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J-GLOBAL ID：201802249390666107   整理番号：18A2004940

3つのAgave種における新しいサテライト様DNAファミリーの同定と特性化【JST・京大機械翻訳】

Identification and characterization of a new satellite-like DNA family in three Agave species

著者 (4件)： Espinosa-Barrera L.A. (Centro de Investigacion Cientifica de Yucatan, A.C. Calle 43 No. 130, Col. Chuburna de Hidalgo, C.P. 97200, Merida, Yucatan, Mexico) ,  Sanchez-Teyer L.F. (Centro de Investigacion Cientifica de Yucatan, A.C. Calle 43 No. 130, Col. Chuburna de Hidalgo, C.P. 97200, Merida, Yucatan, Mexico) ,  Quiroz-Moreno A. (Centro de Investigacion Cientifica de Yucatan, A.C. Calle 43 No. 130, Col. Chuburna de Hidalgo, C.P. 97200, Merida, Yucatan, Mexico) ,  Narvaez-Zapata J.A. (Instituto Politecnico Nacional. Centro de Biotecnologia Genomica. Boulevard del Maestro s/n esq. Elias Pina, Col. Narciso Mendoza, C.P. 88710 Cd., Reynosa, Tamaulipas, Mexico)
資料名： Plant Gene  (Plant Gene)
巻： 16  ページ： 8-18  発行年： 2018年 
JST資料番号： W3471A  ISSN： 2352-4073  資料種別： 逐次刊行物 (A)
記事区分： 原著論文  発行国： オランダ (NLD)  言語： 英語 (EN)

抄録/ポイント： 反復DNA分析を,3つのAned種(A.angustifolia Haworth,A.tequilana WeberおよびA.fourroydes Lemaire)において実施した。自己プライミングPCRを最初に反復PCR産物を生成するために使用し,それらの配列情報を用いて異なるプライマーセットを構築した。ATSAT102-113プライマーセットは,分析した全てのAned系統において典型的なラダープロファイルになることなくおそらく多量体を含む反復PCR産物を増幅することができた。これらの増幅の配列分析は,6つの保存された短いモチーフを共有するが,それらの間に高い遺伝的距離と異なる配列特性を示す反復DNAの2つのサブファミリーを同定した。得られたコンセンサス単量体は100bp以上の長さを持ち,植物の多くのサテライトとしてAdenine/Thymine比率が豊富である。これらのコンセンサス単量体の代表的プローブは,いくつかのPCR増幅産物においてハイブリッド化することができ,より頻繁な短モチーフ1(CTYRAGTTSG)も典型的なラダープロファイルになることなくおそらく多量体を示す。これらのAは異なる均質化率を有し,サブファミリー2はより保存されていた。これらのサテライト様単量体は転写され,LTR/GypsyファミリーとA.tequilana TSA配列の転移性要素特徴との強い関係を示し,いくつかは異なる位置にトランスポゾン関連ドメインを示し,サテライト様配列が同定された。これらのサテライト様サブファミリーの魚分析は,二倍体(A.angustifolia Haworth var.marginataおよびA.tequilana Weber’Azul’)系統において信頼性が高いと考えられる。これらにおいて,一般的に,より少ない間質シグナルを伴うサブテロメアのハイブリダイゼーションが示された。Copyright 2018 Elsevier B.V., Amsterdam. All rights reserved. Translated from English into Japanese by JST.【JST・京大機械翻訳】

シソーラス用語： 間質組織 ,  *キャラクタリゼーション ,  PCR法 ,  分子ハイブリダイゼーション ,  均質化 ,  トランスポゾン ,  プローブ ,  *DNA【核酸】 ,  単量体 ,  二倍体 ,  多量体 ,  *リュウゼツラン属
準シソーラス用語： ドメイン構造 ,  配列解析 ,  DNA反復配列 , 【Automatic Indexing@JST】

著者キーワード (5件)： DNAサテライト ,  AGAVE ,  短いモチーフ ,  魚 ,  転移性要素

分類 (2件)： 遺伝子の構造と化学  (EC02020U) ,  遺伝子操作  (EC02050B)

タイトルに関連する用語 (6件)： Agave ,  サテライト ,  DNA ,  ファミリー ,  同定 ,  特性化