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J-GLOBAL ID：201802249970268387   整理番号：18A2213671

出芽酵母Subphylumにおけるゲノム進化のTEMPOとモード【JST・京大機械翻訳】

Tempo and Mode of Genome Evolution in the Budding Yeast Subphylum

著者 (34件)： Shen Xing-Xing (Department of Biological Sciences, Vanderbilt University, Nashville, TN 37235, USA) ,  Opulente Dana A. (Laboratory of Genetics, Genome Center of Wisconsin, Wisconsin Energy Institute, J.F. Crow Institute for the Study of Evolution, University of Wisconsin-Madison, Madison, WI 53706, USA) ,  Opulente Dana A. (DOE Great Lakes Bioenergy Research Center, University of Wisconsin-Madison, Madison, WI 53706, USA) ,  Kominek Jacek (Laboratory of Genetics, Genome Center of Wisconsin, Wisconsin Energy Institute, J.F. Crow Institute for the Study of Evolution, University of Wisconsin-Madison, Madison, WI 53706, USA) ,  Kominek Jacek (DOE Great Lakes Bioenergy Research Center, University of Wisconsin-Madison, Madison, WI 53706, USA) ,  Zhou Xiaofan (Department of Biological Sciences, Vanderbilt University, Nashville, TN 37235, USA) ,  Zhou Xiaofan (Guangdong Province Key Laboratory of Microbial Signals and Disease Control, Integrative Microbiology Research Centre, South China Agricultural University, 510642 Guangzhou, China) ,  Steenwyk Jacob L. (Department of Biological Sciences, Vanderbilt University, Nashville, TN 37235, USA) ,  Buh Kelly V. (Laboratory of Genetics, Genome Center of Wisconsin, Wisconsin Energy Institute, J.F. Crow Institute for the Study of Evolution, University of Wisconsin-Madison, Madison, WI 53706, USA) ,  Haase Max A.B. (Laboratory of Genetics, Genome Center of Wisconsin, Wisconsin Energy Institute, J.F. Crow Institute for the Study of Evolution, University of Wisconsin-Madison, Madison, WI 53706, USA) ,  Haase Max A.B. (DOE Great Lakes Bioenergy Research Center, University of Wisconsin-Madison, Madison, WI 53706, USA) ,  Haase Max A.B. (Sackler Institute of Graduate Biomedical Sciences, NYU School of Medicine, New York, NY 10016, USA) ,  Wisecaver Jennifer H. (Department of Biological Sciences, Vanderbilt University, Nashville, TN 37235, USA) ,  Wisecaver Jennifer H. (Department of Biochemistry, Center for Plant Biology, Purdue University, West Lafayette, IN 47907, USA) ,  Wang Mingshuang (Department of Biological Sciences, Vanderbilt University, Nashville, TN 37235, USA) ,  Doering Drew T. (Laboratory of Genetics, Genome Center of Wisconsin, Wisconsin Energy Institute, J.F. Crow Institute for the Study of Evolution, University of Wisconsin-Madison, Madison, WI 53706, USA) ,  Boudouris James T. (Laboratory of Genetics, Genome Center of Wisconsin, Wisconsin Energy Institute, J.F. Crow Institute for the Study of Evolution, University of Wisconsin-Madison, Madison, WI 53706, USA) ,  Schneider Rachel M. (Laboratory of Genetics, Genome Center of Wisconsin, Wisconsin Energy Institute, J.F. Crow Institute for the Study of Evolution, University of Wisconsin-Madison, Madison, WI 53706, USA) ,  Schneider Rachel M. (DOE Great Lakes Bioenergy Research Center, University of Wisconsin-Madison, Madison, WI 53706, USA) ,  Langdon Quinn K. (Laboratory of Genetics, Genome Center of Wisconsin, Wisconsin Energy Institute, J.F. Crow Institute for the Study of Evolution, University of Wisconsin-Madison, Madison, WI 53706, USA) ,  Ohkuma Moriya (Japan Collection of Microorganisms, RIKEN BioResource Research Center, Tsukuba, Ibaraki 305-0074, Japan) ,  Endoh Rikiya (Japan Collection of Microorganisms, RIKEN BioResource Research Center, Tsukuba, Ibaraki 305-0074, Japan) ,  Takashima Masako (Japan Collection of Microorganisms, RIKEN BioResource Research Center, Tsukuba, Ibaraki 305-0074, Japan) ,  Manabe Ri-ichiroh (Division of Genomic Technologies, RIKEN Center For Life Science Technologies, Laboratory for Comprehensive Genomic Analysis, RIKEN Center for Integrative Medical Sciences, Yokohama, Kanagawa 230-0045, Japan) ,  Cadez Neza (Biotechnical Faculty, University of Ljubljana, 1000 Ljubljana, Slovenia) ,  Libkind Diego (Laboratorio de Microbiologia Aplicada y Biotecnologia, Instituto Andino Patagonico de Tecnologias Biologicas y Geoambientales (IPATEC), Consejo Nacional de Investigaciones, Cientificas y Tecnicas (CONICET)-Universidad Nacional del Comahue, 8400 Bariloche, Argentina) ,  Rosa Carlos A. (Departamento de Microbiologia, ICB, CP 486, Universidade Federal de Minas Gerais, Belo Horizonte, MG, 31270-901, Brazil) ,  DeVirgilio Jeremy (Mycotoxin Prevention and Applied Microbiology Research Unit, National Center for Agricultural Utilization Research, Agricultural Research Service, U.S. Department of Agriculture, Peoria, IL 61604, USA) ,  Hulfachor Amanda Beth (Laboratory of Genetics, Genome Center of Wisconsin, Wisconsin Energy Institute, J.F. Crow Institute for the Study of Evolution, University of Wisconsin-Madison, Madison, WI 53706, USA) ,  Groenewald Marizeth (Westerdijk Fungal Biodiversity Institute, 3584 CT, Utrecht, the Netherlands) ,  Kurtzman Cletus P. (Mycotoxin Prevention and Applied Microbiology Research Unit, National Center for Agricultural Utilization Research, Agricultural Research Service, U.S. Department of Agriculture, Peoria, IL 61604, USA) ,  Hittinger Chris Todd (Laboratory of Genetics, Genome Center of Wisconsin, Wisconsin Energy Institute, J.F. Crow Institute for the Study of Evolution, University of Wisconsin-Madison, Madison, WI 53706, USA) ,  Hittinger Chris Todd (DOE Great Lakes Bioenergy Research Center, University of Wisconsin-Madison, Madison, WI 53706, USA) ,  Rokas Antonis (Department of Biological Sciences, Vanderbilt University, Nashville, TN 37235, USA)
資料名： Cell (Cambridge, Mass.)  (Cell (Cambridge, Mass.))
巻： 175  号： 6  ページ： 1533-1545.e20  発行年： 2018年 
JST資料番号： A0707B  ISSN： 0092-8674  資料種別： 逐次刊行物 (A)
記事区分： 原著論文  発行国： アメリカ合衆国 (USA)  言語： 英語 (EN)

