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J-GLOBAL ID：201802249321703213   整理番号：18A2030555

大効果遺伝子座は伝染性癌に感染したタスマニアのDevils(Sarcophilus harrisii)における生存に影響する【JST・京大機械翻訳】

Large-effect loci affect survival in Tasmanian devils (Sarcophilus harrisii) infected with a transmissible cancer

著者 (21件)： Margres Mark J. (School of Biological Sciences, Washington State University, Pullman, Washington) ,  Jones Menna E. (School of Zoology, University of Tasmania, Hobart, Tasmania, Australia) ,  Epstein Brendan (School of Biological Sciences, Washington State University, Pullman, Washington) ,  Kerlin Douglas H. (School of Environment, Griffith University, Nathan, Queensland, Australia) ,  Comte Sebastien (School of Zoology, University of Tasmania, Hobart, Tasmania, Australia) ,  Fox Samantha (Save the Tasmanian Devil Program, Department of Primary Industries, Parks, Water and Environment, Hobart, Tasmania, Australia) ,  Fraik Alexandra K. (School of Biological Sciences, Washington State University, Pullman, Washington) ,  Hendricks Sarah A. (Department of Biological Sciences, Institute for Bioinformatics and Evolutionary Studies, University of Idaho, Moscow, Idaho) ,  Huxtable Stewart (Save the Tasmanian Devil Program, Department of Primary Industries, Parks, Water and Environment, Hobart, Tasmania, Australia) ,  Lachish Shelly (Department of Zoology, University of Oxford, Oxford, UK) ,  Lazenby Billie (Save the Tasmanian Devil Program, Department of Primary Industries, Parks, Water and Environment, Hobart, Tasmania, Australia) ,  O’Rourke Sean M. (Department of Animal Science, University of California, Davis, Davis, California) ,  Stahlke Amanda R. (Department of Biological Sciences, Institute for Bioinformatics and Evolutionary Studies, University of Idaho, Moscow, Idaho) ,  Wiench Cody G. (Department of Biological Sciences, Institute for Bioinformatics and Evolutionary Studies, University of Idaho, Moscow, Idaho) ,  Hamede Rodrigo (School of Zoology, University of Tasmania, Hobart, Tasmania, Australia) ,  Hamede Rodrigo (Centre for Integrative Ecology, Deakin University, Waurn Ponds, Victoria, Australia) ,  Schonfeld Barbara (School of Zoology, University of Tasmania, Hobart, Tasmania, Australia) ,  McCallum Hamish (School of Environment, Griffith University, Nathan, Queensland, Australia) ,  Miller Michael R. (Department of Animal Science, University of California, Davis, Davis, California) ,  Hohenlohe Paul A. (Department of Biological Sciences, Institute for Bioinformatics and Evolutionary Studies, University of Idaho, Moscow, Idaho) ,  Storfer Andrew (School of Biological Sciences, Washington State University, Pullman, Washington)
資料名： Molecular Ecology  (Molecular Ecology)
巻： 27  号： 21  ページ： 4189-4199  発行年： 2018年 
JST資料番号： W2684A  ISSN： 0962-1083  資料種別： 逐次刊行物 (A)
記事区分： 原著論文  発行国： アメリカ合衆国 (USA)  言語： 英語 (EN)

抄録/ポイント： 複雑な表現型の遺伝的構造を同定することは,現代の生物学,特に疾患関連形質の中心的な目標である。ゲノムワイド関連法は疾患表現型の変異のゲノム基盤を同定するための古典的アプローチであるが,そのような分析は試料サイズの困難さのために自然個体群において特に挑戦的である。大規模な市場再構築データ,強い連鎖不平衡および致死的な伝染性癌は,そのような関連研究のための理想的なモデルであるTasmanian devil(Sarcco harrisii)を作る。著者らは,16,000の遺伝子座における遺伝子型624に対するRAD捕獲アプローチを用いて,3つの癌関連表現型の遺伝率を評価するために関連分析を使用した。感染症例対照(症例は感染しなかった),最初の感染の年齢および感染後の生存である。SNP配列は,雌の生存(>80%)および雌の症例対照(>61%)に対する表現型分散の多くを説明した。著者らは,いくつかの大きな影響SNPが雌の生存のための分散の多くを説明することを見出した(5SNPは全分散の61%を説明した)。一方,より小さい影響のより多くのSNP(56)は女性の症例対照(全分散の~23%)の分散をより少なく説明した。対照的に,これらの同じSNPは雄における表現型分散の有意な割合を説明せず,これらの形質および/または選択の遺伝的基礎が雌雄にわたって異なることを示唆した。細胞接着と細胞周期調節に関与する遺伝子座は,形質変化を強調し,これらの経路を通して癌増殖を認識し,潜在的に抑制するために,逸脱免疫系が急速に進化していることを示唆している。全体として,著者らの研究は,Tasmanian devilsにおけるゲノムに基づく保全と管理のための必要なデータを提供した。Copyright 2018 Wiley Publishing Japan K.K. All rights reserved. Translated from English into Japanese by JST.【JST・京大機械翻訳】

シソーラス用語： 再構成 ,  女性 ,  表現型 ,  捕獲 ,  *感染 ,  ゲノム ,  *遺伝 ,  ゲノムワイド関連解析 ,  個体群 ,  *タスマニア州 ,  細胞接着 ,  遺伝子型 ,  高速度 ,  遺伝率
準シソーラス用語： 連鎖不平衡 , 【Automatic Indexing@JST】

著者キーワード (5件)： 適応 ,  癌 ,  効果サイズ ,  遺伝子型表現型 ,  GWAS

分類 (2件)： 遺伝的変異  (EC01030Y) ,  分子・遺伝情報処理  (JE15040B)

タイトルに関連する用語 (6件)： 遺伝子座 ,  伝染 ,  癌 ,  感染 ,  タスマニア ,  生存