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J-GLOBAL ID：201802249549734465   整理番号：18A0384728

水溶液オスモライト溶液中の蛋白質Trpケージ立体配座に及ぼす非極性閉じ込めの効果【Powered by NICT】

Effect of nonpolar confinement on protein Trp cage conformation in aqueous osmolyte solutions

著者 (2件)： Borgohain Gargi (Department of Chemistry, Indian Institute of Technology, Guwahati, Assam-781039, India) ,  Paul Sandip (Department of Chemistry, Indian Institute of Technology, Guwahati, Assam-781039, India)
資料名： Journal of Molecular Liquids  (Journal of Molecular Liquids)
巻： 231  ページ： 174-184  発行年： 2017年 
JST資料番号： B0924A  ISSN： 0167-7322  資料種別： 逐次刊行物 (A)
記事区分： 原著論文  発行国： オランダ (NLD)  言語： 英語 (EN)

抄録/ポイント： 本論文では,閉込めの影響を実証し,レプリカ交換分子動力学(REMD)シミュレーションを用いて蛋白質Trpケージの立体配座挙動に対する尿素およびトリメチルアミンN オキシド(TMAO)をosmolytes。蛋白質の折畳みにおけるシャペロニンの役割を模倣するために著者らは,2940個の炭素原子からなるほぼ球状非極性閉込めを用いた。尿素のカプセル封じ二成分溶液は蛋白質と良好な直接相互作用による蛋白質の変性効果を発揮した。蛋白質の疎水性コアは二元尿素溶液の存在下で完全に破壊した。三成分溶液では,二元尿素溶液のそれと比較した場合,TMAOの存在は蛋白質-尿素静電相互作用より不利である。尿素とTMAOのカプセル化された三成分溶液は閉込め無しのものに比べて蛋白質立体配座に対する良好な保護を提供した。閉込めは三元混合溶液に対してより顕著である蛋白質の立体配座空間を減少させた。閉込めは,閉込めのないものと比較して使用されている蛋白質の自由エネルギー景観は有意に修飾されることを観測した。Copyright 2018 Elsevier B.V., Amsterdam. All rights reserved. Translated from English into Japanese by JST.【Powered by NICT】

シソーラス用語： 混合液体 ,  自由エネルギー ,  分子動力学 ,  折畳み ,  *立体配座 ,  *水溶液 ,  静電相互作用 ,  酸化物 ,  *非極性 ,  *タンパク質 ,  疎水性 ,  ウレア化合物
準シソーラス用語： 蛋白質立体配座 ,  尿素水 ,  レプリカ交換 , 【Automatic Indexing@JST】

著者キーワード (5件)： 尿素 ,  TMAO ,  Trpケージ ,  閉込め ,  REMD

分類 (1件)： 分子構造  (EB03020Y)

物質索引 (1件)： 尿素

タイトルに関連する用語 (9件)： 水溶液 ,  オスモライト ,  溶液 ,  蛋白質 ,  TRP ,  ケージ ,  立体配座 ,  非極性 ,  閉じ込め