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J-GLOBAL ID：201802250188208063   整理番号：18A0975182

VIM遺伝子カセットを持つ新規IN1059の特性化【JST・京大機械翻訳】

Characterization of the novel In1059 harbouring VIM gene cassette

著者 (8件)： Wang Dongguo (Department of Clinical Laboratory Medicine, Taizhou Municipal Hospital affiliated with Taizhou University and the Institute of Molecular Diagnostics of Taizhou University, Taizhou, China) ,  Yang Jinhong (Department of Clinical Laboratory Medicine, the Second Affiliated Hospital and Yuying Children’s Hospital of Wenzhou Medical University, Wenzhou, China) ,  Fang Meiyu (Department of Clinical Laboratory Medicine, Hangzhou First People’s Hospital of Nanjing Medical University, Hangzhou, China) ,  He Wei (Department of Clinical Laboratory Medicine, Wenzhou Hospital of Integrated Traditional Chinese and Western Medicine, Wenzhou, China) ,  Zhang Ying (Department of Clinical Laboratory Medicine, Wenzhou Hospital of Integrated Traditional Chinese and Western Medicine, Wenzhou, China) ,  Liu Caixia (Department of Clinical Laboratory Medicine, the Second Affiliated Hospital and Yuying Children’s Hospital of Wenzhou Medical University, Wenzhou, China) ,  Zhou Dongsheng (State Key Laboratory of Pathogen and Biosecurity, Beijing Institute of Microbiology and Epidemiology, Beijing, China) ,  Zhou Dongsheng (Department of Clinical Laboratory Medicine, Taizhou Municipal Hospital affiliated with Taizhou University and the Institute of Molecular Diagnostics of Taizhou University, Taizhou, China)
資料名： Antimicrobial Resistance & Infection Control (Web)  (Antimicrobial Resistance & Infection Control (Web))
巻： 6  号： 1  ページ： 50  発行年： 2017年 
JST資料番号： U7299A  ISSN： 2047-2994  資料種別： 逐次刊行物 (A)
記事区分： 原著論文  発行国： イギリス (GBR)  言語： 英語 (EN)

抄録/ポイント： 【背景】VIM型酵素はグラム陰性菌において最も広く獲得されたメタロ-β-ラクタマーゼをコードする。病院における腸内細菌からのインテグロンの現在の疫学的データを得るために,本研究では,IIM遺伝子を含むIn846インテグロンおよびIn37,In62,In843およびIn1021を含む他のクラス1インテグロンとの比較により,関連するインテグロンの進化を推定することを目的として,In1059の遺伝子構造を特性化した。【方法】臨床株からの69の組換えプラスミドのうちの6つは,BamHIによる消化,薬剤感受性試験,接合実験,PCR増幅,インテグロンクローニングと配列決定,ゲノム比較,およびカルバペネマーゼ活性の検出によってクラス1インテグロンであることがわかった。【結果】In1021,In843,In846,In37,in62,および新規In1059インテグロンをコードする6つの組換えプラスミドの配列は,それぞれ約4.8,4.1,5.1,5.3,5.3および6.6kbの近似長を有した。これらのインテグロンの遺伝的構造をマッピングし,特性化し,それらの親株のカルバペネム活性を評価した。【結論】著者らの結果は,遺伝子カセットに存在する6つの可変インテグロン構造と規則的変異が,インテグロン変化のための推定機構を提供することを示唆する。著者らの研究はまた,臨床設定における抗生物質選択圧の下でのクラス1インテグロン変異の段階的で平行な進化を含むスキームの中で,上記のインテグロンにおける遺伝的特徴が転倒していることを示した。Copyright 2018 The Author(s). All rights reserved. Translated from English into Japanese by JST.【JST・京大機械翻訳】

シソーラス用語： 酵素 ,  病院 ,  ゲノム ,  グラム陰性菌 ,  変異 ,  プラスミド ,  *遺伝 ,  *キャラクタリゼーション ,  PCR法 ,  疫学 ,  抗生物質
準シソーラス用語： クラス1インテグロン ,  インテグロン ,  腸内細菌 ,  *遺伝子カセット , 【Automatic Indexing@JST】

著者キーワード (6件)： 新しいインテグロン ,  IN1059 ,  プラスミド消化 ,  クローニング ,  移動推論 ,  進化

分類 (3件)： 遺伝子の構造と化学  (EC02020U) ,  微生物生理一般  (EG03051L) ,  分子遺伝学一般  (EC02010J)

引用文献 (40件)：

• Gene cassettes and integrons: moving single genes. In: Syvanen M, Kado CI, editors. Horizontal gene transfer; RM Hall; Academic Press; 2002; CR1;
• J Infect Dis; Multidrug resistance among Enterobacteriaceae is strongly associated with the presence of integrons and is independent of species or isolate origin; MA Leverstein-van Hall, HE M Blok, AR T Donders, A Paauw, AC Fluit, J Verhoef; 187; 2003; 251-259; 10.1086/345880; CR2;
• Clin Microbiol Infect; Dissemination of multidrug-resistant, class 1 integron-carrying Acinetobacter baumannii isolates in Taiwan; L-Y Huang, T-L Chen, P-L Lu, C-A Tsai, W-L Cho, F-Y Chang; 14; 2008; 1010-1019; 10.1111/j.1469-0691.2008.02077.x; CR3;
• FEMS Microbiol Rev; Gene cassettes and cassette arrays inmobile resistance integrons; SR Partridge, G Tsafnat, E Coiera, JR Iredell; 33; 2009; 757-784; 10.1111/j.1574-6976.2009.00175.x; CR4;
• Nat Rev Microbiol; Integrons: agents of bacterial evolution; D Mazel; 4; 2006; 608-620; 10.1038/nrmicro1462; CR5;

タイトルに関連する用語 (3件)： Vim ,  遺伝子カセット ,  特性化