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J-GLOBAL ID：201802249467303906   整理番号：18A0583242

比較ゲノム解析はLegionella pneumophila亜種の複雑な集団構造を明らかにする【Powered by NICT】

Comparative genome analysis reveals a complex population structure of Legionella pneumophila subspecies

著者 (10件)： Kozak-Muiznieks Natalia A. (Division of Bacterial Diseases, National Center for Immunization and Respiratory Diseases, Centers for Disease Control and Prevention, Atlanta, GA, United States) ,  Morrison Shatavia S. (Division of Bacterial Diseases, National Center for Immunization and Respiratory Diseases, Centers for Disease Control and Prevention, Atlanta, GA, United States) ,  Mercante Jeffrey W. (Division of Bacterial Diseases, National Center for Immunization and Respiratory Diseases, Centers for Disease Control and Prevention, Atlanta, GA, United States) ,  Ishaq Maliha K. (Division of Bacterial Diseases, National Center for Immunization and Respiratory Diseases, Centers for Disease Control and Prevention, Atlanta, GA, United States) ,  Johnson Taccara (Division of Bacterial Diseases, National Center for Immunization and Respiratory Diseases, Centers for Disease Control and Prevention, Atlanta, GA, United States) ,  Caravas Jason (Division of Bacterial Diseases, National Center for Immunization and Respiratory Diseases, Centers for Disease Control and Prevention, Atlanta, GA, United States) ,  Lucas Claressa E. (Division of Bacterial Diseases, National Center for Immunization and Respiratory Diseases, Centers for Disease Control and Prevention, Atlanta, GA, United States) ,  Brown Ellen (Division of Bacterial Diseases, National Center for Immunization and Respiratory Diseases, Centers for Disease Control and Prevention, Atlanta, GA, United States) ,  Raphael Brian H. (Division of Bacterial Diseases, National Center for Immunization and Respiratory Diseases, Centers for Disease Control and Prevention, Atlanta, GA, United States) ,  Winchell Jonas M. (Division of Bacterial Diseases, National Center for Immunization and Respiratory Diseases, Centers for Disease Control and Prevention, Atlanta, GA, United States)
資料名： Infection, Genetics and Evolution  (Infection, Genetics and Evolution)
巻： 59  ページ： 172-185  発行年： 2018年 
JST資料番号： A1228A  ISSN： 1567-1348  資料種別： 逐次刊行物 (A)
記事区分： 原著論文  発行国： オランダ (NLD)  言語： 英語 (EN)

抄録/ポイント： レジオネラ症の大部分(LD)症例はLegionella pneumophila,少なくとも17血清型からなる遺伝的不均一種に起因する。以前,L.pneumophilaが,三つの亜種(pneumophila,fraseriとpasculleiから構成されていることを示した。2012におけるLD発生調査中に,両亜種fraseriとpasculleiの代表は同じ水系コロニーを形成し,発生原因株は最小表現亜種pasculleiの新しいメンバーであることを検出した。部分配列に基づくタイピングコンセンサスパターンを使用したfraseriとpascullei亜種の追加の代表の国際データベースをマイニングした。その結果,亜種pasculleiに属する亜種fraseriと二STに属する46配列型(STs)を同定した。さらに,ニューヨーク州LDクラスタからの分離菌の最近の遡及的全ゲノム配列解析は,raphaeliと命名した四L.pneumophila亜種の存在を明らかにした。亜種は,15台のSTのから構成されている。全四L.pneumophila亜種の複数メンバーのゲノムを用いて行った比較分析。各亜種はL.pneumophila種内の系統学的クレードを形成するが,他のLegionella種より互いにより平均ヌクレオチド同一性を共有する。各亜種のユニークな遺伝子を同定し,迅速亜種検出に使用できた。L.pneumophila株の改良された分類学的分類は,これらの遺伝的に異なる亜種に関連する環境ニッチと病原性属性を同定する助けになる。Copyright 2018 Elsevier B.V., Amsterdam. All rights reserved. Translated from English into Japanese by JST.【Powered by NICT】

シソーラス用語： レジオネラ症 ,  *Legionella ,  血清型 ,  クラスタ ,  ヌクレオチド ,  遺伝 ,  コロニー ,  データベース ,  病原性 ,  *ゲノム
準シソーラス用語： ニッチ ,  クレード ,  ゲノム配列 ,  分離菌 ,  *亜種 , 【Automatic Indexing@JST】

著者キーワード (4件)： Legionella pneumophila ,  レジオネラ症 ,  発生 ,  亜種

分類 (4件)： 微生物検査法  (EG02020G) ,  微生物学(ウイルス以外)一般  (EG03010C) ,  遺伝子の構造と化学  (EC02020U) ,  感染症・寄生虫症一般  (GD01010H)

タイトルに関連する用語 (5件)： 比較ゲノム ,  解析 ,  Legionella ,  亜種 ,  集団構造