抄録/ポイント： 出芽酵母(亜門Sacomycotina)はあらゆる生物において見出され,植物または動物として遺伝的に多様である。出芽酵母進化を理解するために,著者らは,既知の出芽酵母多様性のほぼ1/3を代表する220の新しく配列決定されたものを含む332の酵母種のゲノムを分析した。ここでは,12の主要クレードから成るロバストな遺伝子レベルの系統発生を確立し,Devonian期から現在までの多様化の時間スケールを推論し,水平遺伝子移動(HGT)を定量化し,出芽酵母共通祖先(BYCA)の45代謝形質と代謝ツールキットの進化を再構築した。BYCAは代謝的に複雑で,サブ門を横切るゲノムと表現型進化のテンポとモードを慢性化し,それらは非常に低いHGTレベルとそれらを制御する形質と遺伝子の広範な損失により特徴付けられると推論した。より一般的に,著者らの結果は,還元的進化が進化的多様化の主要なモードであると主張する。Copyright 2019 Elsevier B.V., Amsterdam. All rights reserved. Translated from English into Japanese by JST.【JST・京大機械翻訳】

シソーラス用語： 遺伝子 ,  遺伝 ,  系統発生 ,  多様化 ,  再構成 ,  ロバスト性 ,  *Saccharomyces cerevisiae ,  動物 ,  表現型 ,  *酵母 ,  代謝 ,  *ゲノム
準シソーラス用語： ゲノミクス ,  ツールキット ,  クレード , 【Automatic Indexing@JST】

著者キーワード (10件)： 子嚢菌 ,  Saccharomycotina ,  ハイスループットシークエンシング ,  ゲノミクス ,  系統学 ,  系統ゲノミクス ,  分子年代測定 ,  水平遺伝子導入 ,  代謝形質 ,  還元的進化

分類 (4件)： 遺伝子発現  (EC02040Q) ,  分子遺伝学一般  (EC02010J) ,  基礎腫よう学一般  (GE02010R) ,  遺伝学研究法  (EC01020N)

タイトルに関連する用語 (3件)： 出芽酵母 ,  ゲノム進化 ,  TEMPO