ収集 ,  インタフェイス ,  自動化 ,  実験計画法 ,  事例研究 ,  *前処理 ,  生体試料 ,  データ解析 ,  品質 ,  *陽子磁気共鳴
準シソーラス用語： *データ前処理 , 【Automatic Indexing@JST】

著者キーワード (5件)： 1H核磁気共鳴 ,  データ前処理 ,  Rパッケージ ,  メタボロミクス ,  前処理品質評価

分類 (2件)： 分析化学一般  (CC02010H) ,  有機化合物の各種分析  (CC08034J)

タイトルに関連する用語 (4件)： NMR ,  代謝 ,  ミクス ,  データ前処理