ダイズにおけるアルデヒドデヒドロゲナーゼ遺伝子スーパーファミリーのゲノムワイド特性化と乾燥ストレス応答におけるその潜在的役割【JST・京大機械翻訳】

Wang Wei; Jiang Wei; Liu Juge; Li Yang; Gai Junyi; Li Yan

文献

J-GLOBAL ID：201802249552235604 整理番号：18A0965804

ダイズにおけるアルデヒドデヒドロゲナーゼ遺伝子スーパーファミリーのゲノムワイド特性化と乾燥ストレス応答におけるその潜在的役割【JST・京大機械翻訳】

Genome-wide characterization of the aldehyde dehydrogenase gene superfamily in soybean and its potential role in drought stress response

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資料名：
巻： 18 号： 1 ページ： 518 発行年： 2017年
JST資料番号： U7048A ISSN： 1471-2164 資料種別：逐次刊行物 (A)
記事区分：原著論文発行国：イギリス (GBR) 言語：英語 (EN)

【背景】アルデヒド脱水素酵素(ALDH)は,カルボン酸への酸化を促進することによってアルデヒドを解毒する一群の酵素を表し,非生物的ストレスに対する植物応答において役割を果たすことが示されている。しかしながら,ダイズ(Glycine max)におけるALDHスーパーファミリーの包括的分析は限られている。【結果】本研究において,合計53のGmALDHをダイズにおいて同定し,ALDH遺伝子命名委員会および系統発生分析に従って,10のALDHファミリーに分類した。これらのグループはそれらの遺伝子構造と保存されたモチーフによって支持された。ダイズALDHスーパーファミリーは主に全ゲノム重複/分節重複により拡大した。遺伝子ネットワーク分析により,51のGmALDHの1146の推定共機能遺伝子を同定した。遺伝子オントロジー(GO)濃縮分析は,これら51GmALDHの共機能遺伝子が脂質代謝,光合成,プロリン異化および小分子異化の過程において濃縮されることを示唆した(FDR<1e-3)。加えて,GmALDHの22の共機能遺伝子は水枯渇/水輸送に対する植物応答に関連している。GmALDHは異なるダイズ組織において種々の発現パターンを示した。13のGmALDHの発現レベルは,水分欠乏に応じて有意に上方制御され,14は下方制御された。3つの乾燥応答性cis-エレメント(ABRE,CRT/DRE,およびGTGCnTGC/G)の発生頻度を,水欠乏によって上方,下方,または非制御のGmALDH遺伝子で比較した。これら3つのcis要素のより高い頻度は,干ばつストレスによるダウンまたは非調節GmALDHのグループと比較して,上方制御されたGmALDH遺伝子のグループで観察され,干ばつストレスに対するダイズ応答の調節におけるそれらの潜在的役割を意味した。【結論】合計53のALDH遺伝子をダイズゲノムにおいて同定し,それらの系統発生的関係と重複パターンを分析した。GmALDHの潜在的機能は,それらの共機能的遺伝子ネットワーク,遺伝子発現プロファイル,およびcis調節要素の分析によって予測された。GmALDH3H2,GmALDH12A2及びGmALDH18B3を含む3つのGmALDH遺伝子はダイズ葉の乾燥ストレスにより高度に誘導された。本研究はダイズにおけるGmALDH遺伝子機能の将来の研究の基礎を提供する。Copyright 2018 The Author(s). All rights reserved. Translated from English into Japanese by JST.【JST・京大機械翻訳】

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植物の生化学 , 豆類 , 酵素生理 , 植物生理学一般 , 進化論一般

引用文献 (86件)：

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